| 研究課題/領域番号 |
17019065
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| 研究機関 | 国立遺伝学研究所 |
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研究代表者 |
五條堀 孝 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 教授 (50162136)
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| 研究分担者 |
菅原 秀明 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 教授 (80231372)
池尾 一穂 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 助教授 (20249949)
鈴木 善幸 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 助手 (70353430)
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| キーワード | 疾患情報モデル / データベース / ゲノム / 表現型 / アノテーション |
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| 研究概要 |
情報リソースの研究と整備においては、疾患情報モデル作成のための情報リソース整備に向けて、国内外において構築、公開されている生命科学系データベース、特に疾患に関係するものについて、実際に入手、もしくはインターネットを介してアクセスし、それらのデータの中身および利便性の調査・評価を進めている。特に、Nucleic Acids Research誌のデータベース特集号に掲載されている100以上のデータベースについては、詳細を調べるとともに、将来的なデータの利用と統合を目的として各々のデータ構造の精査を行いシステムの設計のための参考情報とした。これらは、インターネットを通じてアクセス可能なものに関してはリスト作成が終了しており、将来、情報提供の一環として公開の予定である。
次に疾患モデル研究・構築システムの開発については、プロトタイプの開発に向けてゲノム情報を含む遺伝子配列データから書誌情報に現れる種々の医療関連情報等を含めて一元的に管理、統括するためのシステムの設計を進めている。特に、疾患モデル作成のために特定の疾患に関連する情報を遺伝子レベルから表現型レベルまで一括して検索し、個々の情報を生命科学的意味付けに基づいて再度関連付けをするための仕組みの設計を進めている。このような仕組みにより得られた情報は、疾患モデル作成の際の基礎情報として用いられる予定である。
また、アノテーション・検索システムについては、種々・多様な情報を一括して串刺し検索するような方法論と、それらの情報を効率良くアノテーションするとともに遺伝子、細胞、個体にいたる広く多様かつ複雑な情報を利用者に分かりやすく伝えるための画像を中心としたデータの表現方法と表示のための技術検討を開始している。
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