耐熱性シトクロムCの作用機構の解明と精密分子設計への応用

2007 年度 研究成果報告書概要

• 研究課題/領域番号: 17350081
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 山本 泰彦 筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 教授 (00191453)
• 研究分担者: 長友 重紀 筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 講師 (80373190) ; 河野 慎 筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 準研究員 (90431676)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2007
• キーワード: シトクロム c / へムタンパク質 / 酸化還先電位 / 電気化学 / 熱力学 / 常磁性NMR / タンパク質の変性 / 配位結合

研究概要

好熱性水素細菌Hydrobacter Thermophilusのシトクロムc (HT)、を用いて、従来よりもはるかに系統的かつ高精度に行い、シトクロムcの機能調節に関わる分子機構を明らかにした。HTの熱変性温度は、相同タンパク質である緑膿菌Pseudomonaous Aeiuginosaのシトクロムc (PA)のものに比べて約30℃も高いことが明らかとなっている。PAの熱安定性に関与すると考えられるアミノ酸残基をHTでの対応する残基に置換すると、PAより熱安定性の高い一連の人工変異体が得られる。PAの酸化還元電位(Em)は、ヘム17-プロピオン酸基の電離を反映して、PH 6付近でPHの低下に伴い約60 mV上昇する。このヘムプロピオン酸基の近傍に存在するアミノ酸残基にF34Y、E4SYの変異を導入すると、PAよりpKaが2 pH単位以上低下することが示された。また、変異体(F7A/V13M/V78I)のEmは、PAとほぼ同様のpKaを示したが、測定したpH領域でEmの値が全体的に約70mV低下することが明らかとなった。これらの結果から、タンパク質内部の疎水性コアの安定化により、酸化型シトクロムcでのFe-Met配位結合が安定化されることが示唆された。また、これらのアミノ酸5残基を全て置換した5置換変異体(F7A/V13M/F34Y/E43Y/V78I)のEmのpH依存性には、ヘム17-プロピオン酸基のpKaに影響を及ぼす変異(F34Y、E43Y)と疎水性コアの安定性に影響を及ぼす変異(F7A、V13M、V78I)の両方の影響の足し合わせが反映されていた。したがって、ヘム17-プロピオン酸基のpKaとFe-Met配位結合の安定化によるEm調節機構は、それぞれ独立して寄与することを明らかにした。このように、本研究では、シトクロムcの分子設計に有用な知見が得られた。

研究成果

• [雑誌論文] Effect of reversed heme orientagion on circular dichroism and cooperative oxygen binding of human adult hemoglobin (2008)
  • 著者名/発表者名: Nagai, Y. Nagai, Y. Aki, K. Imai, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 47 ページ: 517-525
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of N-terminal amino group-heme ligation emerging upon guanidine hydrochloric acid-induced unfolding of Hydrogenobacter thermophilus ferricytochrome c552 (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: J. Biol. Inorg. Chem 13 ページ: 25-34
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Roles of a short connecting disulfide bond in the stability and function of psychrophilic Sbewanella violacea cytochrome c5 (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Ogawa, T. Sonoyama, T. Takeda, S. Ichiki, S. Nakamura, Y. Kobayashi, S. Uchiyama, K. Nakasone, S. J. Takayama, H. Mita, Y. Yamamoto, and Y. Sambongi
  • 雑誌名: Extremophiles 11 ページ: 797-807
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Local conformational transition of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 relevant to its redox potential (2007)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, S. Mikami, K. Irie, S. Kawano, Y. Yamamoto, H. Hemmi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 雑誌名: Biochemistry 46 ページ: 9215-9224
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Heme orientational disorder in human adult hemoglobin reconstituted with a ring fluorinated heme and its functional consequences (2007)
  • 著者名/発表者名: S. Nagao, Y. Hirai, S. Kawano, K. Imai, A. Suzuki, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun 354 ページ: 681-685
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Thermodynamics of dimerization of parallel quadruplex DNAs through the end-to-end stacking of 3'-terminal G-quartets (2007)
  • 著者名/発表者名: N. Sakuma, M. Ozawa, S. Kawano, H. Mita, H. Hemmi, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: NucleicAcids Symp. Ser 51 ページ: 245-246
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Exogenous ligand binding property of a heme-DNA coordination complex (2006)
  • 著者名/発表者名: T. Ohyama, Y. Kato, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Chem. Lett 35 ページ: 126-127
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A spectroscopic index for estimating the age of amber (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Kimura, Y. Tsukada, H. Mita, Y. Yamamoto, R. Chujo, and T. Yukawa
  • 雑誌名: Bull Cbem. Soc. Jpn 79 ページ: 451-453
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] cDNA-derived amino acid sequences of myoglobins from nine species of whales and dolphins (2006)
  • 著者名/発表者名: K. Iwanami, H. Mita, Y. amamoto, Y. Fujise, T. Yamada, and T. Suzuki
  • 雑誌名: Comp. Biochem. Pbysiol B145 ページ: 249-256
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Further enhancement of the thermostability of Hydrogenobacter thermopbiluscytochrome 552 (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, H. Sasaki, S. J. Takayama, S. Mikami, S. Kawano, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 45 ページ: 11005-11011
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Influence of a single amide group on the redox function of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Chem. Lett 35 ページ: 528-529
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Formation of a complex of 5, 10, 15, 20-tetrakis(N-methylpyridinium-4-yl)-21H,23H-porphyrin with G-quadruplex DNA (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, T. Ohyama, Y. Tanaka, and Y Yamamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 45 ページ: 6765-6772
