創薬シーズ探索のための「Cancer Cell Informatics」の開発と応用

2007 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17390032
• 研究機関: (財)癌研究会
• 研究代表者: 矢守 隆夫 財団法人癌研究会, 癌化学療法センター・分子薬理部, 部長 (60200854)
• 研究分担者: 旦 慎吾 財団法人癌研究会, 癌科学療法センター分子薬理部, 研究員 (70332202)
• キーワード: Cancer Cell Informatics / 分子標的予測 / がん / がん細胞パネル / PI3K / 薬剤感受性 / 抗がん剤探索 / データベース

研究概要

がん細胞パネルについて化合物感受性情報とゲノム情報を集積し、化合物とその分子標的の対応関係の予測ならびに抗がん剤分子薬理研究に有用な情報を得るための基盤情報システム(Cancer Cell Infomatics、CCIと略)の構築と応用を行った。
1、CCIの構築本研究の中心となるJFCR39(9臓器由来のがん39株からなるがん細胞パネル)について新たに123種の阻害剤に対する感受性情報を取得した。JFCR45(胃がん21株、肝がん12株、乳がん12株からなるがん細胞パネル)について新たにGeneChipを用いゲノムワイドな遺伝子発現情報を取得した。以上の惰報を、昨年度作成した化合物感受性情報とゲノム情報の統合データベース(DRAMA)に加えた。DRAMAに登録された各々の化合物、遺伝子およびその産物は、いずれもがん細胞パネルを介したフィンガープリント(FPと略、詳細は調書参照)として描出される。FPの類似性を評価するプログラム(COMAPREおよびBIOCOMPARE)をバージョンアップした。FPの相互比較により、分子標的に共通性のある化合物の組み合わせ、あるいは、ミサイルと標的の関係にある化合物と遺伝子産物の組み合わせを予測することが本研究の狙いである。本年度もDRAMAのデータ量は着実に増加し、予測能力が向上した。
2、CCIの成果と応用CCIを155種の毒性化学物質評価に応用した。評価可能であった90化合物をFPに基づきクラスター解析した結果、同一クラスターに属するものは共通の作用メカニズムをもつ傾向が見られた。よって、CCIは毒性化学物質の作用メカニズム予測にも有用と考えられる。一方、CCIによって新たなメカニズムを持つことが示唆される新規抗がん剤候補物質が見出された。
次年度はDRAMAをさらに充実させ本研究を発展させる計画である。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis of hybrid acetogenins,alpha,beta-unsaturated-gamma-lactone-free nitrogen-containing heterocyclic analogues,and their cytotoxicity against human cancer cell lines (2008)
  • 著者名/発表者名: Kojima N, Fushimi T, Maezaki N, Tanaka T, Yamori T.
  • 雑誌名: Bioorg Med Chem Lett. (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and pharmacological evaluation of the novel pseudo-symmetrical tamoxifen derivatives as anti-tumor agents (2008)
  • 著者名/発表者名: Shiina I, Sano Y, Nakata K, Kikuchi T, Sasaki A, Ikekita M, Nagahara Y, Hasome Y, Yamori T, Yamazaki K.
  • 雑誌名: Biochem Pharmacol 75(5) ページ: 1014-1026
  • 査読あり
• [雑誌論文] Motif-programmed artificial protein induces apoptosis in several cancer cells by disrupting mitochondria (2008)
  • 著者名/発表者名: Saito H, Minamisawa T, Yamori T, Shiba K.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 99(2) ページ: 398-406
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anticancer mechanisms of YC-1 in human lung cancer cell line,NCI-H226 (2008)
  • 著者名/発表者名: Chen CJ, Hsu MH, Huang LJ, Yamori T, Chung JG, Lee FY, Teng CM, Kuo SC.
  • 雑誌名: Biochem Pharmacol 75(2) ページ: 360-368
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomics-based identification of biomarkers for predicting sensitivety to a PI3-kinase inhibitor in cancer (2007)
  • 著者名/発表者名: Akashi T, Nishimura Y, Wakatabe R, Shiwa M, Yamori T.
