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2006 年度 実績報告書

細菌多様性の系統分類学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 17310135
研究機関東京大学

研究代表者

横田 明  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 (40106638)

キーワード細菌系統分類 / 微生物多様性 / 16S rRNA遺伝子 / Proteobacteria / Verrucomicrobia / Cyanobacteria / Bacteroidetes / Actinobacteria
研究概要

本研究は細菌系統分類学の確立と生物資源の確保に寄与することを目的として、有用細菌全般にわたって検討を行った。具体的には、広く細菌の多様性に注目して自然界より菌株の分離を行い、形態、生理・生化学的性状、化学分類学的性状に加えて、分子系統の情報を加えた多面的アプローチから細菌系統の解析を行い、これらの結果をもとに正しい分類群への位置付けを明らかした。本年度実施した研究内容は、
1 Proteobacteria門の菌株
新規の海洋細菌の分離株について系統解析を含めた分類学的解析を行い、γ-Proteobacteriumの新種と判明したので、Pseudovibrio ascidiaceicola, Pseudovibrio japonicaを提唱した。
2 Bacteroidetes門の菌株
海草から分離した滑走運動性でBacteroidetes門の細菌株1株は新種と判明したので、Aureospira maritimaを提唱した。また海洋環境から分離された株について検討した結果、新属新種と判明したのでPerexilibacter aurantiaca gen. nov., sp. nov.およびPersicitalea jodogahamensis gen. nov., sp. nov.を提唱した。また、海水より分離された菌株について新種Flammeovirga kamogawensisおよびLoktanella atroaurantiacaを提唱した。
3 Verrucomicrobia門の菌株
海中環境を模倣したin situ cultureの手法を用いて、海水から分離された菌株について系統分類学的位置を明らかにし、さらに、生化学的解析を試みた。その結果、これらの菌株は、真正細菌の細胞壁の主な構成成分として知られているペプチドグリカンを欠如しているものと考えられた。これらの菌株をVerrucomicrobia門の新属新種Coralimargarita akajimensis、Pelagicoccus mobilis, P.albus, P.litoralis,およびCerasicoccus arenaeとすることを提唱した。この様に、Verrucomicrobia門のPuniceicoccales目の細菌群は、グラム陰性細菌よりもさらに原始的な細胞壁を有している可能性が強く示唆された。
4 Cyanobacteria門の菌株
地衣類に共生するシアノバクテリアの分離を試み、形態と分子の両形質の統合的解析から分離株の同定を試みた。
5 Firmicutes門の菌株
土壌から分離した好気性有胞子細菌株について、系統解析による遺伝形質と形態、生理・生化学的性状、化学分類学的性状の比較による表現形質との多角的解析を行い、新属新種Terribacillus saccharophilus gen. nov., sp. nov.および新種Terribacillus halophilus, Paenibacillus terrigena, Virgibacillus halophilus, Sporosarcina saromensis, Amphibacillus sedimentumを提唱した。
6 Actinobacteria門の菌株
土壌および地衣類から分離した放線菌株について、系統解析による遺伝形質と形態、生理・生化学的性状、化学分類学的性状の比較による表現形質の多角的解析を行い、新種Nocardioides exalbidus, Amycolatopsis echigoensis, Amycolatopsis niigatensis, Rhodococcus kyotonensis, Leifsonia lichenia, Rhodoglobus aureusを提唱した。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (23件)

  • [雑誌論文] Status of the type strain of Leifsonia rubra : Proposal of opinion2007

    • 著者名/発表者名
      S.-Y.An, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57

      ページ: 1163-1163

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Paenibacillus terrigena sp.nov.,isolated from soil in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      C.-H.Xie, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56

      ページ: 70-72

  • [雑誌論文] Endozoicimonas elysicola gen.nov.,sp.nov.,a γ-proteobacterium isolated from a sea slug Elysia ornata.2007

    • 著者名/発表者名
      M.Kurahashi, A.Yokota
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Microbiology 30

      ページ: 202-206

  • [雑誌論文] Coraliomargarita akajimensis gen.nov.,sp.nov.,a novel member of the phylum Verrucomicrobia isolated form seawater in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      J.Yoon, M.Yasumoto-Hirose, A.Katsuta, H.Sekiguchi, S.Matsuda, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57

      ページ: 959-963

  • [雑誌論文] Perexilibacter aurantiaca gen.nov.,sp.nov.,a novel member of the family "Flammeovirgaceae" isolated from sediment.2007