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Effects of various cations on the dynamics and thermodynamics of the dimerization of G-quadruplex DNA (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, Y. Kato, M. Ozawa, T. Fujisaki, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: NucleicAcids Symp. Sec 50 ページ: 191-192
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] ^19F NMR Study of b-type hemoproteins (2006)
  • 著者名/発表者名: Y Yamamoto
  • 雑誌名: Modern Mag. Reson ページ: 1-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Binding of 5, 10, 15, 20-tetrakis(Nmethylpyridinium-4-yl)-21H,23H-Porphyrin to as AT-rich region of a duplex DNA (2005)
  • 著者名/発表者名: T. Ohyama, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biophys. Chem 113 ページ: 53-59
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Control of the redox potential of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 through the Fe-Met coordination bond trength and pK_a of a buried heme propionic acid side chain (2005)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, S. Mikami, N. Terui, H. Mita, J. Hasegawa, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 44 ページ: 5488-5494
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Prebiotic formation of polyamino acids in molten urea (2005)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, S. Nomoto, M. Terasaki, A. Shimoyama, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Int. J. Astrobiol 4 ページ: 145-154
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] ^19F NMR characterization of the thermodynamics and dynamics of the acid-alkline transition in a reconstituted sperm whale metmyoglobin (2005)
  • 著者名/発表者名: S. Nagao, Y. Hirai, A. Suzuki, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 127 ページ: 4146-4147
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Five amino acid residues responsible for the high srability of Hydorogenobacter thermophilus cytochrome cs52 : reciprocal mutation analysis (2005)
  • 著者名/発表者名: K. Oikawa, S. Nakamura, S. Sonoyama, Y. Kobayashi, S. J. Takayama, Y. Yamamoto, S. Uchiyama, J. Hasegawa, and Y. Sambong i
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 280 ページ: 5527-5532
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Dynamics and thermodynamics of dimerization of parallel G-quadruplexed DNA formed from d(TTAG_n)(n=3. 5) (2005)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato, T. Ohyama, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: J. Am. Cbem. Soc 127 ページ: 9980-9981
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural and functional charcterization of novel G-quadruplexed DNA-heme coordination complex (2005)
  • 著者名/発表者名: T. Ohyama, Y. Kato, H. Mita, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: NucleicAcids Symp. Ser 49 ページ: 245-246
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Dynamics and thermodynamics of dimerization of parallel G-quadriplexed DNA through p-p stacking interaction (2005)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato, T. Ohyama, S. Nagatomo, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: NucleicAcids Symp. Ser 49 ページ: 247-248
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of non-native heme coordination structures emerging upon guanidine hydrochloric acid-induced unfolding of Pseudomonas aeruginosa ferricytochrome c551 (2005)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, S. Nagatomo, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Jpn 78 ページ: 2019-2025
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] NMR studies of b-type hemoproteins reconstituted with a ring-fluorinated haem (2005)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Annu. Rep. NAM Spectrosc 57 ページ: 51-99
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Molecular design for increasing thermostability of cytochrome c (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, H. Sasaki, S. J. Takayama, S. Mikami, S. Kawano, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 21st Symposium on Biofunctional Chemistry
  • 発表場所: Kyouto Univ
  • 年月日: 2009-09-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Redox-dependent thermostability of cytochrome c and its functional consequences (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Kage, Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, Y. Sambongi, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2009-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Characterization of electron transfer from cytochrome cto blue copper proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, H. Tai, S. Mikami, K. Irie, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, T. Kawahara, N. Funasaki, A. Takabe, S. Hirota, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: Global COE in Chemistry, Nagoya Special Symposium
  • 発表場所: Nagoya Univ
  • 年月日: 2009-03-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NMR study of tetrameric hemoglobin (2008)
  • 著者名/発表者名: Y S. Nagao, S. Nagatomo, Y. Yamamoto, and A. Suzuki
