低分子量Gタンパク質Rabをゲノムワイドで網羅的に解析するツールの開発

2005 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17657067
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 福田 光則 独立行政法人理化学研究所, 福田独立主幹研究ユニット, 独立主幹研究員 (50311361)
• キーワード: 低分子量G蛋白質 / Rab / Rabエフェクター / 膜輸送 / dominant active / dominant negative / ゲノムワイド / 網羅的解析

研究概要

真核細胞生物の細胞内はさらに膜で包まれたオルガネラにより満たされており、主に膜輸送を介してオルガネラ同士で頻繁に物質のやり取りを行っている。低分子量Gタンパク質Rabファミリーは膜輸送に関与する分子群としては最大のもので、哺乳動物においては約60種類ものアイソフォームが存在している。各々のRabは特定の膜輸送を制御すると考えられているが、12番以降のRabアイソフォームになるといつどこで何を運ぶのかに関してはほとんど解明されていない。Rabは活性化型固定化(dominant active, DA)変異体あるいは不活性化型固定化(dominant negative, DN)変異体を作成することが出来るため、特定の膜輸送に対する影響を検討することが可能であるが、ある種の受容体が未知のRabにより細胞膜に輸送される場合には、60種類全てのRabクローンに対してDA/DN変異体を作成する必要があり、60種類のうちどのRabが関与するのかを調べることはこれまで不可能であった。このため世界的にRabを網羅的に解析するツールのニーズが高まってきている。そこで本研究ではマウス及びヒトに存在する60種類のRabを全てクローニングし、これらのRabの機能を網羅的に解析するツール(「Rab bank」)を作成することを目指した。本年度は60種類のRabに対するDA変異体及びDN変異体を全て作成し、緑色蛍光蛋白質(GFP)タグ、FLAGタグを付加した発現ベクター、及び酵母two-hybrid用のベクターを構築した。

