ニホンイヌワシの保全を目指した比較ゲノムアプローチ

2019 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17H03624
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 村山 美穂 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60293552)
• 研究分担者: 中嶋 信美 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 室長 (20212087) ; 福田 智一 岩手大学, 理工学部, 教授 (40321640) ; 大沼 学 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 主任研究員 (50442695)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: 大型猛禽類 / ゲノムリシーケンス / 繁殖 / 培養細胞 / 野生動物保全

研究実績の概要

１．培養細胞の整備と活用について、多様な組織への分化能力を有するInduced Pruripotency Stem Cell（iPS細胞）化を試みた。イヌワシ18個体に由来する培養細胞株を作成した。無限分裂細胞を作製するために、変異型CDK4、サイクリンD、TERT、CDK1、サイクリンB、サイクリンE、CDK2の発現ベクターを作成した。また、アマミノクロウサギの初代培養細胞、無限分裂細胞の作成に成功し、英文原著論文を発表した。
２．ゲノムリシーケンスシーケンスデータにもとづく解析を引き続き行い、日本、スコットランド、北米の亜種の遺伝的距離がほぼ同程度であることを見いだした。さらに有効集団サイズの増減を推定し、最終氷期の初め頃に大陸とつながったために最大値となり、その後減少していることを見いだした。新たに23個体のイヌワシよりDNAを精製し、詳細なゲノム解析のための準備を進めた。日本DNAデータバンク（DDBJ)にイヌワシのドラフトゲノム配列を登録した。
３．生態・獣医学的調査について、フンやペレットの試料の採取を継続した。日本の動物園や環境省の関係者と共にスコットランドの生息地を訪問し、エディンバラ大学において国際セミナーを開催して、個体数や繁殖の管理や野生再導入についての情報を収集した。
４．機能遺伝子の検出について、全長配列（2,115bp）を決定したイヌワシのMx遺伝子について、三次元構造予測を行った。その結果、ヒトのMxBタンパク質と高い相同性を示すことが判明した。また、イヌワシの培養細胞（繊維芽細胞）を利用して、高病原性鳥インフルエンザウイルス（H5N1、H5N8およびH5N6亜型）の感染実験を実施した。その結果、感染後に細胞の形態変化や死滅が確認された。今後、感染後の遺伝子の発現パターンの解析を行うため、リアルタイムPCRによるMx遺伝子発現量の解析系を立ち上げた。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] エディンバラ大学/Scottish Natural Heritage(英国)
  • 国名: 英国
  • 外国機関名: エディンバラ大学/Scottish Natural Heritage
• [雑誌論文] Facial width-to-height ratio in chimpanzeeLinks to age, sex and personality (2020)
  • 著者名/発表者名: Wilson V, Weiss A, Lefevre CE, Ochiai T, Matsuzawa T, Inoue-Muraya ma M, Freeman H, Herrelko ES, Altschul D
  • 雑誌名: Evolution and Human Behavior 巻: ー ページ: ー
  • DOI: https://doi.org/10.1016/j.evolhumbehav.2020.03.001
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Assessment of feed resources, management practices and mitigating strategies to feed scarcity in grasscutter (thryonomys swinderianus) production in north-western Ghana. (2020)
  • 著者名/発表者名: Dery TSS, Adenyo C, Kayang BB, Inoue-Murayama M
  • 雑誌名: African Study Monographs 巻: 40 ページ: 149-172
  • DOI: 10.14989/250113
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Primary and immortalized cell lines derived from the Amami rabbit (Pentalagus furnessi) and evolutionally conserved cell cycle control with CDK4 and Cyclin D1 (2020)
  • 著者名/発表者名: Orimoto A, Katayama M, Tani T, Ito K, Eitsuka T, Nakagawa K, Inoue-Murayama M, Onuma M, Kiyono T, Fukuda T
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 525 ページ: 1046-1053
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.03.036
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bacterial and protozoan pathogens/symbionts in ticks infecting wild grasscutters Thryonomys swinderianus in Ghana (2020)
  • 著者名/発表者名: Adenyo C, Ohya K, Qiu Y, Takashima Y, Ogawa H, Matsumoto T, Thu MJ, Sato K, Kawabata H, Katayama Y, Omatsu T, Mizutani T, Fukushi H, Katakura K, Nonaka N, Inoue-Murayama M, Kayang B, Nakao R
  • 雑誌名: Acta Trop 巻: 205 ページ: 105388
  • DOI: 10.1016/j.actatropica.2020.105388
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Comparative Analysis of Fecal Microbiota in Grasscutter (Thryonomys swinderianus) and Other Herbivorous Livestock in Ghana. (2020)
  • 著者名/発表者名: Kawasaki K, Ohya K, Omatsu T, Katayama Y, Takashima Y, Kinoshita T, Odoi JO, Sawai K, Fukushi H, Ogawa H, Inoue-Murayama M, Mizutani T, Adenyo C, Matsumoto Y, Kayang B
  • 雑誌名: Microorganisms 巻: 8 ページ: E265
  • DOI: 10.3390/microorganisms8020265
