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2017 年度 実績報告書

タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素MPIaseの構造と機能に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 17H02209
研究機関岩手大学

研究代表者

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
キーワードタンパク質膜挿入 / MPIase / CdsA / YidC
研究実績の概要

大腸菌におけるタンパク質膜挿入・膜透過反応には、申請者らが発見・同定した糖脂質MPIaseが重要な役割を果たしている。特に、一部の膜タンパク質の膜挿入反応はMPIaseのみによって触媒されるため、「糖脂質酵素(Glycolipozyme)」という概念を提唱している。我々は、リン脂質生合成にかかわるCDP-ジアシルグリセロール(CDP-DAG)生合成酵素CdsAがMPIase生合成にも関与することを見出した。MPIase生合成反応におけるCdsAの作用を解析したところ、CdsAはフォスファチジン酸(PA)にGlcNAcリン酸(GlcNAc-P)を取り込む反応を触媒し、MPIase生合成中間体GlcNAc-PP-DAG(Compound I)を生成することが判明した。この反応には基質としてCTP、PA、GlcNAc-Pが必要であった。また、高pH条件でCDP-DAG生産に欠陥が生じるCdsA8変異体を用いて解析したところ、高pH条件ではCdsA8量のCDP-DAGが生成した後、Compound Iが生成する様子が観察された。さらに、この変異株を高pH条件で培養するとMPIaseの発現量が大幅に増加した。これらの結果から、CdsA上では、まずCTPとPAからCDP-DAGが生成し、CdsAから解離する前にGlcNAc-PがCMPと置換されCompound Iが生成する機構が明らかとなった。
タンパク質膜挿入の再構成系では、自発的膜挿入を完全に排除した再構成系を確立した。この系を用いて解析した結果、SecYEGやSRPを利用するしないにかかわらず、すべてのタンパク質はMPIaseに依存して膜挿入すること、MPIase依存の膜挿入はYidCにより促進されることが判明した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

タンパク質膜挿入にかかわる糖脂質酵素MPIaseの生合成経路の一部を明らかにし、MPIase枯渇株を構築して、MPIaseがin vivoでも膜挿入反応に必須であり、その結果生育にも必須であることを証明することができた。再構成系においても、MPIaseは膜挿入に必須であることを示すことができ、さらにはYidCにより促進されることを発見した。これらについては、論文一報が公表されているが、二報分については現在改定中であるため「(2)おおむね順調に進展している」と評価した。

今後の研究の推進方策

MPIaseの生合成酵素の探索を続行して、MPIase生合成経路の全貌を明らかにする。再構成系では、すでに構築した再構成系に変異型MPIaseやSecYEG、YidCなどの変異体を導入し、さらに詳細に膜挿入機構を解明する。

  • 研究成果

    (18件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Cholesterol blocks spontaneous insertion of membrane proteins into liposomes of phosphatidylcholine2018

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Shota、Suzuki Sonomi、Saito Hiroaki、Nishiyama Ken-ichi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 163 ページ: 313~319

    • DOI

      10.1093/jb/mvx083

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular dynamics study of binary POPC bilayers: molecular condensing effects on membrane structure and dynamics2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Saito, Tetsuya Morishita, Taku Mizukami, Ken-ichi Nishiyama, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
    • 雑誌名

      J Physics

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Membrane insertion of F0 c subunit of F0 F1 ATPase depends on glycolipozyme MPIase and is stimulated by YidC2017

    • 著者名/発表者名
      Hanako Nishikawa, Masaru Sasaki, Ken-ichi Nishiyama
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 487 ページ: 477~482

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.04.095

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] タンパク質の膜挿入反応と温度依存性2017

    • 著者名/発表者名
      西山賢一
    • 雑誌名

      温度生物学ハンドブック(新学術領域「温度生物学」編)

      巻: 1 ページ: 16-16

    • オープンアクセス
  • [学会発表] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIaseの低温センシングによる発現誘導機構2018

