研究課題/領域番号 |
17109008
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研究機関 | 札幌医科大学 |
研究代表者 |
今井 浩三 札幌医科大学, 学長 (60117603)
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研究分担者 |
篠村 恭久 札幌医科大学, 医学部, 教授 (90162619)
豊田 実 札幌医科大学, 医学部, 教授 (70270676)
山本 博幸 札幌医科大学, 医学部, 講師 (40332910)
有村 佳昭 札幌医科大学, 医学部, 講師 (80305218)
鈴木 拓 札幌医科大学, 医学部, 助教 (20381254)
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キーワード | DNAメチル化 / ヒストン修飾 / エピジェネティクス / 遺伝子診断 / 分子標的治療 |
研究概要 |
癌におけるエピジェネティック異常の新たな標的動態のため、マイクロアレイや候補遺伝子アプローチにより、ゲノム網羅的にメチル化異常を解析し、IGFBP7、RASD1、BMAL1、IRF4遺伝子を新規メチル化の標的遺伝子として同定した。IGFBP7の異常メチル化はBRAFの変異により誘導される、細胞老化回避機構として重要であることを明らかにした。IRF4の異常メチル化は健常患者に比べ、胃癌患者の背景胃粘膜で高値を示し、発癌リスク予測のマーカーとして有用である可能性が示唆された。また、胃癌におけるJCウイルス感染が、CpGアイランドメチレーターフェノタイプの原因として重要であることを明らかにした。Methylated CpG island amplification-microarray (MCAM)法を用いて、大腸癌におけるメチル化プロファイルを作成した。その結果、BRAF遺伝子やK-ras遺伝子の変異を有する腫瘍では、ゲノムワイドなメチル化を認め、特に隆起型の形態を有する腫瘍においてメチル化が亢進していた。これらの腫瘍は、組織学的に過形性ポリープから鋸歯状腺腫を経て癌化するタイプが多く、CpGアイランドメチレーターフェノタイプの原病変と考えられた。また、大腸癌表面の粘液中からDNAを抽出し、メチル化解析を行うことに成功した。粘液中のメチル化レベルは、浸潤性大腸癌において、非浸潤性大腸癌において高値を示し、癌の進達度診断に有用な可能性が示唆された。超高速シークエンサーを用いて、Bisulfiteシークエンスを行うシステムを開発した。これまで既知のメチル化標的遺伝子のメチル化を検出しており、今後ゲノム網羅的メチル化検出に、超高速シークエンサーが有用であることが示唆された。
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