エクスカベート類の微細構造・分子形質比較解析による初期真核生物像の探究

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 17370029
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 井上 勲 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (70168433)
• 研究分担者: 橋本 哲男 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (50208451) ; 中山 剛 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 講師 (40302369)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2008
• キーワード: エクスカベート / 系統分類 / 微細構造 / 分子系統

研究概要

自然界より多数のエクスカベート, 新規分類群を含むさまざまなプロティストを単離し, 培養株を作成した。作成株を含む多様なプロティストに関して分子系統・微細構造解析を行った結果, エクスカベート類はさまざまな特徴(特に鞭毛根系)を共有するものの, その単系統性は支持されなかった。詳細な比較検討から, このようなエクスカベートの微細構造的特徴は, 部分的にさまざまな真核生物にも見られることが判明した。このことはエクスカベートに見られる共通性が多くの真核生物の共通祖先に起因するものであることを示唆しており, 原始真核生物はエクスカベート様の細胞構造をもった捕食性鞭毛虫であったと考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] a new nucleariid species isolated from Yunoko Lakein Nikko (Japan) (2009)
  • 著者名/発表者名: M Yoshida, T Nakayama, I Inouye Nuclearia thermophila sp. nov. (Nucleariidae)
  • 雑誌名: European Journal of Protistology in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences : the relationship between red algae and green plants as a case study (2009)
  • 著者名/発表者名: Y Inagaki, Y Nakajima, M Sato, M Sakaguchi, and T Hashimoto
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol 26 ページ: 1171-1178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophytes assemblage : Separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads (2009)
  • 著者名/発表者名: M Sakaguchi, K Takishita, T Matsumoto, T Hashimoto, & Y Inagaki
  • 雑誌名: Gene 441 ページ: 126-131
  • 査読あり
• [雑誌論文] A unique life cycle and perennation in a colorless chrysophyte Spumella sp (2008)
  • 著者名/発表者名: Yubuki N, Nakayama T, & Inouye I
  • 雑誌名: Journal of Phycology 44 ページ: 164-172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origins of plastids and glyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase genes in the green-colored dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum (2008)
  • 著者名/発表者名: K Takishita, M Kawachi, M-H Noel, T Matsumoto, N Kakizoe, M M Watanabe, I Inouye, K Ishida, T Hashimoto & Y Inagaki
  • 雑誌名: Gene 410 ページ: 26-36
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary analysis of synteny and gene fusion for pyrimidine biosynthetic enzymes in Euglenozoa: an extraordinary gap between Kinetoplastids and Diplonemids (2008)
  • 著者名/発表者名: T Makiuchia, T Annouraa, T Hashimotob, EMurata, T Aokia & T Nara
  • 雑誌名: Protist 159 ページ: 459-470
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution and phylogeny of the heterogeneous cytosolic SSU rRNA genes in the genus Plasmodium. Mol. Phylogenet (2008)
  • 著者名/発表者名: Y Nishimoto, N Arisuec, S Kawai, AA Escalante, T Horii, K Tanabe, T Hashimoto
  • 雑誌名: Evol 47 ページ: 45-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aurearenophyceae classis nova, a new class of Heterokontophyta based on a new marine unicellular alga Aurearena cruciata gen. et sp. nov. inhabiting sandy beaches (2008)
  • 著者名/発表者名: A Kai, Y Yoshii, T Nakayama & I Inouye
  • 雑誌名: Protist 159 ページ: 435-457
  • 査読あり
• [雑誌論文] 複数遺伝子の結合データに基づく分子系統樹の推測-真核生物の大系統の解析を例として- (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男, 有末伸子, 坂口美亜子, 稲垣祐司
  • 雑誌名: 統計数理 56 ページ: 145-164
• [雑誌論文] Phylogeny and ultrastructure of Nephroselmis and Pseudoscourfieldia (Chlorophyta), including the description of Nephroselmis anterostigmatica sp. Nov (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakayama T, Suda S, Kawachi M, Inouye I
  • 雑誌名: Phycologia 46 ページ: 680-697
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrastructure and Ribosomal RNA Phylogeny of the Free-Living Heterotrophic Flagellate Dysnectes brevis n. gen., n. sp., a New Member of the Fornicata (2007)
  • 著者名/発表者名: Yubuki, N., Inagaki, Y., Nakayama, T. & Inouye, I
  • 雑誌名: Journal of Eukaryotic Microbiology 54 ページ: 191-200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Occurrence of multiple, independent gene fusion events for the fifth and sixth enzymes of pyrimidine biosynthesis in different eukaryotic groups (2007)
  • 著者名/発表者名: T Makiuchi, T Nara, T Annoura, T Hashimoto & T Aoki
  • 雑誌名: Gene 394 ページ: 78-86
  • 査読あり
• [雑誌論文] Centrohelida is still searching for phylogenetic home: molecular data analyses of seven Raphidiophrys contractilis genes (2007)
  • 著者名/発表者名: M Sakaguchi, Y Inagaki, T Hashimoto
  • 雑誌名: Gene 405 ページ: 47-54
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrastructural and phylogenetic studies on Blastocystis isolates from cockroaches (2007)
