多発家系を基盤にした単・少・多因子疾患関連遺伝子の探索

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 17019055
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 北海道医療大学 (2007-2009); 長崎大学 (2005-2006)
• 研究代表者: 新川 詔夫 北海道医療大学, 個体差健康科学研究所, 教授 (00111170)
• 研究分担者: 太田 亨 北海道医療大学, 個体差健康科学研究所, 准教授 (10223835) ; 木下 晃 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (60372778) ; 吉浦 孝一郎 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (00304931) ; 三輪 晋智 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (30419626)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2009
• キーワード: 染色体異常 / 疾患遺伝子 / 連鎖解析 / 単因子疾患 / 多因子疾患 / 関連解析 / 疾患感受性遺伝子

研究概要

国内外の単・寡少・多因子疾患罹患家系を集積し、ゲノム医科学手法によって疾患関連遺伝子の単離・同定を行った。研究期間内に、耳垢型(乳癌関連)および先天性白内障の原因遺伝子を単離・同定し、家族性日本熱、裂手裂足症、先天性爪欠損症ではその候補遺伝子を同定し、家族性原発性手掌多汗症、家族性眼瞼下垂症、軟口蓋裂、家族性動静脈奇形、発作性運動誘発性コレオアテトーシス、デュプイトラン拘縮症では疾患遺伝子座をマップし、さらに家族性心房中核欠損症では候補遺伝子における解析で変異を同定した。歌舞伎症候群、無鼻症、2型糖尿病では染色体構造異常の切断点解析を基に、核型正常の患者における変異解析を行ったが、病的変異は見いだせなかった。