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] 「野生動物を遺伝子から見る」父親の意味とは (2020)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 雑誌名: モンキー 巻: 4 ページ: 92-93
• [雑誌論文] チンパンジーの糞試料由来のDNAを用いたメチル化解析による年齢推定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 中野 勝光、伊藤 英之、濱野 悠也、玉木 敬二、鵜殿 俊史、平田 聡、井上－村山 美穂
  • 雑誌名: DNA多型 巻: 27 ページ: 59-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] クビワオオコウモリの遺伝的多様性解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 瀧 雄渡、佐藤 悠、井上-村山美穂
  • 雑誌名: DNA多型 巻: 27 ページ: 53-58
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Establishment of immortalized primary cell from the critically endangered Bonin flying fox (Pteropus pselaphon) (2019)
  • 著者名/発表者名: Tani T, Eitsuka T, Katayama M, Nagamine T, Nakaya Y, Suzuki H, Kiyono T, Nakagawa K, Inoue-Murayama M, Onuma M, Fukuda T
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 14 ページ: e0221364
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0221364
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Association of polymorphism of arginine-vasopressin receptor 1A (AVPR1a) gene with trust and reciprocity (2019)
  • 著者名/発表者名: Nishina K, Takagishi H, Takahashi H, Sakagami M, Inoue-Murayama M
  • 雑誌名: Frontiers in Human Neuroscience 巻: 13 ページ: 230
  • DOI: 10.3389/fnhum.2019.00230
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The Tsushima leopard cat exhibits extremely low genetic diversity compared with the Korean Amur leopard cat: Implications for conservation. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ito H, Inoue-Murayama M
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 7 ページ: e7297
  • DOI: 10.7717/peerj.7297
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Vitrification of canine ovarian tissues with polyvinylpyrrolidone preserves the survival and developmental capacity of primordial follicles (2019)
  • 著者名/発表者名: Fujihara M, Kaneko T, Inoue-Murayama M
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 ページ: 3970
  • DOI: 10.1038/s41598-019-40711-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Expression of mutant Cyclin-dependent-kinase, CyclinD, and TERT extends the proliferation period until senescence in chicken and Okinawa rail derived fibroblasts (2019)
  • 著者名/発表者名: Katayama M, Kiyono T, Ohmaki H, Eitsuka T, Endo D, Inoue-Murayama M, Nakajima N, Onuma M, Fukuda T
  • 雑誌名: Journal of Cellular Physiology 巻: 234 ページ: 6709-6720
  • DOI: 10.1002/jcp.27417
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分子マーカーからひもとくウマとヒトの歴史―性格関連遺伝子の種間比較 (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 巻: 71 ページ: 271-277
• [雑誌論文] 「野生動物を遺伝子から見る」広い世界にあこがれて (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 雑誌名: モンキー 巻: 4 ページ: 4-5
• [雑誌論文] 「野生動物を遺伝子から見る」やりたいことがわからない (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 雑誌名: モンキー 巻: 4 ページ: 36-37
• [雑誌論文] Molecular markers untie the history of horses and humans: comparison od personality-related genes between species (2019)
  • 著者名/発表者名: Murayama M
  • 雑誌名: Journal of Animal Law & Interdisciplinary Animal Welfare Studies 巻: ― ページ: 143-152
• [雑誌論文] 「野生動物を遺伝子から見る」屋久島の森で (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 雑誌名: モンキー 巻: 4 ページ: 64-65
• [雑誌論文] Native SAG1 in Toxoplasma gondii lysates is superior to recombinant SAG1 for serodiagnosis of T. gondii infections in chickens (2019)
  • 著者名/発表者名: Appiah-Kwarteng C, Saito T, Toda N, Kitoh K, Nishikawa Y, Adenyo C, Kayang B, Owusu EO, Ohya K, Inoue-Murayama M, Kawahara F, Nagamune K, Takashima Y
  • 雑誌名: Parasitol Int 巻: 69 ページ: 114-120
  • DOI: 10.1016/j.parint.2019.01.001.
