小児悪性固形腫瘍の新規病理分子学的リスク分類の開発とゲノム診療に向けた基盤構築

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17H01592
• 研究機関: 国立研究開発法人国立成育医療研究センター
• 研究代表者: 菱木 知郎 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 小児がんセンター, 医長 (00375776)
• 研究分担者: 市川 仁 国立研究開発法人国立がん研究センター, 先端医療開発センター, ユニット長 (30201924) ; 瀧本 哲也 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 研究所小児がん疫学臨床研究センター, 室長 (40393178) ; 上條 岳彦 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 所長 (90262708)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: 小児悪性固形腫瘍 / ターゲットシークエンス / パネル診断

研究実績の概要

成人固形腫瘍領域では、次世代シークエンサー（NGS）技術を用いた多遺伝子検査（パネル検査）が臨床に導入されつつあり、個々の症例の遺伝子異常に合わせて治療の選択を行うがんゲノム医療の実践が試みられている。しかしながら、小児固形腫瘍に対してがんゲノム医療を実施するための基盤は十分に構築されていない。日本小児がん研究グループ（JCCG）固形腫瘍分科会では、2011年から全種類の小児悪性固形腫瘍を対象として症例登録を行い、病理・分子生物学的中央診断を実施した上で、フォローアップデータを含む臨床情報を継続的に収集する小児固形腫瘍観察研究を実施して来た。本研究は、この観察研究に登録された症例の余剰検体を用いて新たな分子病理学的リスク分類の開発を行うとともに、小児固形腫瘍のためのパネル検査を開発し、小児固形腫瘍のゲノム医療の基盤を構築することを目的としている。
本年度重点を置いたのは、小児固形腫瘍用のパネル検査の開発である。成人固形腫瘍の治療選択を目的として研究分担者らが開発して来たNCCオンコパネル検査を基盤として、JCCG固形腫瘍分科会の各疾患委員会と協力して、追加すべき遺伝子をリストアップした。治療標的／予後因子となる可能性のある40遺伝子の全エクソン配列、生殖細胞系列変異が知られ治療／管理方針に影響を与える可能性の高い57遺伝子の全エクソン配列、2融合遺伝子の転座イントロン領域、TERT遺伝子プロモーター領域、CTNNB1遺伝子の欠失イントロン領域をNCC Oncopanel v4に追加して、NCC Oncopanel Ped v1を作製した。小児固形腫瘍FFPE検体を用いてこのパネルの性能検証を開始し、まず、実臨床で作製された小児固形腫瘍FFPE検体がNGSパネル検査に使用可能であること、NCC Oncopanel Ped v1がNCC Oncopanel v4と同等に稼働可能なこと等を確認した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究班内外で小児固形腫瘍におけるパネル検査のあり方について幅広く議論を行うとともに、JCCG固形腫瘍分科会の各疾患委員会からの提案も受け、小児固形腫瘍の治療選択に有用な遺伝子（治療標的／予後因子となる可能性のある遺伝子と、生殖細胞系列変異が知られ治療／管理方針に影響を与える可能性の高い遺伝子）のリストアップを行い、小児固形腫瘍用パネルを作製することができた。また、倫理申請を行い、病理診断の再確認を行った上で検体を選出し、実臨床で作製された腫瘍組織検体を用いた性能検証を開始することができた。その他、神経芽腫の治療層別化のための分子病理学的新規リスク分類の開発も進めている。これらのことから、研究は概ね順調に進んでいると考えている。

今後の研究の推進方策

ゲノムの再構成や数十～数百塩基の欠失の検出はNGS解析が比較的苦手とするところであり、神経芽腫に見られるTERT遺伝子プロモーター領域再構成や、肝芽腫に見られるCTNNB1遺伝子イントロン2 - 3領域の欠失を、NCC Oncopanel Ped v1を用いて高精度で検出できるかを検証することは重要な課題である。この点を中心に、NCCオンコパネルPed v1の性能検証を進める。
一方、今年1月に、JCCG、小児血液・がん学会、国立成育医療研究センター、国立がん研究センターから推薦された研究者を構成員とし、All Japan体制で小児固形腫瘍パネル検査の開発を行う小児がんパネル開発ワーキングチームが結成され、本研究班の研究者らも参加している。このワーキングチームで開発を目指すのは、治療、リスク分類だけでなく、診断も目的とする小児固形腫瘍パネル検査である。本研究班の先行データも提供し、より臨床的有用性の高いパネル検査となるように協力して行く予定である。このような状況の下、本研究班では、小児固形腫瘍の臨床へのパネル検査の導入に必要な体制の構築、NCC Oncopanel Ped v1を用いた新規治療標的の探索及び新規リスク分類の開発に、より力を注ぐことを検討している。

