臨床型DNAチップを用いた生検標本による大腸癌臨床診断システムの構築

2005 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17591396
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 竹政 伊知朗 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (50379252)
• 研究分担者: 山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184) ; 池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356) ; 関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
• キーワード: 大腸癌 / DNAチップ / 遺伝子発現プロファイル / 遣伝子診断システム / 生検標本

研究概要

本研究の目的は、DNAチップが持つ技術面、金銭面での問題点を改善し、これまでにわれわれが培ってきたcDNAマイクロアレイのノウハウを一般臨床に向け汎用化させて、内視鏡下生検標本を対象とした個々の癌の生物学的特性に対応した体系的診断・医療を実践することである。これまでに、ヒト全遺伝子に対して特異的配列をもったオリゴDNA(30000種類)を搭載したヒト全遺伝子型DNAチップを用い200例以上の大腸癌原発巣の遺伝子発現情報を取得するとともに、それぞれの症例の詳細な臨床病理情報をup dateしながら蓄積してきた。遺伝子発現情報と臨床病理情報のdata miningにより、従来の診断法では予測が困難であった転移・再発予後などの診断システムを確立するとともに、それぞれ関連遺伝子群の同定を行ってきた。
具体的には、1)平成17年度より術前内視鏡標本とその隣接生検病理情報、および手術切除標本と臨床病理学的情報を集積し、2)収集された大腸癌切除標本からmRNAを抽出し、超微量mRNA分析用マイクロラボチップによるquality checkを行なった上で、target DNA(臨床検体)の調整を進め、3)予備検討により決定されたプロトコールに従い一定条件下でヒト全遺伝子型オリゴDNAチップおよび臨床診断用DNAチップによる遺伝子情報を取得し、予測モデル式の構築と検証を繰り替えしその精度の向上を図るとともに、4)関連遺伝子群の同定による治療標的の抽出を行うことである。

研究成果

• [雑誌論文] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa Y, Honma K, Takemasa I, Nakamori S, Kita-Matsuo H, Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T, Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Oncnl. 28(2) ページ: 383-391
• [雑誌論文] Prediction of recurrence in advanced gastric cancer patients after curative resection by gene expression profiling. (2005)
  • 著者名/発表者名: Motoori M, Takemasa I, Yano M, Saito S, Miyata H, Takiguchi S, Fujiwara Y, Yasuda T, Doki Y, Kurokawa Y, Ueno N, Oba S, Ishii S, Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Cancer 114(6) ページ: 963-968
• [雑誌論文] DNAマイクロアレイを用いたトランスクリプトーム解析による腫瘍マーカーの探索 (2005)
  • 著者名/発表者名: 小森孝通, 竹政伊知朗, 山崎誠, 本告正明, 吉岡慎一, 小山太一, 池田正孝, 山本浩文, 関本貢嗣, (松原謙一), 門田守人
  • 雑誌名: 日本分子腫瘍マーカー研究会誌 20 ページ: 76-77
• [雑誌論文] 肝細胞癌・化学療法感受性予測-IFN/5FU併用療法の効果予測- (2005)
  • 著者名/発表者名: 黒川幸典, 永野浩昭, 門田守人
  • 雑誌名: 肝臓 46・10 ページ: 35-39
• [図書] 『消化器病学の進歩2005-モノグラフ 消化器病学のニューフロンティア編』DNA chipの癌臨床への応用-大腸癌診断用DNA chip(Mini Chip)の開発・作製-(荒川泰行 編集) (2005)
  • 著者名/発表者名: 山崎誠, 竹政伊知朗, 門出守人
  • 総ページ数: 407
  • 出版者: 財団法人日本消化器病学会
• [図書] 『癌転移のメカニズムがよくわかる 肺転移のすべて』2.網羅的遺伝子・タンパク解析 1)DNAマイクロアレイ (2005)
  • 著者名/発表者名: 竹政伊知朗, 池田正孝, 山本浩文, 関本貢嗣, 門田守人
  • 総ページ数: 146
  • 出版者: 永井書店