• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2007 年度 研究成果報告書概要

tRNA擬態タンパク質によるリボソーム普遍機能と生体高次機能の発現機構解明

研究課題

研究課題/領域番号 17310123
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物分子科学
研究機関東京大学

研究代表者

伊藤 耕一  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (10262073)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
キーワード翻訳終結 / 翻訳制御 / リボソーム / リコーディング / ペプチド鎖解離因子 / タンパク質合成 / tRNA分子擬態 / 遺伝子発現制御
研究概要

翻訳終結の触媒中心タンパク質因子であるペプチド鎖解離因子について以下の研究成果公表した。
(1)tRNA擬態タンパク質eRF1のコドン識別機能ドメインの解明のため、終止遺伝暗号を普遍遺伝暗号として用いない例が多く見られる繊毛虫類に由来するeRF1ホモログを用いた比較解析を進めた。今回は、近縁種中、普遍遺伝暗表と一致する終始遺伝暗号を持つ事が予想されたLitostomatea属由来のeRF1のクローンを取得し、そのeRF1によるコドン特異性を、既に確立した酵母・ヒト由来因子とのキメラ体構築技術と、新規に開発したin vivo終始コドン効率測定系を応用し実証した。これらの比較機能解析により、従来のコドン認識領域に関する知見の絞り込みが可能になったと同時に、繊毛虫類には、終止コドンについて、普遍遺伝暗号を用いる系統が混在する事実も明らかになった。
(2)tRNA擬態タンパク質eRF1と共役し機能するペプチド鎖解離因子eRF3に相互作用することが網羅解析から報告されていた因子群について、その作用機構を系統的解析する遺伝学的実験系の構築を行った。各因子について、機能制御の有無や、互換機能性を検証したところ、正負にそれぞれ機能制御する出芽酵母因子SlaIおよびItt1を同定し、これらの機能制御が未知のタンパク質安定化機構とのカップリングを実現している事を明らかにした。不安定化機構を明らかにする目的で、ユビキチンによるプロテアソームや、オートファジー系の細胞内タンパク質分解機構の阻害剤や変異体株を用いた解析を行い、後者がこの分解に主に関わることを示唆する実験結果を得た。

  • 研究成果

    (33件)

すべて 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (21件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Reduced action of polypeptide release factors induces mRNA cleavage and tmRNA tagging at stop codons in Escherichia coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Li, X.
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology 63

      ページ: 116-126

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chloroplast ribosome release factor 1(AtcpRF1)is essential for chloroplast development.2007

    • 著者名/発表者名
      Motohashi, R
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology 64

      ページ: 481-497

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of N-terminal domain of translational release factor eRF3 for the control of functionality and stability in S. cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Kodama, H
    • 雑誌名

      Genes to Cells 5

      ページ: 639-650

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reduced action of polypeptide release factors induces mRNA cleavage and tmRNA tagging at stop codons in Escherichia coli2007

    • 著者名/発表者名
      Li, X., Yokota, T., Ito, K., Nakamura, Y., Aiba, H.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol. 63

      ページ: 116-126

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Chloroplast ribosome release factor 1 (AtcpRF1) is essential for chloroplast development2007

    • 著者名/発表者名
      Motohashi, R., Yamazaki, T., Myouga, F., Ito, T., Ito, K., Satou, M., Kobayashi, M., Nagata, N., Yoshida, S., Nagashima, A., Tanaka, K., Takahashi, S., Shinozaki, K.
    • 雑誌名

      Plant Mol Biol. 64

      ページ: 481-497

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] The role of N-terminal domain of translational release factor eRF3 for the control of functionality and stability in S. cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Kodama, H., Ito, K., Nakamura, Y.
    • 雑誌名

      Genes Cells. 5

      ページ: 639-650

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Ribosomal protein L11 mutations in two functional domains equally affect release factors 1 and 2 activity.2006

    • 著者名/発表者名
      Sato, H
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology 60

      ページ: 108-120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ribosomal protein L11 mutations in two functional domains equally affect release factors 1 and 2 activity2006

    • 著者名/発表者名
      Sato, H., Ito, K., Yakamura, Y.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol. 60

      ページ: 108-120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Ciliates use both variant and universal genetic codes: An evidence of omnipotent eRFls in the class Litostomatea.