研究成果

• [雑誌論文] Japanese map of the earwax gene frequency: a nation-wide collaborative study by Super Science High School (SSH) Consortium. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshiura K, Kinoshita A, Ohta T, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 54 ページ: 499-503
  • 査読あり
• [雑誌論文] Earwax, osmidrosis, and breast cancer: Why does one SNP (538G>A) in the human ABC transporter ABCC11 gene determine earwax type? (2009)
  • 著者名/発表者名: Toyoda Y, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: FASEB J 23(6) ページ: 2001-2013
  • 査読あり
• [雑誌論文] A ZRS duplication causes syndactyly type IV with tibial hypoplasia. (2009)
  • 著者名/発表者名: Wu L, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 149A(4) ページ: 816-818
  • 査読あり
• [雑誌論文] No mutation in RAS-MAPK pathway genes in 30 patients with Kabuki syndrome. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuniba H, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 146A ページ: 1893-1896
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Down syndrome girl with partial trisomy for 21pter-q22. 13: A clue to narrow the Down syndrome critical region. (2008)
  • 著者名/発表者名: Sato D, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 146A(1) ページ: 124-127
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide linkage analysis and mutation analysis of hereditary congenital blepharoptosis in a Japanese family. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 53(1) ページ: 34-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lack of C20orf133 and FLRT3 mutations in 43 patients with Kabuki syndrome in Japan. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuniba H, Kinoshita A, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Med Genet 45(7) ページ: 479-480
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular analysis of hearing loss associated with enlarged vestibular aqueduct in the mainland Chinese: A unique SLC26A4 mutation spectrum. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hu H, Niikawa N, Xia JH, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 52 ページ: 492-497
  • 査読あり
• [雑誌論文] A strong association between human earwax-type and apocrine colostrum secretion from the mammary gland. (2007)
  • 著者名/発表者名: Miura K, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Hum Genet 121(5) ページ: 631-633
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paroxysmal kinesigenic choreoathetosis (PKC): Confirmation of linkage of to 16p11-q21 but unsuccessful detection of mutations among 158 genes at the PKC-critical region in seven PKC families. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi, T., Yoshiura K., Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 52 ページ: 334-341
  • 査読あり
• [雑誌論文] Congenital arhinia: Molecular-genetic analysis of five patients. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sato D, Kinoshita A, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 143A ページ: 546-552
  • 査読あり
• [雑誌論文] Opitz C (trigonocephaly) syndrome caused by deficiency of a member of the immunoglobulin superfamily, CD96. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 81(4) ページ: 835-841
  • 査読あり
• [雑誌論文] CHMP4B, a novel gene for autosomal dominant cataracts linked to chromosome 20q. (2007)
  • 著者名/発表者名: Shiels A, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 81(3) ページ: 596-606
  • 査読あり
• [雑誌論文] A syndactyly type IV locus maps to 7q36. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sato D, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 52(6) ページ: 561-564
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative SAR analysis and molecular dynamics simulation to functionally validate nonsynonymous polymorphisms of human ABC transporter ABCB1. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sakurai A, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Biochem 46(26) ページ: 7678-7693
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origin and mechanisms of formation of fetus-in-fetu: Two cases with genotype and methylation analyses. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miura, S., Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(16) ページ: 1737-1743
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microarray comparative genomic hybridization (CGH)-based prenatal diagnosis for chromosome abnormalities using cell-free fetal DNA in amniotic fluid. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miura, S., Yoshiura K., Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 51 ページ: 412-417
  • 査読あり
• [雑誌論文] A father and son with mental retardation, a characteristic face inv(12), and insertion trisomy 12p12. 3-p11. 2. (2006)
  • 著者名/発表者名: Liang D, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A ページ: 238-244
  • 査読あり
• [雑誌論文] A primary palmar hyperhidrosis locus maps to 14q11. 2-q13. (2006)
  • 著者名/発表者名: Higashimoto I, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(6) ページ: 567-572
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of the NSD1 promoter region in patients with a Sotos syndrome phenotype. (2006)
  • 著者名/発表者名: Visser R, Hasegawa T, Niikawa N, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(1) ページ: 15-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] SNP in the ABCC11 gene is the determinant of human earwax type. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yoshiura K, Kinoshita A, Ohta T, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Nat Genet 38 ページ: 324-330
  • 査読あり
• [雑誌論文] PAX9 and TGFB3 are susceptible to nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in the Japanese: Population-based and family-based candidate gene analyses. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa E, Kinoshita A, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(1) ページ: 38-46
  • 査読あり
• [雑誌論文] No detectable genomic aberrations by BAC array CGH in Kabuki make-up syndrome patients. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Yoshiura K, Ohta T, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A ページ: 291-293
  • 査読あり
• [雑誌論文] BAC array CGH reveals genomic aberrations in idiopathic mental retardation. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Yoshiura K, Ohta T, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A ページ: 205-211
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-hotspot-related breakpoints of common deletions in Sotos syndrome are located within destabilized DNA regions. (2005)
  • 著者名/発表者名: Visser R, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: J Med Genet 42(11) ページ: e66
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization of del(8)(p23. 1p23. 1) in a case of congenital diaphragmatic hernia. (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimokawa O, Ohta T, Kinoshita A, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 136A ページ: 49-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] A large deletion involving the 5'-UTR in the spastin gene caused mild phenotype of autosomal dominant hereditary spastic paraplegia. (2005)
  • 著者名/発表者名: Iwanaga H, Niikawa N, Yoshiura K, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet A133 ページ: 13-17
  • 査読あり
• [雑誌論文] Four novel NIPBL mutations in Japanese patients with Cornelia de Lange syndrome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Kinoshita A, Yoshiura K, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet 135A ページ: 103-105
  • 査読あり
• [雑誌論文] Do monochorionic dizygotic twins increase after pregnancy by assisted reproductive technology? (2005)
  • 著者名/発表者名: Miura K, Niikawa N
  • 雑誌名: J Hum Genet 50(1) ページ: 1-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a 3. 0-kb major recombination hotspot in patients with Sotos syndrome who carry a common 1. 9-Mb microdeletion. (2005)
  • 著者名/発表者名: Visser R, Kinoshita A, Ohta T, Niikawa N, et al
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 76(1) ページ: 52-67
  • 査読あり
• [図書] Sotos syndrome.(Encyclopedia of Life Sciences) (2008)
  • 著者名/発表者名: Niikawa N, Miyake N, Matsumoto N
  • 総ページ数: 1-8
  • 出版者: Wiley & Sons
• [備考] 朝日新聞(朝刊)平成19年9月17日
• [備考] 読売新聞(朝刊)平成19年9月18日
• [備考] 産経新聞(朝刊)平成20年8月4日
• [備考] 日本経済新聞(朝刊)平成21年7月18日
• [産業財産権] 耳垢型又は腋下臭症の評価方法 (2007)
  • 発明者名: 新川詔夫、吉浦孝一郎
  • 権利者名: 長崎大学
  • 産業財産権番号: 国際特許出願・PCT/JP2006/312673
  • 出願年月日: 2007-12-14