研究成果

• [雑誌論文] EZH2 regulates neuroblastoma cell differentiation via NTRK1 promoter epigenetic modifications (2018)
  • 著者名/発表者名: Li Zhenghao、Takenobu Hisanori、Setyawati Amallia Nuggetsiana、Akita Nobuhiro、Haruta Masayuki、Satoh Shunpei、Shinno Yoshitaka、Chikaraishi Koji、Mukae Kyosuke、Akter Jesmin、Sugino Ryuichi P.、Nakazawa Atsuko、Nakagawara Akira、Aburatani Hiroyuki、Ohira Miki、Kamijo Takehiko
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 37 ページ: 2714～2727
  • DOI: 10.1038/s41388-018-0133-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] CFC1 is a cancer stemness-regulating factor in neuroblastoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Koji Chikaraishi Hisanori Takenobu Ryuichi P. Sugino Kyosuke Mukae Jesmin Akter Masayuki Haruta Masafumi Kurosumi Takaho A Endo Haruhiko Koseki Naoki Shimojo Miki Ohira Takehiko Kamijo
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 ページ: 45046-45059
  • DOI: 10.18632/oncotarget.18464
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic Analysis-Integrated Whole-exome Sequencing of Neuroblastomas Identifies Genetic Mutations in Axon Guidance Pathway. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuanyuan Li, Miki Ohira, Yong Zhou, Teng Xiong, Wen Luo, Chao Yang, Xiangchun Li, Zhibo Gao, Yohko Nakamura, Takehiko Kamijo, Yasuhiko Kaneko, Takeshi Taketani, Junichi Ueyama, Tatsuro Tajiri, Hongyan Zhang, Jian Wang, Huanming Yang, Ye Yin, and Akira Nakagawara
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 ページ: 56684-56697
  • DOI: 10.18632/oncotarget.18079
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cancer-type OATP1B3 mRNA has the potential to become a detection and prognostic biomarker for human colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sun Y, Harada M, Shimozato O, Souda H, Takiguchi N, Nabeya Y, Kamijo T, Akita H, Anzai N, Chiba K, Furihata T.
  • 雑誌名: Biomark Med. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: 10.2217/bmm-2017-0098
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the Genetic and Clinical Characteristics of Neuroblastomas using Genome-wide Analysis. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Uryu, Riki Nishimura, Keisuke Kataoka, Yusuke Sato, Atsuko Nakazawa, Hiromichi Suzuki, Kenichi Yoshida, Masafumi Seki, Mitsuteru Hiwatari, Tomoya Isobe, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Katsuyoshi Koh, Ryoji Hanada, Akira Oka, Yasuhide Hayashi, Miki Ohira, Takehiko Kamijo, et al
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 ページ: 107513-107529
  • DOI: 10.18632/oncotarget.22495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Risk-stratified staging in paediatric hepatoblastoma: a unified analysis from the Children's Hepatic tumors International Collaboration. (2017)
  • 著者名/発表者名: Meyers RL, Maibach R, Hiyama E, Heberle B, Krailo M, Rangaswami A, Aronson DC, Malogolowkin MH, Perilongo G, von Schweinitz D, Ansari M, Lopez-Terrada D, Tanaka Y, Alaggio R, Leuschner I, Hishiki T, Schmid I, Watanabe K, Yoshimura K, Feng Y, Rinaldi E, Saraceno D, Derosa M, Czauderna P.
  • 雑誌名: Lancet Oncol. 巻: 18 ページ: 122 - 131
  • DOI: 10.1016/S1470-2045(16)30598-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of pulmonary metastasectomy for hepatoblastoma in children with metastasis at diagnosis: Results from the JPLT-2 study. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T, Watanabe K, Ida K, Hoshino K, Iehara T, Aoki Y, Kazama T, Kihira K, Takama Y, Taguchi T, Fujimura J, Honda S, Matsumoto K, Mori M, Yano M, Yokoi A, Tanaka Y, Fuji H, Miyazaki O, Yoshimura K, Takimoto T, Hiyama E.
