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2006 年度 実績報告書

ブロック共重合体が誘起するDNAの規則的断片化に基づくDNAの凝縮構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 17685009
研究機関東京大学

研究代表者

長田 健介  東京大学, 大学院工学系研究科, 特任講師 (10396947)

キーワード高分子構造・物性 / 核酸 / DNA凝縮 / 酵素反応 / DNAの折りたたみ構造
研究概要

DNAはポリカチオンと相互作用することによりコイン-グロビュール転移が誘起され、小さく凝縮するが、完全に制御された転写複製システムを機能させるためにはDNAは整然と折りたたまれている必要がある。一方でニ重鎖DNAはそのらせん構造ゆえ剛直な棒状高分子であり、持続長はおよそ50nmにも達する。生体はニ重らせん構造を保ちつついかにDNAを折りたたみ凝縮するのだおうか。DNAとして遺伝子工学の礎である環状、超らせん構造で特徴づけられるプラスミドDNAを選択し、特に生体反応の場であり、かつDNAの剛直性が発現するナノスケールでのDNAの折りたたみに焦点を当てた。プラスミドDNAの凝縮はそのトポロジカルな制約により直鎖状DNAの凝縮とは異なる複雑な経路をとることが予想され、それ故これまでの知見は凝縮形態観察の域を出ていない。プラスミドDNAの凝縮過程の理解は、トポロジーの制約の中でいかに剛直な鎖を折りたたむか、トポロジーがなぜ存在するかとう科学的・生物学的興味とともに、DNAを凝縮状態で送達し、目的細胞へ遺伝子を導入、発現させるという遺伝子送達技術の確立のためにも非常に重要な命題である。単一のプラスミドDNA凝縮を取り出すため、カチオン性セグメントと親水性セグメントからなるブロック共重合体poly(ethylene glycol)-b-poly(L-lysine), PEG-PLL(PEG : Mw12000,PLL : DP17)を用い、両者の自己会合により形成される高分子ミセルをDNA凝縮の観測系として用いた。これによりこれまで多分子間相互作用ゆえに扱うことが出来なかったDNA凝縮に対して、化学量論比を含めた広い電荷比にわたって詳細に観察可能とする系を確立した。ナノスケールでの剛直性と折りたたみに焦点を当てた凝縮過程の検討から、特定の凝縮度(化学量論比近傍)においてプラスミドDNAの長さ、種類とは関係なくDNAの規則的な位置にニ重らせんの解離が誘起されることを明らかにし、DNAの凝縮気候に普遍的な法則があることを見出した。一方においては凝縮度の高いプラスミドDNAのニ重らせん構造は非特異的な箇所において不安定化されていることを見出した。これら凝縮に伴う二重鎖の不安定性を基に、AFM観察から得られるそれぞれの凝縮度におけるプラスミドDNAの凝縮構造を、トポロジーを含めて体系的に検討している。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Semipermeable polymer vesicle (PICsome) self-assembled in aqueous medium from a pair of oppositely charged block copolymers : physiologically stable micro-/nano-containers of water-soluble macromolecules.2006

    • 著者名/発表者名
      A.Koide, A.Kishimura, K.Osada, W.-D.Jang, Y.Yamasaki, K.Kataoka
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 128

      ページ: 5988

  • [雑誌論文] Drug and gene delivery based on supramolecular assembly of PEG-polypeptide hybrid block copolymers.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Osada, K.Kataoka
    • 雑誌名

      Advances in Polymer Science 202

      ページ: 113

  • [図書] 自己組織化ナノマテリアル フロントランナー85人が語るナノテクノロジーの新潮流2007

    • 著者名/発表者名
      国武豊喜 編集
    • 総ページ数
      392
    • 出版者
      フロンティア出版

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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