研究成果

• [雑誌論文] Distinct developmental expression of synaptotagmin I and IX in the mouse brain. (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M.
  • 雑誌名: NeuroReport 17 ページ: 179-182
• [雑誌論文] O-glycosylation is essential for intracellular targeting of synaptotagmins I and II in non-neuronal specialized secretory cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Atiya-Nasagi, Y., Cohen, H., Medalia, O., Fukuda, M., Sagi-Eisenberg, R.
  • 雑誌名: J.Cell Sci. 118 ページ: 1363-1372
• [雑誌論文] Classical protein kinase C(s) regulates targeting of synaptotagmin IX to the endocytic recycling compartment. (2005)
  • 著者名/発表者名: Haberman, Y, Ziv, I., Gorzalczany, Y., Fukuda, M., Sagi-Eisenberg, R.
  • 雑誌名: J.Cell Sci. 118 ページ: 1641-1649
• [雑誌論文] Functional analysis of Slac2-c/MyRIP as a linker protein between melanosomes and myosin VIIa. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuroda, T.S., Fukuda, M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 28015-28022
• [雑誌論文] AS160, the Akt substrate regulating GLUT4 translocation, has a functional Rab GTPase activating protein domain. (2005)
  • 著者名/発表者名: Miinea, C.P., Sano, H., Kane, S., Sano, E., Fukuda, M., Peranen, J., Lane, W.S., Lienhard, G.E.
  • 雑誌名: Biochem.J. 391 ページ: 87-93
• [雑誌論文] Protein Kinase C-mediated phosphorylation of the two polybasic regions of synaptotagmin VI regulates their function in acrosomal exocytosis. (2005)
  • 著者名/発表者名: Roggero, C.M., Tomes, C.N., De Blas, G.A., Castillo, J., Michaut, M.A., Fukuda, M., Mayorga, L.S.
  • 雑誌名: Dev.Biol. 285 ページ: 422-435
• [雑誌論文] Adenovirus-mediated silencing of Synaptotagmin 9 inhibits Ca^<2+>-dependent insulin secretion in islets. (2005)
  • 著者名/発表者名: Iezzi, M., Eliasson, L., Fukuda, M., Wollheim, C.B.
  • 雑誌名: FEBS Lett. 579 ページ: 5241-5246
• [雑誌論文] Rab proteins regulate epithelial sodium channel activity in colonic epithelial HT-29 cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Saxena, S., Singh, M., Engisch, K., Fukuda, M., Kaur, S.
  • 雑誌名: Biochem.Biophys.Res.Commun. 337 ページ: 1219-1223
• [雑誌論文] The short apical membrane half-life of rescued ΔF508-cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) CFTR results from accelerated endocytosis of ΔF508-CFTR in polarized human airway epithelial cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Swiatecka-Urban, A., Brown, A., Moreau-Marquis, S., Renuka, J., Coutermarsh, B., Barnaby, R., Karison, K.H., Flotte, T.R., Fukuda, M., Langford, G.M., Stanton, B.A.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 36762-36772
• [雑誌論文] Slp4-a/granuphilin-a interacts with syntaxin-2/3 in a Munc18-2-dependent manner. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M., Imai, A., Nashida, T., Shimomura, H.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 39175-39184
• [雑誌論文] The C2B domain of rabphilin directly interacts with SNAP-25 and regulates the docking step of dense core vesicle exocytosis in PC12 cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Tsuboi, T., Fukuda, M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 39253-39259
• [雑誌論文] Cloning and genomic characterization of sytdep, a new synaptotagmin XIV-related gene. (2005)
  • 著者名/発表者名: Herrero-Turrion, M.J., Fukuda, M., Mollinedo, F.
  • 雑誌名: Biocheim.Biophys.Res.Commun. 340 ページ: 386-394
• [雑誌論文] Slp homology domain : A novel protein motif that specifically binds small GTPase Rab27. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M.
  • 雑誌名: Recent Res.Dev.Biochem. 6 ページ: 13-29
• [雑誌論文] Versatile role of Rab27 in membrane trafficking : Focus on the Rab27 effector families. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M.
  • 雑誌名: J.Biochem. 137 ページ: 9-16
• [雑誌論文] Functional analysis of Slac2-a/melaonophilin as a linker protein between Rab27A and myosin Va in melanosome transport. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuroda, T.S., Itoh, T., Fukuda, M.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 403 ページ: 419-431
• [雑誌論文] Identification and biochemical analysis of Slac2-c/MyRIP as a Rab27-, myosin Va/VIIa-, and actin-binding protein. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuroda, T.S., Fukuda, M.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 403 ページ: 431-444
• [雑誌論文] Analysis of the role of Rab27 effector Slp4-a/granuphilin-a in dense-core vesicle exocytosis. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M., Kanno, E.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 403 ページ: 445-457
• [雑誌論文] Assay and functional interactions of Rim2 with Rab3. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 403 ページ: 457-468
• [雑誌論文] Assay of Rab binding specificity of rabphilin and Noc2 : Target molecules for Rab27. (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, M., Yamamoto, A.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 403 ページ: 469-481
• [雑誌論文] Slac2-aとSlp2-a:メラニン色素輸送のしくみ (2005)
  • 著者名/発表者名: 福田光則
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 212 ページ: 769-770
• [雑誌論文] シナプトタグミンと類似タンパク質による膜輸送制御の分子メカニズム (2005)
  • 著者名/発表者名: 福田光則
  • 雑誌名: 生化学 77 ページ: 603-618
• [雑誌論文] 「メラニン色素」輸送の分子メカニズム:肌や髮の毛が黒くなる仕組み (2005)
  • 著者名/発表者名: 福田光則
  • 雑誌名: 日皮協ジャーナル 54 ページ: 60-66
• [雑誌論文] 美白への新たなアプローチ-メラニン輸送をストップさせる- (2005)
  • 著者名/発表者名: 黒田垂歩, 福田光則
  • 雑誌名: BIONICS 2(11) ページ: 68-71
• [図書] アンチ・エイジングシリーズ1「白髪・脱毛・育毛の実際」メラニン色素輸送メカニズムの解明 (2005)
  • 著者名/発表者名: 福田光則, 黒田垂歩
  • 総ページ数: 221-235
  • 出版者: エヌ・ティー・エス