  • 雑誌名: J Pediatr Surg 巻: 52 ページ: 2051-2055
  • DOI: 10.1016/j.jpedsurg.2017.08.031
  • 査読あり
• [雑誌論文] A female case of pleuropulmonary blastoma type 1 whose pulmonary cystic lesion was followed since neonate. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ohno M, Takezoe T, Watanabe T, Tahara K, Hishiki T, Fujino A, Matsuo M, Higuchi M, Kawasaki K, Shioda Y, Kato M, Kiyotani C, Matsumoto K, Takakuwa E, Irie R, Yoshioka T, Kimura S, Seki M, Takita J, Kanamori Y.
  • 雑誌名: J Pediatr Surg Case Reports 巻: 19 ページ: 34-37
  • DOI: org/10.1016/j.epsc.2017.02.009
  • 査読あり
• [学会発表] Genomic and epigenomic profiling of high stage neuroblastoma (2017)
  • 著者名/発表者名: M Ohira, T Kamijo
  • 学会等名: AACR2017
  • 国際学会
• [学会発表] Sphere specific transcription factor CDX1 has dual functions for regulating stemness of neuroblastoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Takenobu H,Kamijo T
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] Effects of development regulators on neuroblastoma biology (2017)
  • 著者名/発表者名: 上條岳彦
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] Is interoperative paracentesis justified for all epithelial ovarian tumors in children? (2017)
  • 著者名/発表者名: Katsuhiro Ogawa, Tomoro Hishiki, Kotaro Tomonag, Mioko Nomura, Toshiko Takezoe, Michinobu Ohno, Kazunori Tahara, Toshihiko Watanabe, Akihiro Fujino, Rie Irie, Takako Yoshioka, Yutaka Kanamori
  • 学会等名: 50th annual meeting of the Pacific Association of Pediatric Surgeons
  • 国際学会
• [学会発表] The role of pulmonary metastasectomy in children with hepatoblastoma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T, Watanabe K, Ida K, Hoshino K, Iehara T, Aoki Y, Kazama T, Kihira K, Takama Y, Taguchi T, Fujimura J, Honda S, Matsumoto K, Mori M, Yano M, Yokoi A, Tanaka Y, Fuji H, Miyazaki O, Yoshimura K, Takimoto T, Hiyama E.
  • 学会等名: 50th annual meeting of the Pacific Association of Pediatric Surgeons
  • 国際学会
• [学会発表] Systemic response evaluated by Curie score is not correlated to the complexity and outcome of primary tumor resection in high-risk neuroblastoma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T, Kanamori Y, Fujino A, Watanabe T, Tahara K, Ohno M, Takezoe T, Kiyotani C, Shioda Y, Tomizawa D, Kato M, Terashima K, Osumi T, Miyazaki O, Kitamura M, Matsumoto K.
  • 学会等名: 49th Congress of the International Society of Paediatric Oncology.
  • 国際学会
• [学会発表] Local control for intermediate to high risk neuroblastoma -surgical oncologist’s view. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T.
  • 学会等名: 24th Asia Pacific Cancer Conference (APCC 2017), 2017.6.24. Seoul
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] がん個別化治療のためのNGS遺伝子パネル検査の開発 (2017)
  • 著者名/発表者名: 市川仁
  • 学会等名: 第13回北関東小児がんセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] がん個別化治療のためのNGS（次世代シークエンサー）パネル検査の開発 (2017)
  • 著者名/発表者名: 市川仁
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会主催第24回臨床細胞遺伝学セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] FFPE腫瘍検体のRNAシークエンシングと融合遺伝子検出 (2017)
  • 著者名/発表者名: 三谷幸代、吉田朗彦、関水壮哉、山崎文登、久保崇、元井紀子、川井章、河野隆志、市川仁
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] nCounterアッセイによる肉腫FFPE標本からの融合遺伝子検出 (2017)
  • 著者名/発表者名: 三谷幸代、吉田朗彦、関水壮哉、山崎文登、久保崇、元井紀子、川井章、河野隆志、市川仁
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] nCounterアッセイによる肉腫FFPE標本からの融合遺伝子検出 (2017)
  • 著者名/発表者名: 関水壮哉、吉田朗彦、山崎文登、三谷幸代、久保崇、本田隆行、角南久仁子、河野隆志、川井章、市川仁
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [図書] “はじめて学ぶ小児血液・腫瘍疾患”．腹部に腫瘤が触れる． (2017)
  • 著者名/発表者名: 菱木知郎
  • 総ページ数: 8
  • 出版者: 診断と治療社