• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2006 年度 研究成果報告書概要

新規ヘム酵素アルドキシム・デヒドラターゼの機能、多様性および生理学的意義の検討

研究課題

研究課題/領域番号 17580069
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関富山県立大学

研究代表者

加藤 康夫  富山県立大学, 工学部, 助教授 (20254237)

研究分担者 浅野 泰久  富山県立大学, 工学部, 教授 (00222589)
米田 英伸  富山県立大学, 工学部, 講師 (50285160)
青野 重利  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎統合共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (60183729)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
キーワードアルドキシム / ニトリル / アルドキシム-ニトリル経路 / 酵素 / 遺伝子 / スクリーニング / 微生物 / 反応機構
研究概要

本研究は、有機化学、酵素化学工学、蛋白質工学、微生物学等のさまざまな分野の知識・手法を総合的に駆使し、1)アルドキシム・デヒドラターゼの反応メカニズムの解明、2)アルドキシム・デヒドラターゼの多様性、3)アルドキシム-ニトリル経路の生理学的意義の解明、の3点を達成することである。当概目的を達成するために以下の検討を行った。
(1)アルドキシム・デヒドラターゼの大量供給法確立
Bacillus由来のアルドキシム・デヒドラターゼの遺伝子組換え大腸菌における高発現条件を確立し、本酵素を短時間・高収率かつ安定に迅速精製する条件を見出した。
(2)アルドキシム・デヒドラターゼの分子分光学的解析
高度に精製した本酵素を、EPR(電子スピン共鳴)、共鳴ラマン、電子吸収スペクトル等の分光学的手法により解析することで、本酵素に共通なヘムの配位状況、ヘム鉄の酸化度やスピン状態を決定し、これにより酵素反応時に関与する触媒残基の推定を行った。
(3)アルドキシム・デヒドラターゼの遺伝子スクリーニング
既知のアルドキシム・デヒドラターゼの保存領域をもとにしたオリゴヌクレオチドプライマーを用い、ハイブリダイゼーション法およびPCRにて、各種保存菌株中より本酵素遺伝子の増幅、遺伝子クローニングを行った。
(4)アルドキシム・デヒドラターゼの多様性の検討
得られた酵素遺伝子を発現させ、精製し、酵素学的諸性質を解明した。その性質と酵素蛋白の一次構造をもとに本酵素の多様性を検討した。
(5)「アルドキシム-ニトリル経路」中のニトリル分解酵素遺伝子スクリーニング
「アルドキシム-ニトリル経路」を有する菌株において、各種ニトリル分解酵素群の存在を、酵素・遺伝子的に検討した。
(6)「アルドキシム-ニトリル経路」の多様性と生理学的意義の検討
得られた酵素蛋白の一次構造をもとに本酵素の多様性を検討し、アルドキシム・デヒドラターゼの多様性と照らし合わせて、同経路の進化を考察した

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (15件)

  • [雑誌論文] VioE, a prodeoxyviolacein synthase involved in violacein biosynthesis, is responsible for intramolecular indole rearrangement2007

    • 著者名/発表者名
      S.Asamizu, Y.Kato, Y.Igarashi, H.Onaka
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters 48

      ページ: 2923-2926

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Purification and partial characterization of N-hydroxy-L-phenylalanine decarboxylase/oxidase from Bacillus sp. strain OxB-1, an enzyme involved in aldoxime biosynthesis in the "aldoxime nitrile pathway"2007

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, T.Tsuda, Y.Asano
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta 48(in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] VioE a prodeoxyviolacein synthase involved in violacein biosynthesis, is responsible for intramolecular indole rearrangement2007

    • 著者名/発表者名
      S.Asamizu, Y.Kato, Y.Igarashi, H.Onaka
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters 48

      ページ: 2923-2926

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Molecular and enzymatic analysis of the "aldoxime-nitrile pathway" in the glutaronitrile degrader Pseudomonas sp. K-92006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, Y.Asano
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology 70

      ページ: 92-101

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Spectroscopic substrate binding properties of heme-containing aldoxime dehydratases, OxdB and OxdRE2006

    • 著者名/発表者名
      K.Kobayashi, B.Pal, S.Yoshioka, Y.Kato, Y.Asano, T.Kitagawa, S.Aono
    • 雑誌名

      Journal of Inorganic Biochemistry 100

      ページ: 1069-1074

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Systematic regulation of the enzymatic activity of phenylacetaldoxime dehydratase by exogenous ligands2006

    • 著者名/発表者名
      K.Kobayashi, M.Kubo, S.Yoshioka, T.Kitagawa, Y.Kato, Y.Asano, S.Aono
    • 雑誌名

      ChemBioChem 7

      ページ: 2004-2009

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Direct formation of chromopyrrolic acid from indole-3-pyruvic acid by StaD, a novel hemoprotein in indolocarbazole biosynthesis2006

    • 著者名/発表者名
      S.Asamizu, Y.Kato, Y.Igarashi, T.Furumai, H.Onaka
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters 47

      ページ: 473-475

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] PmHNL catalyzed synthesis of (R)-cyanohydrins derived from aliphatic aldehydes2006

    • 著者名/発表者名
      S.Nanda, Y.Kato, Y.Asano
    • 雑誌名

      Tetrahedron : Asymmetry 17

      ページ: 735-741

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Systematic regulation of the enzymatic activity of phenylacetaldoxime dehydratase by exogenous ligands2006

    • 著者名/発表者名
      K.Kobayashi, M.Kubo, S.Yoshioka, T.Kitagawa, Y.Kato, Y.Asano, S.Aono
    • 雑誌名

      Chem Bio Chem 7

      ページ: 2004-2009

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Purification and characterization of aldoxime dehydratase of the head blight fungus, Fusarium graminearum2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, Y.Asano
    • 雑誌名

      Bioscience Biotechnology and Biochemistry 69

      ページ: 2254-2257

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Polymerase chain reaction for identification of aldoxime dehydratase in aldoxime- or nitrile-degrading microorganisms2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, S.Yoshida, Y.Asano
    • 雑誌名

      FEMS Microbilogy Letters 246

      ページ: 243-246

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Regulation of aldoxime dehydratase activity by redox-dependent change in the coordination structure of the aldoxime-heme complex2005

    • 著者名/発表者名
      K.Kobayashi, S.Yoshioka, Y.Kato, Y.Asano, S.Aono
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 280

      ページ: 5486-5490

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A new (R)-hydroxynitrile lyase from Prunus mume : asymmetric synthesis of cyanohydrins2005

    • 著者名/発表者名
      S.Nanda, Y.Kato, Y.Asano
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 10908-10916

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Polymerase chain reaction for identification of aldoxime dehydratase in aldoxime-or nitrile-degrading microorganisms2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, S.Yoshida, Y.Asano
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters 246

      ページ: 243-249

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Purification and partial characterization of N-hydroxy-L-phenylalanine decarboxylase/oxidase from Bacillus sp.strain OxB-1, an enzyme involved in aldoxime biosynthesis in the "aldoxime nitrile pathway",

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, T.Tsuda, Y Asano
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

URL: 

公開日: 2008-05-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi