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2018 年度 実績報告書

侵略的外来種におけるボトルネック後の遺伝的多様性維持と低温適応機構解明

研究課題

研究課題/領域番号 17H03728
研究機関東北大学

研究代表者

牧野 能士  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20443442)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
キーワード侵略的外来種
研究実績の概要

世界各地で外来種が生態系を破壊する問題が深刻化しているが、他の地域から持ち込まれた生物種の全てが新しい環境に定着できるわけではない。北米原産のアメリカザリガニは、赤道地域から高緯度地域に至るまで世界中の様々な環境に適応し、現在も生息範囲を広げている。近年、高温水性である本種が寒冷地においても定着確認されるようになり、侵略的外来種の中にでも環境適応能力の高さが際立っている。本研究の目的は、少数個体からでも生息分布拡大が可能で、短期間で過酷な寒冷地にも侵入したアメリカザリガニの高い環境適応能力の遺伝的基盤を明らかにすることである。本研究で得られる成果は、アメリカザリガニが持つ高い侵略性の基盤を解明するだけでなく他の外来種にも応用が可能で、外来種全体の侵入メカニズムの理解に繋がる。アメリカザリガニの低温耐性に関わる領域の同定を目指したQTL-seq実施に向けて、沖縄集団と札幌集団のそれぞれからサンプリング個体を掛け合わせを行った。抱卵した雌のうち3個体からF1個体を取得できた。低温に応答する遺伝子を推定するため、低温に1週間暴露した沖縄と札幌の個体からRNAを抽出してRNAseqを実施した。同一条件でRNAを抽出した個体がPCA解析でクラスタを形成しなかったため、解析方法の見直しが必要となったが、低温に暴露した札幌個体の遺伝子発現は、明確に他条件と異なるパターンを示し、統計的に有意に低温に応答する遺伝子を多数得た。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

RNAseqデータを用いたPCA解析の結果、同一条件のサンプルがクラスターを形成していない個体が複数観察された。

今後の研究の推進方策

RNAseq解析の条件を見直し、PCA解析およびクラスター解析により同一条件のサンプルがクラスタを形成することを確認する。問題が解消されない場合には、低温暴露実験とRNAseqの追試を行う。寒冷地集団で特異的に自然選択が働いた遺伝子領域、および、低温に応答する遺伝子の候補が、実際に低温に関与するかの機能を調査するため、遺伝子ノックダウン、遺伝子ノックアウトの実施を行う。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2019

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Invasive invertebrates associated with highly duplicated gene content2019

    • 著者名/発表者名
      Makino T and Kawata M
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      10.1111/MEC.15019

    • 査読あり
  • [雑誌論文] JmjC domain-encoding genes are conserved in highly regenerative metazoans and are associated with planarian whole-body regeneration2019

    • 著者名/発表者名
      Cao P, Kumagai N, Inoue T, Agata K and Makino T.
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 11(2) ページ: 552-564

    • DOI

      10.1093/gbe/evz021

    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

公開日: 2019-12-27  

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