  • 学会等名: 21st Symposium on Biofunctional Chemistry
  • 発表場所: Kyouto Univ
  • 年月日: 2008-09-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Molecular design of heme-DNA complex using the scaffold of G-quadruplex DNA dimer (2008)
  • 著者名/発表者名: N. Sakuma, H. Ujiie, S. Kawano, H. Hemmi, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Electrostatic interaction between the terminal helices of cytochrome c and its contribution to the protein stability (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Kage, K. Brie, H. Tai, S. Mikami, S. Kawano, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Characterization of internal mobility of heme active site in Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Iirie, H. Hemmi, S. Kawano, S. J. Takayama, E. Iwao, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] The effects of conformational change of a loop region adjacent to heme on the redox function of cytochrome c (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, T. Udagawa, K. Irie, S. J. Takayama, H. Tai, S. Kawano, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NMR characterization of Fe-His coordination bond of hemoprotein bearing a C_2 symmetric fluorinated heme (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Mizuseki, T. Miyazaki, T. Shibata, H. Furuichi, S, Nagatomo, S. Kawano, Y. Yamamoto and A. Suzuki
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Stability of the coordination bond between heme and Nterminal amino group of denatured cytochrome c (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, T. munegumi, S. Nagatomo, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] In-cell NMR characterization of functional properties of hemoglobin tetramer (2008)
  • 著者名/発表者名: A. Sato, S, Nagatomo, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 88th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Rikkyo Univ
  • 年月日: 2008-03-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Regulation of redox potential of PP aeruginosa cytochrome c through alteration of electrostatic environment around heme 17-propionic acid (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, K. Irie, S. J. Takayama, H. Tai, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: Global COE in Chemistry, Nagoya Special Symposium
  • 発表場所: Nagoya Univ
  • 年月日: 2008-03-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Role of heme 17propionic acid in the regulation of redox potential of Psedomonas aeruginosa cytochrome c551 (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, K. Irie, S. J. Takayama, H. Tai, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: First International Symposium on Interdisciplinary Materials Science
  • 発表場所: Tsukuba City
  • 年月日: 2008-03-13
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Electron transfer from cytochrome c to blue copper Proteins (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Irie, S. J. Takayama, H. Tai, S. Mikami, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, T. Kawahara, N. Funasaki, A. Takabe, S. Hirota, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: First International Symposium on Interdisciplinary Materials Science
  • 発表場所: Tsukuba City
  • 年月日: 2008-03-13
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural and functional properties of heme-DNA complex (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, S. Kawano, and S, Nagatomo
  • 学会等名: 5th Workshop on Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules
  • 発表場所: Nara City
  • 年月日: 2008-01-24
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Systematic arrangement of heme complexes in the framework of coordination space provided by Gquadruplex DNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto
  • 学会等名: Third International Symposium on Chemistry of Coordination Space-ISCCS 2007
  • 発表場所: Awaji City
  • 年月日: 2007-12-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Thermodynamics of dimerization of parallel G-quadruplex DNAs through the end-to-end stacking of 3'-terminal G-quartets (2007)
  • 著者名/発表者名: N. Sakuma, M. Ozawa, S. Kawano, H. Mita, H. Hemmi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2007-11-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NMR Characterization of Hemoproteins Reconstituted with Fluorinated Hemes (2007)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, S. Nagao, K. Mizuseki, S. Kawano, S, Nagatomo, and A. Suzuki
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Field dependence study of ^19F NMR signal of hemoprotein reconstituted with a ring fluorinated heme (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Miyazaki, S. Nagao, Y. Hirai, S, Nagatomo, Y. Yamamoto, and A. Suzuki
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NMR study of the acid-alkaline transition of metmyoglobin and methemoglobin bearing a fluorinated heme (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, K. Mizuseki, S. Nagao, Y. Hirai, S. Kawano, S, Nagatomo, Y. Yamamoto, and A. Suzuki
