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2009 年度 研究成果報告書

微生物ゲノムシーケンシング体制の活用による微生物システム解明への基盤構築

研究課題

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研究課題/領域番号 17020007
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学 (2007-2009)
北里大学 (2005-2006)

研究代表者

服部 正平  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (70175537)

研究分担者 山下 敦士  北里大学, 北里生命科学研究所, 助手 (20348585)
藤 英博  理化学研究所, 基幹研究所, 研究員 (10353468)
高見 英人  海洋研究開発機構, 極限環境生物圏研究センター, グループリーダー (70359165)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
キーワードゲノム / メタゲノム / 微生物 / 腸内細菌
研究概要

本研究はゲノムシークエンシング体制を活用して、微生物システム解明のための新たな研究基盤の構築を行った。とくに、大腸菌やビフィズス菌、ラクトバチラス菌等のヒト腸内に常在する腸内細菌の個別ゲノム解析、並びに難培養性細菌を含むヒト腸内細菌叢を丸ごと解析するメタゲノム解析法を確立し、ヒト腸内細菌叢に特徴的な遺伝子の同定とその機能特性を明らかにした。

  • 研究成果

    (20件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (5件) 図書 (3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the wild-type commensal Escherichia coli strain SE15 belonging to phylogenetic group B22010

    • 著者名/発表者名
      藤、服部, 他(全14名, 1, 14番目)
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. 192

      ページ: 1165-1166

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus rhamnosus ATCC531032009

    • 著者名/発表者名
      藤、服部, 他(全7名, 2, 7番目)
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. 191

      ページ: 7630-7631

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The human intestinal microbiome: A new frontier of human biology2009

    • 著者名/発表者名
      服部, Taylor TD
    • 雑誌名

      DNA Res. 16

      ページ: 1-12

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence and comparative analysis of the wild-type commensal Escherichia coli strain SE11 isolated from a healthy adult2008

    • 著者名/発表者名
      藤、服部, 他(全12名, 2, 12番目)
    • 雑誌名

      DNA Res. 15

      ページ: 375-386

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome of an endosymbiont coupling N2 fixation to cellulolysis within protist cells in termite gut2008

    • 著者名/発表者名
      本郷、服部, 他(全11名, 5, 10番目)
    • 雑誌名

      Science 322

      ページ: 1108-1109

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The genome sequence of the streptomycin-producing microorganism Streptomyces griseus IFO 13350.2008

    • 著者名/発表者名
      大西、服部, 他(全9名, 8番目)
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. 190

      ページ: 4050-4060

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes.2007

    • 著者名/発表者名
      黒川、藤、高見、服部, 他(全20名, 5, 7, 20番目)
    • 雑誌名

      DNA Res. 14

      ページ: 169-181

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An improved isolation method for metagenomic analysis of the microbial flora of the human intestine2007

    • 著者名/発表者名
      森田、高見、服部, 他(全8名, 6, 8番目)
    • 雑誌名

      Microbes Environ. 22

      ページ: 214-222

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella2006

    • 著者名/発表者名
      中鉢、藤、服部, 他(全7名, 3, 7番目)
    • 雑誌名

      Science 314

      ページ: 267

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Massive genome erosion and functional adaptations provide insights into the commensalistic lifestyle of the tsetse endosymbiont, Sodalis glossinidius2006

    • 著者名/発表者名
      藤、山下、服部, 他(全7名, 1, 4, 6番目)
    • 雑誌名

      Genome Res. 16

      ページ: 149-156

    • 査読あり
  • [学会発表] High-throughput analysis of human gut microbiomes by next generation sequencing2010

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 学会等名
      第83回日本細菌学会: International Symposium‘Microbiota and Intestinal Homeostasis'
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-03-29
  • [学会発表] Metagenomics: a gene-centric approach for the human gut microbiome research2009

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 学会等名
      2009 symposium on the metabolism of foods and drugs by intestinal microflora
    • 発表場所
      韓国ソウル
    • 年月日
      2009-10-20
  • [学会発表] Metagenomic analysis of the human gut microbiota: A new frontier of human biology2008

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 学会等名
      JSPS-DST Asian Academic Seminar 2008
    • 発表場所
      インドバンガロール
    • 年月日
      20081226-20081230
  • [学会発表] Sequencing of human gut microbiomes2007

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 学会等名
      The 7th Advance Genomics Workshop
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20071127-20071128
  • [学会発表] Sequencing of bacterial genomes and metagenomes2007

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 学会等名
      Metagenomics 2007
    • 発表場所
      米国サンディエゴ
    • 年月日
      20070711-20070713
  • [図書] 遺伝子医学の最前線と次世代シーケンサー(メタゲノミクスとヒト腸内細菌叢の機能 実験医学増刊号, 実験医学, 27(12))2009

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 総ページ数
      121-127
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] 感染・炎症・免疫(腸内細菌叢のメタゲノム解析とヒト生物学への展開, 39(1))2009

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 総ページ数
      2-13
    • 出版者
      医薬の門社
  • [図書] ヒトの腸内細菌叢の全体像-メタゲノム解析から見えてきたこと-(科学 78(1))2008

    • 著者名/発表者名
      服部
    • 総ページ数
      30-33
    • 出版者
      岩波書店
  • [備考] 内容:ヒト腸内細菌叢を構成する腸内細菌のゲノム配列と遺伝子アミノ酸配列情報/ヒト腸内細菌叢メタゲノムデータベース

    • URL

      http://metagenome.jp/microbes/

  • [備考] 報道関連情報(朝日新聞2005. 11. 26;毎日新聞2006. 10. 13;日刊工業新聞2006. 12. 7;朝日新聞2007. 7. 23;日経新聞2007. 9. 17;毎日新聞2007. 10. 19;日経新聞2007. 10. 7;読売新聞2008. 7. 6;読売新聞2008. 11. 17; NHKサイエンスゼロ2008. 7. 26)

URL: 

公開日: 2011-06-18   更新日: 2016-04-21  

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