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急性骨髄性白血病を中心とした造血器悪性腫瘍の病態解明・分子予後マーカーの同定を目指して、患者骨髄よりCD133陽性造血幹細胞分画のみを純化保存する大規模バンク事業を行った。これらのサンプルにおいてがん遺伝子を直接同定する目的で、約900万塩基対を直接配列決定可能な大型シークエンスアレイを開発し、それを用いて白血病芽球における約5400遺伝子のコーディングエクソンの配列決定を行った。その結果約1万種類の遺伝子の配列変異を同定し、さらにそれを同じ患者の健常分画と比較することで後天的変異(体細胞変異)のみに絞り込むことに成功した。こうして得られた配列異常の中には直接がん化能を有する活性型JAK3キナーゼ変異が存在しており、我々は新たな急性骨髄性自血病原因遺伝子を同定することに成功した。さらに上記体細胞変異の中にはゲノムメチル化酵素であるDNMT3Aのhypomorphic変異も存在していた。これはヒトがん細胞における初めてのDNAメチル化酵素体細胞異常である。さらに我々は10ng程度のRNAから同定を可能にする高感度クローニング法microRNA Amplification Profiling(mRAP)を開発し、さらにそれを次世代シークエンサーで直接解析するmRAP-IGA法を成功させた。
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