| 研究課題/領域番号 |
17310113
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
小林 一三 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (30126057)
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| 研究分担者 |
半田 直史 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 産学官連携研究員 (00396855)
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| キーワード | ゲノム / 利己的遺伝子 / 制限酵素 / 動く遺伝子 / ゲノム進化 / 細菌ゲノム / 病原細菌 / ファージ |
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| 研究概要 |
(1)制限酵素修飾酵素遺伝子の自己増殖。
( 1-1)制限酵素修飾酵素遺伝子の増幅が起きたラインからのゲノムDNAをドナーとして、枯草菌に自然形質転換を行い、形質転換体を得た。
(1-2)制限酵素修飾酵素遺伝子のコピー数を検討する簡便なアッセイ系を、GFPで作った。
(1-3)EcoRIについて、制限酵素と修飾酵素の細胞内での安定性に大差が無いことを、ウエスタンブロットとパルスチェイス実験で示した。
(1-4)EcoRIIについても、ホスト攻撃に関与する修飾酵素変異体の解析を開始した。
(2)制限酵素修飾酵素遺伝子とゲノム再編。
(2-1)大腸菌での制限修飾遺伝子の染色体への転移が制限酵素活性に依存するか否かを検討した。(2-2) III型制限修飾遺伝子が、細胞あたり一匹感染したファージ・ゲノムを攻撃したとき、ファージの相同組換え機構がこれに抵抗する事を証明した。
(3)理論的・情報学的解析:制限修飾遺伝子によるゲノム多型形成の痕跡の探索。
制限修飾遺伝子に注目して近縁の細菌のゲノム配列を比較して、ゲノム多型の形成機構を推測した。
3-1)ナイセリアの4株のゲノムを比較し、新しいファージ・ファミリーを発見し、それが自己の持つRNaseH/レトロウィルスインテグラーゼ型の組み込み酵素によってゲノムに組み込まれる証拠を得た。(3-2)黄色ブドウ球菌7株の比較を行い、病原性アイランドにある毒素パラログ遺伝子群とI型制限酵素遺伝子の進化機構を推定した。
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