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2019 年度 実績報告書

グラフデータの機械学習における特徴表現設計の体系化

研究課題

研究課題/領域番号 17H01783
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

瀧川 一学  国立研究開発法人理化学研究所, 革新知能統合研究センター, 研究員 (10374597)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
キーワード機械学習 / グラフデータ
研究実績の概要

本年度は研究代表者の異動に伴う研究環境の変化に応じて、実問題から生じるグラフデータの特徴表現設計の実践的課題に主として注力した。また本年度は顕著な研究動向の変化として、グラフデータを直接入力に取るグラフニューラルネットワーク(GNN)の研究が多数発表された。大変興味深いことに化学構造の表現やSNS等のネットワークデータの表現だけではなく、物理シミュレーションや純粋な組合せ最適化問題など幅広い問題を解く汎用入力表現としてのグラフが探求されており、その特性や限界も理解されはじめた。本課題でもこのようなより広い文脈からグラフデータとその表現の問題を捉え直し、研究・検討を行った。
特に有機低分子だけではなくそれ以外の、無機材料や高分子、分子と分子の相互作用ネットワーク、グラフの変化を扱う化学反応、化学反応の出発物質から遷移状態を経て生成物質に至る経路そのもののネットワーク的なバリエーションである化学反応経路など、実問題のデータに関するグラフデータとその特徴表現・機械学習研究を行った。また、組合せ最適化の問題や機械学習モデル自体がもつグラフ構造(ニューラルネットワークの構造や決定森の構造など)に関する表現・分析の検討や付随するアルゴリズム研究も行った。
共同研究や昨年度の成果も含めて論文発表や講演も行った。特に、グラフ特徴表現・機械学習に関しては、入力グラフの各頂点や辺に付与する隠れ変数ベクトル自体を問題の特性に応じてAttention構造で適応的に学習するGNNについて国際ワークショップで発表した。また分子間相互作用ネットワークなど、一つ一つの構成要素自身がグラフ表現を持ち、その要素自体がまたネットワークをなす汎用的設定で、GNN(Dual graph convolution)を学習する共同研究について国際シンポジウムで発表した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は研究代表者の異動による研究環境の変化、および、機械学習分野におけるグラフニューラルネットワーク研究の大隆盛という研究分野の変化に合わせて、想定するグラフ研究対象や適用できる問題を広く再検討し、興味深い多数の適応例・汎用的な視野と技術課題や、さらに展開が期待できる共同研究のシードを得ることができた。また今までに得られている研究結果の国際発表や論文発表も行うことができた。

今後の研究の推進方策

最終年度は、全列挙型あるいは化学の分野の制約列挙型の特徴表現を機械学習するアプローチとGNNによる様々なアプローチとの本質的な挙動や違いのより詳細な理解を進め、また、化学を主とする様々な実問題での有効性を検証する予定である。また、最終年度であることから得られている様々な展開的な研究課題を整理し次の研究につなげる検討を成果発表と合わせて実施したい。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (19件) (うち国際学会 6件、 招待講演 9件)

  • [雑誌論文] 触媒研究における機械学習と最適実験計画2020

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 雑誌名

      電気化学

      巻: 88 ページ: 14~20

    • DOI

      10.5796/denkikagaku.20-FE0004

  • [雑誌論文] Machine learning for catalysis informatics: Recent applications and prospects2019

    • 著者名/発表者名
      Toyao Takashi, Maeno Zen, Takakusagi Satoru, Kamachi Takashi, Takigawa Ichigaku, Shimizu Ken-ichi
    • 雑誌名

      ACS Catalysis

      巻: 10 ページ: 2260-2297

    • DOI

      10.1021/acscatal.9b04186

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Statistical analysis and discovery of heterogeneous catalysts based on machine learning from diverse published data2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Keisuke、Toyao Takashi、Maeno Zen、Takakusagi Satoru、Shimizu Ken‐ichi、Takigawa Ichigaku
    • 雑誌名

      ChemCatChem

      巻: 11 ページ: 4537-4547

    • DOI

      10.1002/cctc.201900971

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Linear correlations between adsorption energies and HOMO levels for the adsorption of small molecules on TiO2 surfaces2019

    • 著者名/発表者名
      Kamachi Takashi、Tatsumi Toshinobu、Toyao Takashi、Hinuma Yoyo、Maeno Zen、Takakusagi Satoru、Furukawa Shinya、Takigawa Ichigaku、Shimizu Ken-ichi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry C

      巻: 123 ページ: 20988-20997

    • DOI

      10.1021/acs.jpcc.9b05707

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 人工知能学会基本問題研究会2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 雑誌名

