フタバガキ科の網羅的系統解析のための材料採集と系統樹作製

2007 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17405032
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: SZMIDT Alfred E. 九州大学, 大学院・理学研究院, 准教授 (70325497)
• 研究分担者: 猪股 伸幸 九州大学, 大学院・理学研究院, 助教 (20301335)
• キーワード: population genetics / evolution / internet database

研究概要

1、タイへの10日間の旅程で、各地から30種以上のDipterocarpaceae(フタバガキ)科のサンプルを採集した。マングローブ2種(Rhizophora apiculata(フタバナヒルギ)and R.mucronata(ヤエヤマヒルギ))の採集も行った。さらに、中国南部でもDipterocarpaceae(フタバガキ)科のサンプルを採集した。
2、国際学術雑誌(Genes and Genetic Systems,Canadian Journal of Forest Research and Tree Genetics and Genomes)に3つの論文が掲載された。
3、九州大学にて、我々の研究グループから学士(学術)一人、博士(理学)三人を輩出した。
4、日本と英国で開催された各々の国際学会において発表を行った。
5、サンプル・データーベース用のウェブサーバーの OS を SuSE Linux 10.3最新版に変更した。我々のサンプル・データーベースのセキュリティーと検索効率の改善のため、ウェブ(Apache)とデーターベース(MySQL)エンジンを更新した。
6、160,000点以上を含む新規の文献データーベースを構築した。この新規データーベースは2007年に公開予定であったが、バックアップディスクの容量不足のため公開が遅れた。ディスクの容量を500GBに拡張できたので、まもなく公開予定である。

研究成果

• [雑誌論文] Phylogeography of Larix sukaczewii Dyl. and L.sibirica L. inferred from nucleotide variation of nuclear genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Araki, N.H.T., Khatab, I.A., Hemamali, K.K.G.U., Inomata, N., Wang, X-R. and Szmidt, A.E.
  • 雑誌名: Tree Genetics and Gennomes (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Demographic history and interspecific hybridization of four Shorea species(Dipterocarpaceae)from Peninsular Malaysia inferred from nucleotide polymorphism in nuclear gene regions (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishiyama, H., Inomata, N., Yamazaki, T., Ab Shukor, N.A. and Szmidt, A.E.
  • 雑誌名: Canadian Journal of Forest Research (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeography of Eurasian Larix species inferred from nucleotide variation in two nuclear genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Khatab, I.A., Ishiyama, H., Inomata, Wang, N., X-R. and Szmidt, A.E.
  • 雑誌名: Genes and Genetic Systems 83(1) ページ: 55-66
  • 査読あり
• [学会発表] Phylogeography of Eurasian Larix species inferred from nucleotide variation in two nuclear genes (2007)
  • 著者名/発表者名: I., Khatab, H., Ishiyama, N., Inomata A. E., Szmidt
  • 学会等名: 41-st Annual Meeting of the Population Genetics Group, University of Warwick, UK
  • 発表場所: Warwick, UK
  • 年月日: 20071217-20
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Demographic histoly of Larix sibirica and L.sukaczewii inferred from nucleotide variation of nuclear genes (2007)
  • 著者名/発表者名: Khatab, I., Ishiyama, H., Inomata, N. and Szmidt, A.E.
  • 学会等名: 79-th Meeting of the Genetic Society of Japan
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 20070919-21