    • 著者名/発表者名
      Thi Phuong Kim
    • 雑誌名

      Gene 印刷中

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ciliates use both variant and universal genetic codes : An evidence of omnipotent eRF1s in the class Litostomatea

    • 著者名/発表者名
      Thi Phuong Kim, O., Sakurai, A., Saito, K., Ito, K., Ikehara, K., Harumoto, T.
    • 雑誌名

      Gene (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] 繊毛虫eRF1のコドン特異性取得の再検証と真核生物の終止コドン認識機構解明への応用2007

    • 著者名/発表者名
      斎藤和紀
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会(BMB200)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20071211-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] ドロップオフ反応を用いた翻訳終結因子RF3の機能構造領域解明2007

    • 著者名/発表者名
      渡辺裕也
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会(BMB200)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20071211-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] 出芽酵母翻訳終結因子eRF3のN末端領域を介したeRF3分解制御機構2007

    • 著者名/発表者名
      和田美紀
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会(BMB200)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20071211-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] 多様なmRNA動態機能発現を可能にする終止コドン認識機2007

    • 著者名/発表者名
      伊藤耕一
    • 学会等名
      日本プロテオーム機構(JHUPO)第5回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-07-31
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Identification of RF3 domain for peptidyl-tRNA drop-off.2006

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Y
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Genetic analyses of species-specific interaction among surveillance complex components for nonsense-mediated mRAN decay2006

    • 著者名/発表者名
      Wada M
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] A genetic analysis of stop codon recognition mechanism of class I eukaryotic release factor. eRF1.2006

    • 著者名/発表者名
      Saito K
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Bioloay
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Novel mechanism to regulate the polypeptide chain release factor 3 (eRF3) activity through its cis-acting N-terminal Domain in Saccharomyces2006

    • 著者名/発表者名
      Kodama H
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Identification of RF3 domain for peptidyl-tRNA drop-off2006

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Y., Ito K., Nakamura Y.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] Genetic analyses of species-specific interaction among surveillance complex components for nonsense-mediated mRNA decay2006

    • 著者名/発表者名
      Wada M., Murakami S., Nakamura Y., Ito K.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] A genetic analysis of stop codon recognition mechanism of class I eukaryotic release factor, eRF12006

    • 著者名/発表者名
      Saito K., Nakamura Y, Ito K.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] Novel mechanism to regulate the polypeptide chain release factor 3 (eRF3) activity through its cis-acting N-terminal Domain in Saccharomyces cerevisiae2006

    • 著者名/発表者名
      Kodama H., Nakamura Y., Ito K.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto Japan
    • 年月日
      20060618-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] 翻訳終結因子の新規な機能性とその機能構造2006

    • 著者名/発表者名
      小玉裕之
    • 学会等名
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20060400
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] ペプチジルtRNAのドロップオフ促進作用に関わる翻訳終結因子RF3の機能ドメイン解明2005

    • 著者名/発表者名
      渡辺裕也
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20051200
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] リボソーム蛋白質L11による翻訳終結制御機構の解明2005

    • 著者名/発表者名
      佐藤華江
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20051200
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] 出芽酵母GTP結合性ペプチド鎖解離因子eRF3におけるN末端シス領域を介した新規な機能制御機構2005

    • 著者名/発表者名
      小玉裕之
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20051200
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] 出芽酵母NMD評価系を用いた異種由来Upf因子群の機能的相補性2005

    • 著者名/発表者名
      村上紗織
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20051200
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] 翻訳終結因子eRF3の終結反応とmRNA品質管理機構における機能的関連性の検証2005

    • 著者名/発表者名
      和田美紀
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20051200
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Isolation and functional analyses of ribosomal protein mutations that affect translation termination efficiency2005

    • 著者名/発表者名
      Hanae Sato
    • 学会等名
      EMBO Conference on Protein Synthesis and Translational Control Partnered with the CSHL Meeting on Translational Control
    • 発表場所
      Heidelberg
    • 年月日
      20050914-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Isolation and functional analyses of ribosomal protein mutations that affect translation termination efficiency2005

    • 著者名/発表者名
      Hanae Sato, Koichi Ito, Yoshikazu Nakamura
    • 学会等名
      EMBO Conference on Protein Synthesis and Translational Control Partnered with the CSHL Meeting on Translational Control
    • 発表場所
      EMBL Heidelberg
    • 年月日
      20050914-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] tRNA擬態が可能にした蛋白質合成装置の基本機能と拡張性2005

    • 著者名/発表者名
      伊藤耕一
    • 学会等名
      第5回日本蛋白質科学会年会・シンポジウム
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20050600
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [図書] 翻訳調節における翻訳終結制御機構の新知見(実験医学)2007

    • 著者名/発表者名
      伊藤耕一
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [図書] ナンセンス!(蛋白質核酸酵素)2006

    • 著者名/発表者名
      伊藤耕一
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      共立出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より

URL: 

公開日: 2010-02-04  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi