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2006 年度 実績報告書

代謝制御におけるRNAの新たな役割

研究課題

研究課題/領域番号 17207010
研究機関名古屋大学

研究代表者

饗場 弘二  名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (20025662)

キーワードsmall RNA / Hfq / RNase E / グルコーストランスポーター / 解糖系 / 翻訳抑制 / mRNA分解 / ribonucleoprotein complex
研究概要

SgrS RNAはHfqと結合して代謝ストレス応答を担うsmallアンチセンスRNAである。SgrS RNAはHfqを介してRnase Eとリボヌクレオタンパク複合体を形成し、標的であるグルコーストランスポーター遺伝子ptsGを転写後段階で発現抑制する。SgrS RNAは部分的な塩基対形成によりptsG mRNAに作用すると予想できる。そこで、ptsG mRNAの発現制御機構におけるSgrS RNAとptsG mRNAの塩基対形成の重要性について検討した。その結果、ptsG mRNAのShine-Dalgarno (SD)配列付近に、SgrS RNAの働きを減少させる点変異体を同定した。また、その点変異体と相補的になるようSgrS RNA側の変異体を構築し解析した結果、SgrS RNAの機能が回復した。これらの解析により、ptsGの転写後の発現抑制におけるSgrS RNAとptsG mRNAの塩基対形成の重要性が示された。また、ptsG mRNAのSD配列付近の6塩基対がSgrS RNAの働きにとりわけ重要であることが明らかになった。同時に、in vitroにおいて、SgrS RNAがptsG mRNAと安定的なRNA-RNA結合を形成し、HfqがRNA間の結合を著しく促進することを明らかにした。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (5件)

  • [雑誌論文] Reduced action of polypeptide release factors induces mRNA cleavage and tmRNA tagging at stop codons in Escherichia coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Li, X., Teruaki Yokota T., Ito K., Nakamura Y., Aiba, H.
    • 雑誌名

      Mol. Microbiol. 63

      ページ: 116-126

  • [雑誌論文] Protein tagging at rare codons is caused by tmRNA action at the 3' end of nonstop mRNA generated in response to ribosome stalling.2006

    • 著者名/発表者名
      Li, X., Hirano, R., Tagami, H., Aiba, H.
    • 雑誌名

      RNA 12

      ページ: 248-255

  • [雑誌論文] Translational repression is sufficient for gene silencing by bacterial small non-coding RNAs in the absence of mRNA destruction.2006

    • 著者名/発表者名
      Morita, T., Mochizuki, Y., Aiba, H.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103

      ページ: 4858-4863

  • [雑誌論文] Yeel, a novel protein involved in modulation of the activity of the glucose-phosphotransferase system in Escherichia coli K-12.2006

    • 著者名/発表者名
      Becker.A.K., Zeppenfeld, T., Staab, A., Seitz, S., Boos, W., Morita T., Aiba H., Mahr, K., Titgemeyer, F., Jahreis, K.
    • 雑誌名

      J Bacteriol. 188

      ページ: 5439-5449

  • [雑誌論文] Base-pairing requirement for RNA silencing by a bacterial small RNA and acceleration of duplex formation by Hfq.2006

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto, H., Koide, Y., Morita, T., Aiba, H.
    • 雑誌名

      Mol. Microbiol. 61

      ページ: 1013-1022

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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