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Dimerization of parallel G-quadruplex DNAs formed from d(TTAG_3) and the related sequences (2007)
  • 著者名/発表者名: N. Sakuma, M. Ozawa, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] N-terminal amino group-heme ligation structure emerging upon GdnHCI-induced unfolding of Hydrogenobactor thermophilus cytochrome c552 (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] High pressure NMR studies on internal dynamics of thermophile Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 (2007)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, S. Mikami, S. Kawano, Y. Yamamoto, H. Hemmi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Regulation of redox potential of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 through alteration of electrostatic around heme 17-propionic acidenvironment (2007)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, S. J. Takayama, H. Tai, K. Irie, M. Kage, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Effects of structural change in hydrophobic core of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 in its thermostability (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Irie, Y. Takahashi, S. J. Takayama,S. Mikami, M. Kage, H. Tai, S. Kawano, and Y Yamamoto
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Contribution of the loop region containing axial Met6l to overall protein stability of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 (2007)
  • 著者名/発表者名: M. Kage, T. Udagawa, S. J. Takayama, H. Tai, S. Mikami, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 16th Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
  • 発表場所: Kenting, Taiwan
  • 年月日: 2007-10-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Study of electron transfer from cytochromes c to blue copper proteins (2007)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, T. Kawahara, S. Hirota, A. Takabe, Y. Takahashi, H. Tai, S. Mikami, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 22nd Symposium on Biofunctional Chemistry
  • 発表場所: Sendai City
  • 年月日: 2007-09-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Effects of structural change in hydrophobic core of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome cts2 in its redox properties and thermostability (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Irie, Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, Y. Yamamoto
  • 学会等名: 57th Annual Meeting of the Coordination Chemistry of Japan
  • 発表場所: Nagoya Inst. Tech
  • 年月日: 2007-09-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Paramagnetic NMR characterization of non-native heme coordination structure emerging upon guanidine hydrochloric acid-induced unfolding of cytochrome c (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, S. J. Takayama, S. Kawano, S, Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 46th Annual Meeting of the NMR Society of Japan
  • 発表場所: Sapporo City
  • 年月日: 2007-09-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Reorganization energy of electron transfer from cytochrome c to blue copper proteins (2007)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, H. Tai, S. Mikami, K. Irie, M. Kage, S. Kawano, T. Kawahara, N. Funasaki, A. Takabe, S. Hirota, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 13th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
  • 発表場所: Vienna, Austria
  • 年月日: 2007-07-18
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural and functional properties of heme-DNA Complex (2007)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, S. Kawano, and H. Mita
  • 学会等名: 13th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
  • 発表場所: Vienna, Austria
  • 年月日: 2007-07-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Regulation of redox potential of cytochrome cthrough alteration of electrostatic environment around heme 17-propionic acid (2007)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, S. J. Takayama, H. Tai, K. Irie, M. Kage, S. Kawano, S, Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 34th Meeting on Biomolecular Science
  • 発表場所: Tohoku Univ
  • 年月日: 2007-06-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Relationship between packing density and thermostability of cytochrome c (2007)
  • 著者名/発表者名: S. Kawano, Y. Takahashi, H. Sasaki, S. J. Takayama, S. Mikami, K. Irie, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 7th Annual Meeting of Protein Science of Japan
  • 発表場所: Sendai City
  • 年月日: 2007-05-24