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] イヌはなぜヒトの友達になった？遺伝子からみる動物のこころ (2020)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 学会等名: 日立京大ラボ・京都大学 シンポジウム「生物の社会性に学ぶ新たな社会システムの可能性 -QoLの向上をめざして-」
  • 招待講演
• [学会発表] Common Marmoset (Callithrix jacchus) Personality and the Serotonin Receptor Subtype 1A Genotype (2020)
  • 著者名/発表者名: Weiss A, Yokoyama C, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: 第64 回プリマーテス研究会
• [学会発表] アフリカを食べる：グラスカッターの家畜化 (2020)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 学会等名: アフリカ公開講座
  • 招待講演
• [学会発表] Progress of the Ghana Grasscutter Project. (2019)
  • 著者名/発表者名: Miho Murayama
  • 学会等名: Grasscutter Project Workshop
  • 国際学会
• [学会発表] The Evaluation of Genetic Diversity in Tsushima Leopard Cat - Comparing with Amur Leopard Cat in Korea - (2019)
  • 著者名/発表者名: Ito H, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The Third Asian Wild Cat Conservation Workshop 2019
  • 国際学会
• [学会発表] イヌとネコの卵巣を用いた未成熟卵子の凍結保存及び発育誘導によるメス遺伝資源の新たな保存方法の探索 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤原摩耶子，村山美穂
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Cryopreservation and histological analysis of ovarian tissues for the female fertility preservation in Tsushima Leopard Cats (2019)
  • 著者名/発表者名: Fujihara M, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The Third Asian Wild Cat Conservation Workshop 2019
  • 国際学会
• [学会発表] 血液および糞を用いた国内飼育下ユキヒョウの遺伝的多様性の解析（予報） (2019)
  • 著者名/発表者名: 斉 惠元，杉本 太郎，井上‐村山 美穂，木下 こづえ
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] Investigating Olfactory Receptors in Hystricomorpha, a Suborder of Rodentia (2019)
  • 著者名/発表者名: Jenkins S，Adenyo C, Inoue-Murayama M, Kayang BB, Koide T
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] 一次林に生息する野生ボルネオオランウータンにおけるオスの繁殖成功 (2019)
  • 著者名/発表者名: 田島 知之，久世 濃子，金森 朝子，蔦谷 匠，Renata Mendon，山崎 彩夏，Titol P. Malim，Henry Bernard，Vijay S. Kumar，井上 英治，井上‐村山美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] ニワトリの卵巣保存条件が卵子の生存性と遺伝子発現に与える影響 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤原 摩耶子，白石 純一，大沼 学，太田 能之，井上‐村山 美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] クビワオオコウモリのマイクロサテライト解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 瀧 雄渡，Christian E. Vincenot，佐藤 悠，井上-村山 美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] 哺乳類の幹細胞制御遺伝子ネットワーク進化 (2019)
  • 著者名/発表者名: 遠藤 良典，亀井 謙一郎，村山 美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] ニホンザルにおける野生個体由来DNAのメチル化解析による年齢推定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 中野 勝光，伊藤 英之，玉木 敬二，鈴村 崇文，井上‐村山 美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] ニホンイヌワシの主要組織適合遺伝子複合体（MHC）の多型解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 内藤 アンネグレート素，佐藤 悠，前田 琢，井上－村山 美穂
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
• [学会発表] 国立環境研究所における絶滅危惧種の保全遺伝学的研究 ゲノム解析、遺伝的多様性評価および野生動物法医学 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大沼学
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第28回学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] 野生動物保全ラボの挑戦 (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山 美穂
  • 学会等名: 東京で学ぶ京大の知 シリーズ33 「京都大学の女性リーダーたち」
  • 招待講演
• [学会発表] 冷凍動物園：ゲノム、細胞、生態の研究をつないで野生動物の絶滅を防ぐ (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山 美穂
  • 学会等名: 京大モンキーキャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] Investigating Olfactory Receptors in Hystricomorpha, a Suborder of Rodentia (2019)
  • 著者名/発表者名: Jenkins S, Adenyo C, Inoue-Murayama M, Kayang BB, Koide T
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic diversity of the Japanese golden eagle at microsatellite and major histocompatibility complex loci (2019)
  • 著者名/発表者名: Naito AM , Sato Y, Maeda T, Miho Inoue-Murayama
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
  • 国際学会
• [学会発表] Preliminary DNA analysis of non-invasive samples from captive snow leopards in Japanese zoos (2019)
  • 著者名/発表者名: Qi H, Inoue-Murayama M, Kinoshita K
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
