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2019 年度 実績報告書

有孔虫における殻形成機構の解明―石灰化のブラックボックスを開く―

研究課題

研究課題/領域番号 17H02978
研究機関高知大学

研究代表者

氏家 由利香  高知大学, 教育研究部自然科学系理工学部門, 准教授 (20573041)

研究分担者 豊福 高志  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭技術開発プログラム), 主任研究員 (30371719)
石谷 佳之  筑波大学, 計算科学研究センター, 研究員 (60772043)
生田 哲朗  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 地球環境部門(海洋生物環境影響研究センター), 技術研究員 (80584846)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードトランスクリプトーム解析 / バイオミネラリゼーション / 有孔虫 / カルシウムシグナリング
研究実績の概要

本研究は、単細胞真核生物・有孔虫のバイオミネラリゼーションの分子機構を明らかにすることを目的としている。石灰質の生体鉱物によって殻を形成する有孔虫は、海洋に広く分布し高いバイオマスを持つため、二酸化炭素の消費・固定に大いに貢献し、海洋の物質循環に深く関わっている。さらに、有孔虫は周辺海水中の多様な溶存イオンを取り込んで殻を形成し、殻が微化石として保存されることから、古海洋環境や層序の指標として重要な役割を果たす。このように、有孔虫の石灰化作用は、地球環境に深く関わり、古生物学・古海洋学の枢要であるにも関わらず、その分子機構は不明であった。そこで本研究では有孔虫が細胞成長とともに殻を形成する特徴に着目し、発現遺伝子を比較することによって、石灰化に関連する遺伝子群を同定した。
底生有孔虫を用い、殻形成・非形成時の個体、各々からRNAを抽出した。抽出産物を用いて比較トランスクリプーム解析を行い、約67Mのペアエンドリードのde novo解析から、殻形成時に有意に高い発現をする遺伝子を同定した。その結果、細胞成長に即して、細胞骨格やエネルギー生成を担うミトコンドリア関連遺伝子の高発現を検出した。カルシウムイオンの細胞外からの取り込み、細胞内での小胞体中への貯蔵とミトコンドリアへの供給に関する遺伝子の高発現も認められた。過多のカルシウムイオンは細胞死などを招くが、細胞外への排出を担うイオンチャネル遺伝子も検出された。これが殻形成場へのカルシウムイオンの供給源になると考えられる。さらに、重炭酸イオンを代謝する炭酸脱水素酵素や細胞外へ排出するイオンチャネル遺伝子の発現も検出された。このように、細胞成長に伴い、細胞を介してのカルシウムイオンの取り込み/排出と重炭酸イオンの代謝/排出が、有孔虫の炭酸塩殻の形成に有効であることが示唆された。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] University of Urbino/University of Siena(イタリア)

    • 国名
      イタリア
    • 外国機関名
      University of Urbino/University of Siena
  • [雑誌論文] Nanoparticle-Biological Interactions in a Marine Benthic Foraminifer2019

    • 著者名/発表者名
      Ciacci Caterina、Grimmelpont Margot V.、Corsi Ilaria、Bergami Elisa、Curzi Davide、Burini Debora、Bouchet Vincent M. P.、Ambrogini Patrizia、Gobbi Pietro、Ujiie Yurika、Ishitani Yoshiyuki、Coccioni Rodolfo、Bernhard Joan M.、Frontalini Fabrizio
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: n/a~

    • DOI

      10.1038/s41598-019-56037-2

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Foraminiferal Ultrastructure: A perspective From Fluorescent and Fluorogenic Probes2019

    • 著者名/発表者名
      Frontalini F.、Losada M. T.、Toyofuku T.、Tyszka J.、Golen J.、Nooijer L.、Canonico B.、Cesarini E.、Nagai Y.、Bickmeyer U.、Ikuta T.、Tsubaki R.、Besteiro Rodriguez C.、Al‐Enezi E.、Papa S.、Coccioni R.、Bijma J.、Bernhard J. M.
    • 雑誌名

      Journal of Geophysical Research: Biogeosciences

      巻: 124 ページ: 2823~2850

    • DOI

      10.1029/2019JG005113

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 海に住む単細胞性石灰化生物 有孔虫の殻形成2019

    • 著者名/発表者名
      豊福 高志、長井 裕季子
    • 雑誌名

      日本結晶成長学会誌

      巻: 46 ページ: n/a~

    • DOI

      10.19009/jjacg.46-3-02

    • 査読あり
  • [学会発表] トランスクリプーム解析に基づく有孔虫の石灰化分子機構2020

    • 著者名/発表者名
      氏家由利香,石谷佳之,石井俊一,長井裕季子,高木義弘,生田哲朗,豊福高志
    • 学会等名
      日本古生物学会2020年例会
  • [学会発表] 有孔虫の大規模分岐年代推定2020

    • 著者名/発表者名
      石谷佳之,矢崎裕規,氏家由利香,稲垣祐司
    • 学会等名
      日本古生物学会2020年例会
  • [学会発表] Transcript assembly and quantification identify candidate genes for foraminiferal calcification2019

    • 著者名/発表者名
      Ujiie, Y., Ishitani, Y., Ishii, S., Nagai,Y., Takaki, Y., Ikuta T., and Toyofuku, T.
    • 学会等名
      JpGU meeting 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] 有孔虫Ammonia beccariiのミトコンドリアに局在するDNA分子群2019

    • 著者名/発表者名
      石谷佳之,久米慶太郎,稲垣祐司
    • 学会等名
      日本共生生物学会2019年度大会
  • [学会発表] Estimation of foraminiferal calcification process from live imaging and FIB-SEM approach2019

    • 著者名/発表者名
      Toyofuku T., Nagai, Y.
    • 学会等名
      JpGU meeting 2019
  • [学会発表] 超微細構造などから推測される底生有孔虫Ammoniaの殻形成機序2019

    • 著者名/発表者名
      豊福高志, 長井裕季子
    • 学会等名
      第14回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [学会発表] 微化石ができる最初の一歩-ここまでわかった現生有孔虫の殻形成-2019

    • 著者名/発表者名
      豊福高志
    • 学会等名
      日本古生物学会2019年年会
    • 招待講演
  • [図書] Oceanography and Marine Biology: An annual Review2019

    • 著者名/発表者名
      Fitzer, S.C., Chan, V.B.S., Meng, Y., Chandra Rajan, K., Suzuki, M., Not, C.A., Toyofuku, T., Falkenberg, L., Byrne, M., Harvey, B.P., De Wit, P., Cusak, M., Gao, K.S., Taylor, P., Dupont, S., Hall-Spencer, J., Vengatesen, T.
    • 総ページ数
      442
    • 出版者
      CRC Press

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公開日: 2021-01-27  

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