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Complex formation of G-quadruplex DNA with an iron-porphyrin complex possessing cationic side chains (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Fujisaki, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Combinatorial dimerization of all-parallel G-quadruplex DNAs and its thermodynamics (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, M. Ozawa, S. Kawano, H. Hemmi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Influence of structure change around the hydrophobic core of Hydrogenobactor thermophilus cytochrome c552 on of Hydrogenobactor thermophilus cytochrome c552 on the thermal stability and the redox potential of the protein (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Irie, Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, Y. Sambongi, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Study of electron transfer from cytochromes c possessing a series of redox potentials to plastocyanin (2007)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, S. Hirota, Y. Takahashi, H. Tai, S. Mikami, S. Kawano, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Alteration of hydrogen bond network at the active site of Pseudomonas aerugmosa cytochrome c551 through amino acid substitutions and its structural and functional consequences (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Udagawa, S. Mikami, H. Tai, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Effect of a series of amino acid substitutions on the structure -function relationship of cytochrome c (2007)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, K. Irie, Y. Sambongi, S. Kawano,H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Characterization of non-native heme coordination structures emerging upon guanidine hydrochloride induced unfolding of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, T. Udagawa, Y. Sambongi, S. Kawano, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Analysis of the acid-alkaline transition in human adult and fetal tetrameric hemoglobins and their isolated chains (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, S. Nagao, S. Kawano, H. Mita, S. Nagatomo, S. Hamada, H. Yoshikawa, H. Tsunoda, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 87th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
  • 発表場所: Kansai Univ
  • 年月日: 2007-03-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Dynamics and thermodynamics of the dimerization of G-quadruplex DNA in the presence of various cations (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, M. Ozawa, T. Fujisaki, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 4th Workshop on Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules
  • 発表場所: Kyoto City
  • 年月日: 2006-12-18
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Special arrangement of heme-DNA coordination complex with G-quadruplex DNA and development of heme-DNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto
  • 学会等名: Second International Symposium on Chemistry of Coordination Space -ISCCS 2006
  • 発表場所: Fukuoka
  • 年月日: 2006-12-15
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Enhancement of the thermostability of Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 through reinforcement of the hydrophobic core of the protein interior (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, S. Kawano, S. Mikami, H. Mita, H. Sasaki, Y. Takahashi, and S. J. Takayama
  • 学会等名: 9th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry
  • 発表場所: Napoli, Italy
  • 年月日: 2006-12-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Effects of cations on dynamics and thermodynamics of dimerization of G-quadruplex DNA (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, Y. Kato, M. Ozawa, T. Fujisaki, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 33rd Symposium of Nucleic Acid Chemistry
  • 発表場所: Osaka Univ
  • 年月日: 2006-11-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] High pressure NMR studies on internal dynamics of redox active protein cytochrome c (2006)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, S. Mikami, H. Tai, S. Kawano, H. Mita, Y. Yamamoto, Y. Sambongi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 学会等名: 55th Annual Meeting of Polymer Society of Japan
  • 発表場所: Toyama Univ
  • 年月日: 2006-09-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Spectroscopic and electrochemical properties of heme-DNA Complex (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, T. Ohyama, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 56th Annual Meeting of the Coordination Chemistry of Japan
  • 発表場所: Hiroshima Univ
  • 年月日: 2006-09-16
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural and thermodynamic analyses of dimerization of G-quadruplex DNA and effects of various cations on the thermodynamics of the dimerization (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, Y. Kato, T. Ohyama, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: XXIIND International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Gottingen, German
  • 年月日: 2006-08-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Characterization of internal dynamics of thermophile Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c Using High Pressure NMR (2006)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, S. Mikami, S. Nagatomo, H. Mita, Y. Yamamoto, Y. Sambongi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 学会等名: XXIIND International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Gottingen, German
