疾患遺伝子探索の方法論の開発

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 17019063
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: 猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
• 研究分担者: 間野 修平 名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (20372948)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2009
• キーワード: 相関解析 / マイクロサテライト / 多因子疾患 / 同祖性 / 連鎖解析 / 酵母ツーハイブリッド / ネットワーク / ゲノム創薬

研究概要

生活習慣病をはじめとする多因子疾患の感受性遺伝子を同定する方法として30,000個のマイクロサテライトを用いたゲノムワイドな相関解析法と事後同祖性による集団を用いた連鎖解析法を開発し、30以上感受性遺伝子を同定した。これらの感受性遺伝子の創薬に向けての機能解析として、in silicoネットワーク解析と新酵母ツーハイブリッド法の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Detecting linkage between a trait and a marker in a random mating population without pedigree record. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mano S, Endo TA, Oka A, Ozawa A, Gojobori T, Inoko H
  • 雑誌名: PLoS ONE 4 ページ: e4956
• [雑誌論文] A genome-wide association scan for asthma in a general Australian population. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hui J, Oka A, James A, Palmer LJ, Musk AW, Beilby J, Inoko H
  • 雑誌名: Hum Genet 123 ページ: 297-306
• [雑誌論文] Microsatellite markers for genome-wide association studies. (2007)
  • 著者名/発表者名: Bahram S, Inoko H
  • 雑誌名: Nature Reviews Genetics 8(2) ページ: 164
• [雑誌論文] Single nucleotide polymorphism detection by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ota M, Fukushima H, Kulski JK, Inoko H
  • 雑誌名: Nature Protocol 2(11) ページ: 2857-6284
• [雑誌論文] Whole genome association study of rheumatoid arthritis using 27, 039 microsatellites. (2005)
  • 著者名/発表者名: Tamiya G, Shinya M, Imanish T, Ikuta T, Makino S, Okamoto K, Furugaki K, Matsumoto T, Mano S, Gojobori T, Bahram S, Inoko H
  • 雑誌名: Hum Mol Genetics 14 ページ: 2305-2321
• [雑誌論文] Genome-wide association studies define IL23R/IL12RB2 and IL10 as susceptibility loci for Behcet's disease.
  • 著者名/発表者名: Mizuki N, Meguro A, Ota M, Ohno S, Shiota T, Kawagoe T, Okada T, Bahram S, 、Ishigatsubo Y, Inoko H
  • 雑誌名: Nature Genetics (in press)
• [学会発表] Identification of NFKBIL1 as a susceptible locus of rheumatoid arthritis by genome- wide association using microsatellites and its functional analysis in steoclastogenesis. (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoko H
  • 学会等名: Simposium in the10th Congress of International Ocular Inflammation Society
  • 年月日: 2009-06-02
• [学会発表] Genome-wide scan of disease gene by association analysis using 30, 000 microsatellites. (2006)
  • 著者名/発表者名: Inoko H
  • 学会等名: The 8th International Meeting on Human Genome Variation on Complex Genome Analysis
  • 年月日: 2006-09-15
• [備考] ホームページ:http://inoko. med. u-tokai. ac. jp 3万個のマイクロサテライトの位置、PCRプライマー、多型頻度などの情報に関するデータベース:
  • URL: http://www.jbirc.aist.go.jp/gdbs
• [産業財産権] 尋常性乾癬検査用マーカー遺伝子 (2008)
  • 発明者名: 猪子英俊、岡晃
  • 権利者名: 東海大学、ジェノダイブファーマ
  • 産業財産権番号: 特許2008-000095
  • 出願年月日: 2008-01-25