      人工知能

      巻: 34 ページ: 603~611

  • [学会発表] Efficiently enumerating substrings with statistically significant frequencies of locally optimal occurrences in gigantic string2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura A, Takigawa I, Mamitsuka H
    • 学会等名
      34th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-20)
    • 国際学会
  • [学会発表] Compiling higher order binary optimization problems into annealing processors2020

    • 著者名/発表者名
      Sugie Y, Mertig N, Iwata Y, Teramoto H, Nakamura A, Takigawa I, Minato S, Komatsuzaki T, Takemoto T
    • 学会等名
      25th International Symposium on Artificial Life and Robotics (AROB 25th 2020),
    • 国際学会
  • [学会発表] The interplay between data-driven and theory-driven methods for chemical sciences2020

    • 著者名/発表者名
      Takigawa I
    • 学会等名
      The 1st International Symposium on Human InformatiX
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 機械学習による化学反応の予測と設計2020

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      近畿化学協会コンピュータ化学部会 公開講演会(第107回例会)
    • 招待講演
  • [学会発表] Learning relevant molecular representations via self-attentive graph neural networks2019

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi S, Takigawa I, Oyama S, Kurihara M
    • 学会等名
      Workshop on Deep Graph Learning: Methodologies and Applications (DGLMA'19), IEEE BigData'19 Workshop
    • 国際学会
  • [学会発表] Dual graph convolutional neural network for predicting chemical networks2019

    • 著者名/発表者名
      Harada S, Akita H, Tsubaki M, Baba Y, Takigawa I, Yamanishi Y, Kashima H
    • 学会等名
      Joint 30th International Conference on Genome Informatics (GIW) and Australian Bioinformatics and Computational Biology Society (ABACBS) Annual Conference (GIW/ABACBS 2019)
    • 国際学会
  • [学会発表] Machine Learning and Model-based Optimization for Heterogeneous Catalyst Design and Discovery,2019

    • 著者名/発表者名
      Takigawa I
    • 学会等名
      The 2nd ICReDD International Symposium - Toward Interdisciplinary Research Guided by Theory and Calculation
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ランダム分割木に基づく勾配ブースティングの検証2019

    • 著者名/発表者名
      松田 祐汰・瀧川一学・有村博紀
    • 学会等名
      第22回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2019)
  • [学会発表] 機械学習によるメタン酸化カップリング反応に有効な触媒探索2019

    • 著者名/発表者名
      高尾基史・鳥屋尾 隆・前野禅・高草木 達・瀧川一学・清水研一
    • 学会等名
      第42回ケモインフォマティクス討論会
  • [学会発表] 大きな正規表現に対する系列二分決定グラフを用いた効率よい照合手法2019

    • 著者名/発表者名
      瀧澤涼介・喜田拓也・有村博紀・瀧川一学
    • 学会等名
      電子情報通信学会 コンピュテーション研究会(COMP)
  • [学会発表] 化学情報の適応的選択によるグラフ畳み込み学習の解釈性の向上2019

    • 著者名/発表者名
      菊地翔馬・栗原正仁・小山聡・瀧川一学
    • 学会等名
      情報処理学会北海道シンポジウム2019
  • [学会発表] 深層学習に基づくペプチド由来イオンピークの新規検出手法2019

    • 著者名/発表者名
      守屋勇樹・ 田畑剛・ 岩崎未央・ 河野信・ 五斗進・ 石濱 泰・ 瀧川一学・吉沢明康
    • 学会等名
      第67回質量分析総合討論会
  • [学会発表] 不均一系触媒研究のための機械学習と最適実験計画2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      第80回応用物理学会秋季学術講演会 シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工知能の基本問題:これまでとこれから2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      人工知能学会 人工知能基本問題研究会(SIG-FPAI)
    • 招待講演
  • [学会発表] 化学研究のための機械学習と最適実験計画2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      物性研究所スパコン共同利用・CCMS合同研究会「計算物質科学の新展開」
    • 招待講演
  • [学会発表] ユーザのための機械学習・深層学習入門2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      Rinkai Hackathon 2019 with DDBJing
    • 招待講演
  • [学会発表] 分子のグラフ表現と機械学習2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      有機合成化学協会, 「AIと有機合成化学」第三回勉強会
    • 招待講演
  • [学会発表] 機械学習は真の理解や発見に寄与できるか2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      第35回関東CAE懇話会, AI・IoT時代のデータ利活用による理解と発見
    • 招待講演
  • [学会発表] 機械学習による化学反応の予測と設計2019

    • 著者名/発表者名
      瀧川一学
    • 学会等名
      情報系 Winter Festa Episode 5

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公開日: 2021-01-27  

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