    • 著者名/発表者名
      西山賢一
    • 学会等名
      新学術領域研究「温度生物学」第5回領域会議(東京大学薬学部)
    • 招待講演
  • [学会発表] FLAGタグ融合OmpAを用いた、真核細胞への吸着性をもつ大腸菌の構築2018

    • 著者名/発表者名
      佐々木 優、福家 浩斗、西山 賢一
    • 学会等名
      デザイン生命工学研究会第3回大会(今帰仁村コミュニティーセンターホール、沖縄県・今帰仁村)
  • [学会発表] Membrane insertion of F0 c subunit of F0F1 ATPase depends on glycolipozyme MPIase and is stimulated by YidC2018

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa, H., Sasaki, M, Nishiyama, K.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Protein Transport Across Cell Membranes. (Hotel Galvez, Galveston, TX, USA)
    • 国際学会
  • [学会発表] CdsA is involved in biosynthesis of MPIase essential for membrane protein integration in vivo2018

    • 著者名/発表者名
      Sawasato, K., Sato, R., Nishikawa, H., Iimura, N., Kamemoto, Y., Fujikawa, K., Yamaguchi, T., Kuruma, Y., Tamura, Y., Endo, T., Ueda, T., Shimamoto, K., Nishiyama, K.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Protein Transport Across Cell Membranes. (Hotel Galvez, Galveston, TX, USA)
    • 国際学会
  • [学会発表] F0F1-ATPase c サブユニット(F0c)の膜挿入は糖脂質酵素MPIase に依存し、YidC により促進される2017

    • 著者名/発表者名
      西川 華子、佐々木 優、西山 賢一
    • 学会等名
      第14回21世紀大腸菌研究会(KKRホテル熱海、静岡県・熱海市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入反応に必須の糖脂質酵素MPIase の低温下おける発現誘導機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      沢里 克宏、鈴木 苑実、西山 賢一
    • 学会等名
      第14回21世紀大腸菌研究会(KKRホテル熱海、静岡県・熱海市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIaseの低温センシングによる発現誘導機構2017

    • 著者名/発表者名
      沢里 克宏、西川 華子、西山 賢一
    • 学会等名
      平成29年度 文部科学省 新学術領域研究 「温度生物学」第4回領域会議(京都大学芝蘭会館、京都市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質MPIaseはTAT(Twin-Arginine Translocation)膜透過にも必須の因子である2017

    • 著者名/発表者名
      西川 華子、西山 賢一
    • 学会等名
      平成29年度 文部科学省 新学術領域研究 「温度生物学」第4回領域会議(京都大学芝蘭会館、京都市)
  • [学会発表] MPIase生合成酵素CdsA、YnbBの低温下における発現誘導機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      沢里 克宏、西山 賢一
    • 学会等名
      平成29年度 文部科学省 新学術領域研究 「温度生物学」第4回領域会議(京都大学芝蘭会館、京都市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIaseの部分化学合成標品を用いた構造と機能の解析2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木 苑実、藤川 絋樹、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第12回 無細胞生命科学研究会(東京大学柏キャンパス図書館、千葉県・柏市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質MPIaseは TAT(Twin-Arginine Translocation)膜透過にも必須である2017

    • 著者名/発表者名
      西川 華子、沢里 克宏、山田 美和、菊池 慶実、西山 賢一
    • 学会等名
      第12回 無細胞生命科学研究会(東京大学柏キャンパス図書館、千葉県・柏市)
  • [学会発表] 大腸菌におけるタンパク質膜挿入は糖脂質酵素MPIaseに依存し、YidCによって促進される2017

    • 著者名/発表者名
      佐々木 優、松林 英明、車 ゆうてつ、上田 卓也、西山 賢一
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(神戸国際展示場、神戸市)
  • [学会発表] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIaseは生育に必須である2017

    • 著者名/発表者名
      沢里 克宏、佐藤 諒、西川 華子、飯村 直樹、藤川 鉱樹、山口 敏幸、車 ゆうてつ、田村 康、遠藤 斗志也、上田 卓也、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(神戸国際展示場、神戸市)
  • [備考] 岩手大学農学部応用生物化学科分子生物学研究室

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

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公開日: 2018-12-17  

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