  • 雑誌名: Biochemical and biophysical research communications 352(2) ページ: 514-521
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel method for analyzing phosphoproteins using SELDI-TOF MS in combination with a series of recombinant proteins (2007)
  • 著者名/発表者名: Akashi T, Yamori T.
  • 雑誌名: Proteomics 7(14) ページ: 2350-2354
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variation in cytostatic constituents of a sponge-derived Gymnascella dankaliensis by manipulating the carbon source (2007)
  • 著者名/発表者名: Amagata T, Tanaka M, Yamada T, Doi M, Minoura K, Ohishi H, YamoriT, Numata A.
  • 雑誌名: Journal of natural products 70(11) ページ: 1731-1740
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enantioselective Total Synthesis of(+)-Ottelione A,(-)-Ottelione B,(+)-3-epi-Ottelione A and Preliminary Evaluation of Their Antitumor Activity (2007)
  • 著者名/発表者名: Araki H, Inoue M, Suzuki T, Yamori T, Kohno M, Watanabe K, Abe H, Katoh T.
  • 雑誌名: Chemistry 13(35) ページ: 9866-9881
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and structure-activity relationships of taxuyunnanine C derivatives as multidrug resistance modulator in MDR cancer cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Bai J, Dai J, Bai L, Sakai J, Nishizawa S, Bai Y, Kikuchi M, Abe M, Yamori T, TomidaA, Tsuruo T, Hirose K, Ando M.
  • 雑誌名: Bioorganic&medicinal chemistry letters 17(13) ページ: 3722-3728
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of in vivo ESR/spin-probe technique to monitor tumor in vivo in mouse footpad (2007)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa K, Sakabe E, Kuninobu K, Yamori T, Tsuruo T, Yao T, Tsuneyoshi M, Utsumi H.
  • 雑誌名: Antioxidants&redox signaling 9(10) ページ: 1699-1707
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative profiling of the gene expression for estrogen responsiveness in cultured human cell lines (2007)
  • 著者名/発表者名: Inoue A, Seino Y, Terasaka S, Hayashi S, Yamori T, Tanji M, Kiyama R.
  • 雑誌名: Toxicol In Vitro 21(4) ページ: 741-752
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development and characterization of a model of liver metastasis using human colon cancer HCT-116 cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishizu K, Sunose N, Yamazaki K, Tsuruo T, Sadahiro S, Makuuchi H, Yamori T.
  • 雑誌名: Biological&pharmaceutical bulletin 30(9) ページ: 1779-1783
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marine diterpenoids with a briarane skeleton from the Okinawan soft coral Pachyclavularia violacea (2007)
  • 著者名/発表者名: Ito H, Iwasaki J, Sato Y, Aoyagi M, Iguchi K, Yamori T.
  • 雑誌名: Chemical&pharmaceutical bulletin 55(12) ページ: 1671-1676
  • 査読あり
• [雑誌論文] ZSTK474 is an ATP-competitive inhibitor of class I phosphatidylinosito 13 kinase isoforms (2007)
  • 著者名/発表者名: Kong D, Yamori T.
  • 雑誌名: Cancer science 98(10) ページ: 1638-1642
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sesquiterpenoids and flavonoids from the aerial parts of Tithonia diversifolia and their cytotoxic activity (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuroda M, Yokosuka A, Kobayashi R, Jitsuno M, Kando H, Nosaka K, Ishii H, Yamori T, Mimaki Y.
  • 雑誌名: Chemical&pharmaceutical bulletin 55(8) ページ: 1240-1244
  • 査読あり
• [雑誌論文] Urukthapelstatin A, a novel cytotoxic substance from marine-derived Mechercharimyces asporophorigenens YM11-542.I.Fermentation,isolation and biological activities (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsuo Y, Kanoh K, Yamori T, Kasai H, Katsuta A, Adachi K, Shin-Ya K, Shizuri Y.