  • 著者名/発表者名: Yoshikawa H, Wu Z, Howe J, Hashimoto T, Geok-Choo N, Tan KS.
  • 雑誌名: Journal of Eukaryotic Microbiology 54 ページ: 33-37
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recent independent evolution of msp1 polymorphism in Plasmodium vivax and related simian malaria parasites (2007)
  • 著者名/発表者名: K Tanabe, A Escalante, N Sakihama, M Honda, N Arisue, T Horii, R Culleton, T Hayakawa, T Hashimoto, S Longacre, S Pathirana, S Handunnetti & H Kishino
  • 雑誌名: Mol. Biochem. Parasitol 159 ページ: 74-79
  • 査読あり
• [雑誌論文] A haptophyte bearing siliceous scales : ultrastructure and phylogenetic position of Hyalolithus neolepis gen. et sp. Nov(Prymnesiophyceae, Haptophyta) (2006)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, M., Noel, M-H., Nakayama, T. & Inouye, I
  • 雑誌名: Protist 157 ページ: 213-234
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogenetic relationships and taxonomy of sarcinoid green algae : Chlorosarcinopsis, Desmotetra, Sarcino-chlamys gen. nov., Neochlorosarcina, and Chlorosphaeropsis (Chlorophyceae, Chloro-phyta) (2006)
  • 著者名/発表者名: Watanabe S, Mitsui M, Nakayama T & Isao Inouye
  • 雑誌名: Journal of Phycology 42 ページ: 679-695
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hatena arenicola gen. et sp. nov., a katablepharid undergoing probable plastid acquisition (2006)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, N. & Inouye, I
  • 雑誌名: Protist 157 ページ: 401-419
  • 査読あり
• [雑誌論文] シアノバクテリアが歩んだ道-真核光合成生物の進化と多様化- (2006)
  • 著者名/発表者名: 井上勲
  • 雑誌名: 遺伝 60 ページ: 15-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] 二次共生による植物の多様化 (2006)
  • 著者名/発表者名: 岡本典子・井上勲
  • 雑誌名: 化学と生物 44 ページ: 785-789
  • 査読あり
• [雑誌論文] The katablepharids are a distant sister group of the Cryptophyta : A proposal for Katablepharidophyta divisio nova/Kathablepharida phylum novum based on SSU rDNA and beta-tubulin phylogeny (2005)
  • 著者名/発表者名: Okamoto N & Inouye I
  • 雑誌名: Protist 156 ページ: 163-179
  • 査読あり
• [雑誌論文] A secondary symbiosis in progress? (2005)
  • 著者名/発表者名: Okamoto N & Inouye I
  • 雑誌名: Science 310 ページ: 287-287
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny of the centrohelida inferred from SSU rRNA, tubulins, and actin genes (2005)
  • 著者名/発表者名: M Sakaguchi, T Nakayama, T Hashimoto, I Inouye
  • 雑誌名: J. Mol. Evol 61 ページ: 765-775
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alternative oxidase (AOX) genes of African trypanosomes: phylogeny and evolution of AOX and plastid terminal oxidase families (2005)
  • 著者名/発表者名: T. Suzuki, T. Hashimoto, Y. Yabu, P.A. Majiwa, S. Ohshima, M. Suzuki, S. Lu, M. Hato, Y. Kido, K. Sakamoto, K. Nakamura, K. Kita and N. Ohta
  • 雑誌名: J. Eukaryot. Microbiol 52 ページ: 374-381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variation of siphonaxanthin series among the genus Nephroselmis (Prasinophyceae, Chlorophyta), including a novel primary methoxy carotenoid (2005)
  • 著者名/発表者名: Y Yoshii, S Takaichi, T Maoka, S Suda , H Sekiguchi, T Nakayama & I Inouye
  • 雑誌名: J. Phycol 41 ページ: 827-34
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrastructure and phylogenetic position of Chrysoculter rhomboideus gen. et sp. nov. (Prymnesio-phyceae), a new flagellate haptophyte from Japanese coastal waters (2005)
  • 著者名/発表者名: T. Nakayama, M. Yoshida, M.-H. Noel, M. Kawachi & I. Inouye
  • 雑誌名: Phycologia 44 ページ: 369-383
  • 査読あり
• [学会発表] ペディノ藻綱(緑藻植物門)の系統 (2009)
  • 著者名/発表者名: 篠崎文彦・中山剛・矢吹彬憲・井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第33回大会
  • 発表場所: 琉球大学
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 新規ピコソエカ類Gyroflagellum natansの微細構造と系統 (2008)
  • 著者名/発表者名: 中山剛・佐藤真由美・山口晴代・井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第32回大会
  • 発表場所: 東京海洋大学
  • 年月日: 2008-03-22
• [学会発表] 6種の遺伝子を用いたプラシノ藻の分子系統解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 千國友子・中山剛・井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第32回大会
  • 発表場所: 東京海洋大学
  • 年月日: 2008-03-22
• [学会発表] 1+1=1 : 植物になる進化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 井上勲
  • 学会等名: 日本進化学会第9回大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2007-09-01
• [学会発表] 新規ディクティオカ藻Florenciella uniflagellataの分類とディクティオカ藻の進化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 中山剛・河地正伸・井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第31回大会
  • 発表場所: 日本藻類学会第31回大会
  • 年月日: 2007-03-25
• [図書] 藻類30億年の自然史-藻類からみる生物進化 (2006)
  • 著者名/発表者名: 井上勲
  • 総ページ数: 472
  • 出版者: 東海大学出版会
• [図書] 微生物の世界 (2006)
  • 著者名/発表者名: 宮道慎二・奥田徹・井上勲・後藤俊幸(編)
  • 総ページ数: 213
  • 出版者: 筑波出版会