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2005 年度 実績報告書

セミラショナル医薬品設計:ファージライブラリーとコンピュータ支援薬物設計との融合

研究課題

研究課題/領域番号 17659008
研究機関大阪府立大学

研究代表者

藤井 郁雄  大阪府立大学, 理学系研究科, 教授 (70189984)

研究分担者 円谷 健  大阪府立大学, 理学系研究科, 助手 (00372855)
キーワード医薬品設計 / 薬物設計 / バーチャルスクリーニング / ファーマコフォア
研究概要

本研究では,ファージ表層提示ライブラリー法とコンピュータ支援薬物設計(バーチャルスクリーニング)を融合させた新しい医薬品設計手法を開発する.すなわち,立体構造を持つペプチド(α-helixやループなど)から構成されるファージ・ライブラリーを構築し,その中から標的タンパク質に結合するペプチドを検索する.得られるペプチドは強固な立体構造を持つので,その構造からファーマコフォアの3次元構造情報を入手し,その情報をもとに低分子化合物ライブラリーをバーチャルスクリーニングして,医薬品リード化合物を設計する.
1.ファージ表面提示ライブラリーの構築:
(a)α-ヘリックス構造ライブラリー:ヘリックス・ループ・ヘリックス構造ペプチドの外側のアミノ酸5残基を遺伝子増幅装置によりランダム化し,ファージ・表面タンパク質上に提示させるたファージ・ライブラリーを構築した.
(b)ループ構造ライブラリー:ヘリックス・ループ・ヘリックス構造ペプチドは,2本のヘリックス鎖間のロイシン残基による疎水相互作用ならびにそれぞれのヘリックス上にあるグルタミン酸とリジン残基との相互作用により安定化されるため,ループ部分をライブラリー化してもヘリックス構造は崩れることはない.そこで,ループ部分の5アミノ酸残基をランダム化した,ループ構造ライブラリーを構築した.
2.ファージ・ライブラリーのスクリーニング:
顆粒球刺激因子(G-CSF)受容体やインテグリンα5β1に対してスクリーニングし,結合性ペプチドを検索した.
3.受容体結合性ペプチドの合成:
ファージ・ライブラリーのスクリーニングより得られたペプチドをF-moc法を用いる固相合成法により合成した.

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2005

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] A Free Energy Calculation Study of the Effect of H→F Substitution on Binding Affinity in Ligand-Antibody Interactions2005

    • 著者名/発表者名
      Minoru Saito, Isao Okazaki, Masayuki Oda, Ikuo Fujii
    • 雑誌名

      J.Comput.Chem. 26

      ページ: 272-282

  • [雑誌論文] Directed Mutagenesis Study of the Antibody 2D7 which Catalyzes a Reaction for Insersion of Cu2+ into Mesoporphyrin.2005

    • 著者名/発表者名
      Naoki Hosomi, Yasuko Kawamura-Konishi, Ryota Kawano, Ikuo Fujii, Haruo Suzuki
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 99

      ページ: 222-229

  • [雑誌論文] Directed Evolution of Peptide Ligands for G-CSF Receptor : A Correlation between α-Helix Stability and Binding Affinity.2005

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fujii, Akiko Matsui, Takashi Kodama, Takeshi Tsumuraya, Mitsumori Kirihata
    • 雑誌名

      Peptide Science

      ページ: 577-578

  • [雑誌論文] Backbone resonance assignments for the Fv fragment of catalytic antibody 6D9 complexed with a transition state analogue2005

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Sakakura, Hideo Takahashi, Hiroaki Terasawa, Kou Takeuchi, Ikuo Fujii, Ichio Shimada
    • 雑誌名

      J.Biomolecular NMR 33

      ページ: 282

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公開日: 2007-04-02   更新日: 2016-04-21  

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