| 研究課題/領域番号 |
17020003
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
徳永 勝士 東京大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (40163977)
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| 研究分担者 |
大橋 順 東京大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (80301141)
宮寺 浩子 東京大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (40361464)
本多 真 財団法人東京都医学研究機構, 東京都精神医学総合研究所, 副参与研究員(研究職) (50370979)
慶長 直人 国立国際医療センター研究所, 呼吸器疾患研究部, 部長(研究職) (80332386)
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| キーワード | SNPタイピング / 2型糖尿病 / ゲノムワイド関連分析 / 多系統萎縮症 / パニック障害 / ナルコレプシー / マラリア / 結核 |
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| 研究概要 |
SNP解析支援:アトピー性喘息の新規感受性遺伝子の同定、高血圧、2型糖尿病、1型糖尿病などと関連する多数のSNPsの検出に貢献した。また耳垢型を決定する遺伝子多型の同定にも貢献した。さらに、50万SNPsを用いるゲノムワイド関連分析システムを導入し、多系統萎縮症およびパニック障害の患者群と対照群の試料について一次スクリーニングを実施した。一方、候補領域の絞り込みに適する新規のマルチプレックスSNP解析技術(DigiTag法)の1st versionを開発した。現在さらに改良中であり、いかなる候補SNPでも高い成功率、低コストで解析できるシステムの見通しが立った。
個別的研究:ナルコレプシーについて、ゲノムワイド関連分析によって検出された候補領域のひとつにおけるマイクロサテライトおよびSNPによる絞込みの結果、新規疾患抵抗性遺伝子候補(NLC1Aと仮称)を同定した。この遺伝子は脳視床下部で発現し、その多型が発現レベルに影響した。一方、マイクロアレイ発現解析および定量的RT-PCR法により、後部視床下部で9個、前部視床下部で8個の疾患関連遺伝子を同定した。さらに、最大の量的変化を示したオレキシン、およびオレキシン1,2受容体について高感度の自己抗体検出系を確立し、オレキシン神経系に対する自己抗体を検出した。マラリアについては、5q31領域のマイクロサテライト群を解析し、脳性マラリア重症化と関連する2つのマーカーを見出した。さらに、HLA-B、HLA-DRB1およびIL-1Bを候補遺伝子としてマラリア重症化との関連を検討した結果、3個のアリルが重症化と関連していた。結核については、ベトナムおよびタイより患者とその家族試料および健常者試料を予定通り収集し、ベトナムの試料についてはHLA-A、-B、-C、-DRB1遺伝子群の関連分析を実施した。
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