    • 著者名/発表者名
      J.Yoon, S.Ishikawa, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57

      ページ: 964-968

  • [雑誌論文] Persicitalea jodogahamensis gen.nov.,sp.nov.,a marine bacterium of the family "Flexibacteraceae", isolated from seawater in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      J.Yoon, S.Ishikawa, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57

      ページ: 1014-1017

  • [雑誌論文] Reclassification of Flexibacter aggregans(Lewin 1969)Leadbetter 1974 as a later synonym of Flexithrix dorotheae Lewin 1970.2007

    • 著者名/発表者名
      S.Hosoya, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57

      ページ: 1086-1088

  • [雑誌論文] Tateyamaria omphalii,gen.nov.,sp.nov.,isolated from a top shell Omphalius pfeifferi pfeifferi.2007

    • 著者名/発表者名
      M.Kurahashi, A.Yokota
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Microbiology 29

      ページ: doi:10.1016/j.syapm.2007.11.007

  • [雑誌論文] Nocardioides exalbidus sp.nov.,a novel actinomycete isolated from lichen in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      B.Li, C.-H.Xie, A.Yokota
    • 雑誌名

      Actinomycetologica 25(in press)

  • [雑誌論文] Flammeovirga kamogawensis sp.nov.,isolated from coastal seawater of Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      S.Hososya, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Pelagicoccus mobilis gen.nov.,sp.nov.,Pelagicoccus albus sp.nov.and Pelagicoccus litoralis sp.nov.,three novel members of subdivision 4 within the phylum Verrucomicrobia isolated from seawater in situ culture.2007

    • 著者名/発表者名
      J.-W.Yoon, M.Yasumoto-Hirose, Y.Matsuo, M.Nozawa, S.Matsuda, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Virgibacillus halophilus sp.nov.,spore-forming bacteria,isolated from soil in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      S.-Y.An, M.Asahara, K.Goto, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Amycolatopsis echigoensis sp.nov.and Amycolatopsis niigatensis sp.nov.,novel actynomycetes isolated from filtering substrate.2007

    • 著者名/発表者名
      L.-X.Ding, T.Hirose, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Sporosarcina saromensis sp.nov.,a novel aerobic endospore-forming bacterium.2007

    • 著者名/発表者名
      S.-Y.An, T.Haga, H.Kasai, K.Goto, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Aureispira maritima sp.nov.,isolated from marine barnacle.2007

    • 著者名/発表者名
      S.Hosoya, V.Arunpairojana, C.Suwannachart, A.Kanjana-Opas, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Pseudovibrio japonica sp.no.,isolated from the coastal seawater of Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      S.Hosoya, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Loktanella atroaurantiaca sp.nov.,isolated from the coastal seawater of Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      S.Hososya, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Rhodococcus kyotonensis sp.nov.,a novel actinomycete isolated from soil in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      B.Li, K.Furihara, L.-X.Ding, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Cerasicoccus arenae gen.nov.,sp.nov.,a novel marine representative of the family Puniceicoccaceae within the phylum Verrucomicrobia isolated from marine sand2007

    • 著者名/発表者名
      J.Yoon, Y.Matsuo, M.S.Matsuda, K.Adachi, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57(in press)

  • [雑誌論文] Isolation and characterization of cyanobacteria from lichen.2006

    • 著者名/発表者名
      S.Miura, A.Yokota
    • 雑誌名

      Journal of General and Applied Microbiology 52

      ページ: 365-374

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Myroides palagicus sp.nov.,isolated from seawater in Thailand.2006

    • 著者名/発表者名
      J.Yoon, S.Maneerat, F.Kawai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56

      ページ: 1917-1920

  • [雑誌論文] Aureispira marina gen.nov.,sp.nov.,a gliding,arachidonic acid-containing bacterium isolated from the southern coastline of Thailand.2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hosoya, V.Arunpairojana, C.Suwannachart, A.Kanjana-Opas, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56

      ページ: 2931-2935

  • [雑誌論文] Terribacillus saccharophilus gen.nov.,sp.nov.,and Terribacillus halophilus sp.nov.,spore-forming bacteria isolated from soil in Japan.2006

    • 著者名/発表者名
      S.-Y.An, M.Asahara, K.Goto, H.Kasai, A.Yokota
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56

      ページ: 51-55

URL: 

公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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