  • 雑誌名: The Journal of antibiotics 60(4) ページ: 251-255
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel candidate compound with urethane structure for anticancer drug development (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka A, Isama K, Tanimura S, Kohno M, Yamori T.
  • 雑誌名: Current drug discovery technologies 4(2) ページ: 69-76
  • 査読あり
• [雑誌論文] Absolute quantification of four isoforms of the class I phosphoinositide-3-kinase catalytic subunit by real-time RT-PCR (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakamura H, Dan S, Akashi T, Unno M, Yamori T.
  • 雑誌名: Biological&pharmaceutical bulletin 30(6) ページ: 1181-1184
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation of Action Mechanisms of Toxic Chemicals Using JFCR39,a Panel of Human Cancer Cell Lines (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakatsu N, Nakamura T, Yamazaki K, Sadahiro S, Makuuchi H, Kanno J, Yamori T.
  • 雑誌名: Mol Pharmacol 72(5) ページ: 1171-1180
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of JTP-70902,a p15(INK4b)-inductive compound,as a novel MEK1/2 inhibitor (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Yoshida T, Kurachi R, Kakegawa J, Hori Y, Nanayama T, Hayakawa K, Abe H, Takagi K, Matsuzaki Y, Koyama M, Yogosawa S, Sowa Y, Yamori T, Tajima N, Sakai T.
  • 雑誌名: Cancer science 98(11) ページ: 1809-1816
  • 査読あり
• [雑誌論文] Iaziovianin A,a new isoflavone,from the leaves of Ateleia glazioviana and its cytotoxic activity against human cancer cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokosuka A, Haraguchi M, Usui T, Kazami S, Osada H, Yamori T, Mimaki Y.
  • 雑誌名: Bioorganic&medicinal chemistry letters 17(11) ページ: 3091-3094
  • 査読あり
• [学会発表] Cancer Cell Informaticsとは〜その分子標的治療薬の創薬への応用〜 (2008)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 学会等名: 北里大学薬学部公開シンポジウム
  • 発表場所: 北里大学
  • 年月日: 2008-02-22
• [学会発表] Informatics-guided identification of candidates for new drug,target and biomarker based on JFCR39 (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamori T.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] Proteomic screening for signaling proteins involved in PI3-kinase pathways by using SELDT-TOF MS (2007)
  • 著者名/発表者名: Akashi T, Yaguchi S, Yamorit.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] Promoter methylation of WRN gene in cancer (2007)
  • 著者名/発表者名: Okui M, Yamori T, Nakagawa K, Ishikawa Y.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] ZSTK474 inhibits class I PI3 kinase isoforms competitively with ATP (2007)
  • 著者名/発表者名: Kong D, Yaguchi S, Yamori T.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] MELl cooperates with c-ski to repress TGF-beta signal in gingastric cancer cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Takahata M, Koinuma D, inazawa J, Yamori T, Miyazawa K, Miyazono K, Imamura T.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] PI3K inhibitor,down-regulates CDC25A and induces G_1,phase cell cycle arrest in human cancer cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Dan S, Mukai Y, Yaguchi S, Yamori T.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] PIK3CA mutations in JFCR-39 human cancer cell lines. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sugita H, Dan S, Nakamura H, Yamori T.
