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2006 年度 実績報告書

DNAタイルの高信頼セルフアセンブリ技術の研究

研究課題

研究課題/領域番号 17059001
研究機関東京工業大学

研究代表者

村田 智  東京工業大学, 大学院総合理工学研究科, 助教授 (10334533)

研究分担者 柳田 保子  東京工業大学, 精密工学研究所, 助教授 (10282849)
キーワードナノバイオテクノロジー / DNAタイル / DNA結合タンパク質 / マイクロ流体デバイス / 高信頼セルフアセンブリ
研究概要

1)DNAタイルのセルフアセンブリの高信頼化
前年度に引き続きDNAタイルセルフアセンブリ体におけるエラー率の定量化に取り組んだ.DNAオリガミを結晶核としてリボン上の構造を生成し,その上にXOR演算タイルを成長させた.これをAFM観察し,エラー率の精密な測定を行った.また,タイル種ごとの濃度,アニールによる温度変化などの条件を考慮したシミュレーションシステムを構築し,リボンアセンブリにおける実測値と予想値を比較して良好な一致を見た.エラー抑制手法としては,SST(single stranded tile)と呼ばれるより単純なDNAモチーフに対してLTMが適用可能であることをしめした.また,マイクロ流体デバイスを用いたDNAタイルのステップワイズアセンブリ実験に成功し,送液順序によりDNAセルフアセンブリ結晶の階層構造が制御可能であることを蛍光観察実験により実証した.
2)DNA相互作用分子による機能発現
2層化DNAタイル構造上にナノ微粒子を位置特異的に固定化するための基礎研究を行い、ビオチン化DNA上にアビジン修飾ナノ微粒子を周期的に配置したナノ構造体の長鎖化に成功した。また鋳型DNAとRecAタンパク質および一本鎖DNAによる塩基配列特異的複合体形成に適した塩基配列の決定を行なった。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2006

すべて 雑誌論文 (6件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] DNAを用いた微小粒子のナノ位置決め2006

    • 著者名/発表者名
      初澤 毅, 小山内寛, 柳田保子
    • 雑誌名

      精密工学会誌 Vol.72,No.11

      ページ: 1407-1410

  • [雑誌論文] A Microfluidic Device for DNA Tile Self-Assembly2006

    • 著者名/発表者名
      K.Somei, S.Kaneda, T.Fujii, S.Murata
    • 雑誌名

      11th International Workshop on DNA Computing, Revised Selected Papers (DNA11) LNCS 3892

      ページ: 325-335

  • [雑誌論文] Hybridization in a Microfluidic Device for DNA Tile Self-Assembly2006

    • 著者名/発表者名
      K.Somei, S.Kaneda, T.Fujii, S.Murata
    • 雑誌名

      Proc. Foundations of Nanoscience, Self-Assembled Architectures and Devices (FNANO2006)

      ページ: 148-152

  • [雑誌論文] Reversible Signal Amplification by Linear Hybridization Chain Reaction2006

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Suzuki, Ken Komiya, Satoshi Murata
    • 雑誌名

      Preliminary Proceedings of 12^<th> International Meeting on DNA Computing (DNA11)

      ページ: 418

  • [雑誌論文] Self-Assembling Systems2006

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Murata
    • 雑誌名

      9^<th> Japanese-American Kavli Frontiers of Science Symposium, National Academy of Sciences (JAFoS) (CD-ROM)

  • [雑誌論文] Computation by DNA Molecule2006

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Murata
    • 雑誌名

      SCIS&ISIS 2006 (invited session) (CD-ROM)

  • [図書] 進化・情報・かたち-"生命知"のパースペクティブ,4-2 生物の形-システムの生成と進化の観点から2006

    • 著者名/発表者名
      村田 智(分担執筆)
    • 総ページ数
      156-170
    • 出版者
      培風館
  • [産業財産権] Apparatus and method for fabricating Nanoconstruct2006

    • 発明者名
      村田智, 染井康太郎
    • 権利者名
      東京工業大学
    • 産業財産権番号
      PCT(国際出願)JP2006/311237
    • 出願年月日
      20061217(国際公開)

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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