  • 年月日: 2006-08-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural and functional properties of heme-DNA complex and hemoproteins (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, Y. Kato, T. Ohyama, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 33rd Meeting on Biomolecular Science
  • 発表場所: Nagoya Inst. Tech
  • 年月日: 2006-07-14
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Enhancement of thermostability of H thermophilus cytochrome aa2 through stabilization of hydrophobic core (2006)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, H. Sasaki, Y. Takahashi, S. Mikami, Y. Sambongi, S. Nagatomo, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 4th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Rome, Italy
  • 年月日: 2006-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Non-native heme coordination structure emerging upon guanidine hydrochloric acid-induced unfolding of Pseudomonas aeruginosa ferricytochrome c551 (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, S. Nagatomo, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 4th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Rome, Italy
  • 年月日: 2006-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Influence of a single amide group in the close proximity of heme on the redox function of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, S. J. Takayama, S. Mikami, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 4th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Rome, Italy
  • 年月日: 2006-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NAM study of hemoproteins bearing a fluorinated heme (2006)
  • 著者名/発表者名: S. Nagao, S, Nagatomo, H. Mita, Y. Yamamoto, and A. Suzuki
  • 学会等名: 4th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Rome, Italy
  • 年月日: 2006-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Functional properties of heme-DNA complex (2006)
  • 著者名/発表者名: T. Ohyama, Y. Kato, S. Fukushima, Y. Nakamura, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 1st Symposium of Host-Guest Chemistry
  • 発表場所: Tsukuba City
  • 年月日: 2006-05-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Dimerization of parallel G-quadruplex DNAs formed from d(TTAG_3) (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Mita, T. Ohyama, Y. Kato, S. Nagatomo, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] ^19F NMR study of b-type hemoproteins bearing a fluorinated heme (2006)
  • 著者名/発表者名: S. Nagao, S, Nagatomo, H. Mita, Y. Yamamoto, and A. Suzuki
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] NMR study of effect of phosphate ion on the acid-alkaline transition in human adult and fetal tetrameric ferrihemoglobins (2006)
  • 著者名/発表者名: S. Nagatomo, S. Nagao, H. Mita, S. Hamada, H. Tsunoda, H. Yoshikawa, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] High Pressure NMR Study of protein dynamics of Thermophile Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 (2006)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, H. Tai, S. Mikami, Y. Yamamoto, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural characterization of unfolding intermediates emerging upon guanidine hydrochloric acid-induced denaturation of Thermophile Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 (2006)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, T. Udagawa, S. J. Takayama, S. Mikami, Y. Sambongi, S. Nagatomo, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Effects of alteration in heme active site electronic structure on the thermostability and redox properties of cytochrome c (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Takahashi, S. J. Takayama, H. Tai, S. Mikami, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Relationship between protein dynamics and thermostability of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 (2006)
  • 著者名/発表者名: T. Udagawa, H. Tai, S. J. Takayama, S. Mikami, H. Mita, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Relationship between protein dynamics and redox potential of cytochrome c (2006)
  • 著者名/発表者名: S. Mikami, S. J. Takayama, H. Tai, Y. Takahashi, H. Mita, Y. Sambongi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 06-01NMR Workshop
  • 発表場所: Univ. of Tsukuba
  • 年月日: 2006-05-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] High Pressure NMR Study of Thermophile Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 (2006)
  • 著者名/発表者名: S. J. Takayama, Y. Takahashi, H. Tai, S. Mikami, H. Sasaki, S. Hirota, H. Mita, Y. Yamamoto, Y. Sambongi, H. Hemmi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka
  • 学会等名: 47th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: Pacific Grove, California, USA
  • 年月日: 2006-04-24
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [備考]
  • URL: http://www.chem.tsukuba.ac.jp/yamamoto/