  • 学会等名: 66-th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 20071003-05
• [学会発表] PI3キナーゼを標的とする新規分子標的薬候補ZSTK474 (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 学会等名: 第16回日本がん転移学会総会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 20070709-10
• [学会発表] 新規PI3キナーゼ阻害剤ZSTK474による抗腫瘍効果の分子機構の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 旦 慎吾, 向井 由美子, 矢口 信一, 矢守 隆夫
  • 学会等名: 第11回がん分子標的治療研究会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20070705-06
• [学会発表] 新規PI3K阻害剤ZSTK474の分子薬理機序の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 孔 徳新, 矢守 隆夫
  • 学会等名: 第11回がん分子標的治療研究会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20070705-06
• [学会発表] 山菜のシゲト(モミジガサ)から単離されたピサボラン型セスキテルペ'ンエンドパーオキサイドの抗癌活性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 西川 耕司, 山田 京平, 土屋 英子, 矢守 隆夫, 木村 賢一
  • 学会等名: 第11回がん分子標的治療研究会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20070705-06
• [学会発表] Identification of candidates for new drug,target and biomarker by mining data sets from a panel of human cancer cell lines:JFCR39 (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamori T.
  • 学会等名: MBI Chemogenomics Workshop
  • 発表場所: Ohio,USA
  • 年月日: 20070508-10
• [学会発表] Epigenetic silencing of the RecQ helicase genes in Japanese lung cancer (2007)
  • 著者名/発表者名: Okui M, Ishikawa Y, Yamori T, Nakagawa K.
  • 学会等名: The 98-th Am Assoc Cancer Res(AACR)Annual Meeting
  • 発表場所: Los Angeles,CA,U.S.A.
  • 年月日: 20070414-18
• [学会発表] Proteomic screening for biomarkers for predicting sensitivity to anticancer drugs by using SELDI-TOF MS (2007)
  • 著者名/発表者名: Akashi T, Nishimura Y, Shiwa M, Yamori T.
  • 学会等名: The 98-th Am Assoc Cancer Res(AACR)Annual Meeting
  • 発表場所: Los Angeles,CA,U.S.A.
  • 年月日: 20070414-18
• [学会発表] EGFR signal pathways selectively activated in lung adenocarcinoma (2007)
  • 著者名/発表者名: Hiramatsu M, Ninomiya H, Inamura K, Okui M, Satoh Y, Fujiwara M, Yamori T, Kitagawa T, Ishikawa Y.
  • 学会等名: The 98-th Am Assoc Cancer Res(AACR)Annual Meeting
  • 発表場所: Los Angeles,CA,U.S.A.
  • 年月日: 20070414-18
• [図書] 新規PI3キナーゼ阻害剤ZSTK474の抗がん活性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢口 信一, 矢守 隆夫
  • 総ページ数: 22-26
  • 出版者: 細胞The CELL
• [図書] 分子標的治療薬の開発と発展 (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 総ページ数: 63-67
  • 出版者: 日本病院薬剤師会雑誌
• [図書] クリニカルプラクティス (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 総ページ数: 231-232
  • 出版者: 分子標的治療薬
• [図書] Cancer Cell Informaticsとケミカルバイオロジー (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 総ページ数: 1690-1695
  • 出版者: 蛋白質核酸酵素
• [図書] 分子標的治療薬とは (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫
  • 総ページ数: 1819-1824
  • 出版者: 月刊薬事
• [図書] 特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績「化学療法基盤情報支援班」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第12報- (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫, 上原 至雅, 吉田 稔, 井上 正哉, 清宮 啓之, 水上 民夫, 川田 学, 長田 裕之, 松浦 正明
  • 総ページ数: 112-144
  • 出版者: 癌と化学療法
• [図書] 特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績「新しい戦略による抗がん剤のスクリーニングのための委員会」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第11報- (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢守 隆夫, 安藤 俊夫, 上原 至雅, 小野 真弓, 河野 通明, 済木 育夫, 内藤 幹彦, 早川 洋一, 鶴尾 隆, 吉田 稔, 杉本 芳一, 馬島 哲夫
  • 総ページ数: 1-111
  • 出版者: 癌と化学療法
• [産業財産権] PI3キナーゼ阻害剤の効果判定方法 (2007)
  • 発明者名: 明石 哲行、矢守 隆夫、岡村 睦美
  • 権利者名: 財団法人癌研究会
  • 産業財産権番号: 特願2007-218234
  • 出願年月日: 2007-08-24