  • 国際学会
• [学会発表] mtDNA and microsatellite analyses of the Ryukyu flying fox (2019)
  • 著者名/発表者名: Taki Y, Vincenot CE, Sato Y, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
  • 国際学会
• [学会発表] Exploring surface-based structures underlying marmoset personality by HCP-style imaging. (2019)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama C, Hori Y, Kawasaki A, Takeda C, Weiss A, Inoue-Murayama M, Glasser MF , Essen DV, Hayashi T
  • 学会等名: 3rd Japanese Meeting for Human Brain Imaging
• [学会発表] Conservation genetics of golden eagles in Japan and beyond (2019)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Ogden R, Onuma M, Murayama M
  • 学会等名: Golden Eagle Conservation Science Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Understanding and addressing the decline of golden eagles in Japan (2019)
  • 著者名/発表者名: Osafune Y, Komatsu M, Murayama M
  • 学会等名: Golden Eagle Conservation Science Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] 遺伝子で何がわかる？どこまでわかる？ (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山 美穂
  • 学会等名: 京都大学野生動物研究センター連続セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] DNAから動物を知ろう－絶滅を防ぐために－ (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山 美穂
  • 学会等名: キッズジャンボリー
  • 招待講演
• [学会発表] 野生動物保全を目的とした保全生物学コンソーシアムの構築 (2019)
  • 著者名/発表者名: 金子 武人，亀井 謙一郎，大沼 学，中嶋 信美，木下 こづえ，福田 智一，村山 美穂
  • 学会等名: 第25回日本野生動物医学会大会
• [学会発表] ツシマヤマネコにおける遺伝的多様性の評価‐アムールヤマネコ韓国個体群との比較‐ (2019)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 英之，村山 美穂
  • 学会等名: 第25回日本野生動物医学会大会
• [学会発表] Isolation and characterization of lactic acid bacteria from the gut of grasscutters (Thryonomys swinderianus) in Ghana (2019)
  • 著者名/発表者名: Agbove M, Koomson E, AdenyoC, Tsuchida S, Ushida K, Inoue-Murayama M, Kayang BB.
  • 学会等名: 56th Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation.
  • 国際学会
• [学会発表] 霊長類における糞を用いたDNAメチル化解析による年齢推定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 中野 勝光、伊藤 英之、濱野 悠也、玉木 敬二、鵜殿 俊史、平田 聡、井上－村山 美穂
  • 学会等名: 第35回日本霊長類学会大会
• [学会発表] ダナムバレイに生息する野生ボルネオオランウータンにおけるオスの繁殖成功 (2019)
  • 著者名/発表者名: 田島知之、久世濃子、金森朝子、蔦谷匠、Mendorca、山﨑彩夏、Malim, Bernard, Kumar、井上英治，井上-村山美穂
  • 学会等名: 第35回日本霊長類学会大会
• [学会発表] マカカ属の寛容性における遺伝的基盤の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 井上英治，元廣歩美,村山美穂
  • 学会等名: 第35回日本霊長類学会大会
• [学会発表] Understanding genetic background of personality for stress management in captivity (2019)
  • 著者名/発表者名: Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The 14th International Conference on Environmental Enrichment (ICEE2019KYOTO).
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic diversity of neutral markers and MHC genes in captive Japanese golden eagles: insights into immunity and mate choice (2019)
  • 著者名/発表者名: Naito AM, Sato Y, Forcina G, Maeda T, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The 14th International Conference on Environmental Enrichment (ICEE2019KYOTO).
  • 国際学会
• [学会発表] Investigating genetic structure of the Ryukyu flying fox (2019)
  • 著者名/発表者名: Taki Y , Vincenot CE, Sato Y, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The 14th International Conference on Environmental Enrichment (ICEE2019KYOTO).
  • 国際学会
• [学会発表] Wildlife conservation by preserving female ovaries. (2019)
  • 著者名/発表者名: Fujihara M, Inoue-Murayama M
  • 学会等名: The 10th International Seminar on Biodiversity and Evolution: Wildlife Metagenomics.
  • 国際学会
• [学会発表] 野生動物保全ラボの挑戦－実験室から野外へ－ (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂
  • 学会等名: 兵庫県立龍野高等学校創立記念講演会
  • 招待講演
• [学会発表] 世界のパン欠片中のパン酵母Saccharomyces cerevisiae の多様性 -照葉樹林帯のパン調理とその酵母- (2019)
  • 著者名/発表者名: 長野宏子、井上 英治、村山 美穂、中川 智行、鈴木徹
  • 学会等名: 日本家政学会第71回大会
• [図書] 犬からみた人類史 (2019)
  • 著者名/発表者名: 村山美穂（大石高典、近藤祉秋、池田光穂 編著）
  • 総ページ数: 480
  • 出版者: 勉誠出版
  • ISBN: 978-4-585-23070-0
• [備考] 保全生物学コンソーシアム ー野生動物の絶滅を防ぐゲノム、細胞、生体の研究ー
  • URL: http://web.cc.iwate-u.ac.jp/~takehito/wild_animal/index.html
• [学会・シンポジウム開催] Golden Eagle Conservation Science Meeting (2019)