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2018 年度 実績報告書

特異な構造と活性をもつ新奇乳酸菌バクテリオシン群の生合成・作用機構の解明と利用

研究課題

研究課題/領域番号 17H03797
研究機関九州大学

研究代表者

善藤 威史  九州大学, 農学研究院, 助教 (50380556)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワード抗菌ペプチド / 乳酸菌 / バクテリオシン / 生合成機構
研究実績の概要

乳酸菌が生産する抗菌ペプチドであるバクテリオシンは、安全性の高い抗菌物質が求められる様々な用途への利用が期待される。我々は、リーダーレスバクテリオシンや環状バクテリオシンなどの構造に特徴をもつものをはじめ、菌種選択的な抗菌活性をもつものや他のバクテリオシンを伴って生産されるものなど、多種多様な新奇乳酸菌バクテリオシンを見出してきた。本研究では、新奇バクテリオシン群の食品保存や関連用途への実用と、その新たな構造と生合成機構を利用した新奇抗菌ペプチドの設計・創出に向けた分子基盤の確立を目指し、種々の新奇乳酸菌バクテリオシン群の生合成機構と抗菌作用の特異な分子機構を解明することを目的としている。
新しい乳酸菌分離株より、特異な活性を示す新奇バクテリオシンを見出し、その精製・構造解析および特性の解析を行い、分子量の大きいタイプのバクテリオシン(バクテリオリシン)などを見出すことができた。新奇性の高いものについては、さらにドラフトゲノム解析等を行い、構造の決定とともに生合成遺伝子群の取得を進めている。一方、環状バクテリオシンであるラクトサイクリシンQやラクトサイクリシンQについては、生合成に必須な遺伝子群の特定に至った。また、同じく環状バクテリオシンであるエンテロシンNKR-5-3Bについては、これまでに構築した異種発現系を用い、環状化に必須な遺伝子およびその遺伝子がコードするタンパク質中の重要なアミノ酸残基を特定することができた。同様にして、多成分バクテリオシントランスポーターについても、その活性に必須のアミノ酸残基が特定された。さらには、異種発現系を用いて、リーダーレスバクテリオシン・ラクティシンQや環状バクテリオシン・エンテロシンNKR-5-3Bの種々の改変体を構築し、その構造と抗菌活性の関係の評価を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新奇性の高い構造や特性を有する新奇乳酸菌バクテリオシンが得られ、ドラフトゲノム解析などにより、その生合成遺伝子群の解析も進んでいる。また、ラクトサイクリシンQやラクトサイクリシンQなどの新奇環状バクテリオシンの生合成必須遺伝子群が特定され、付随する生合成遺伝子群の解析も、それらの異種発現系の構築によって順調に進展している。多成分バクテリオシントランスポーターについての解析も、異種発現系を用いた変異体の構築と解析によって大きく進展した。さらに、環状バクテリオシン・エンテロシンNKR-5-3Bの環状化に関わるタンパク質の同定と、その活性に必須なアミノ酸残基を特定することができた。異種発現系を用いて構築した、リーダーレスバクテリオシン・ラクティシンQと環状バクテリオシン・エンテロシンNKR-5-3Bの改変バクテリオシンについても解析が進展し、抗菌活性に大きな影響を与える構造部位の推定に至った。今後、この知見を応用し、他のバクテリオシンにも同様の手法を適用することで、種々のバクテリオシンの改変や強化の可能と考えられる。

今後の研究の推進方策

研究は順調に進展しており、とくに構造や活性に特徴を持つバクテリオシンについて、優先的に研究を進め、進展を図る。構造未決定のバクテリオシンや新たに発見されたバクテリオシンについても、構造や活性に特徴を持つものについて優先的に精製・構造解析および生合成遺伝子群の解析を進め、ドラフトゲノム解析なども活用しながら、新たな構造・遺伝子情報の充実を図る。環状バクテリオシンの生合成機構については、構築した異種発現系を用いて引き続き解析を進めるとともに、環状化への関与が明らかとなったタンパク質およびそれに相同性を有するタンパク質群の機能解析に重点的に取り組み、環状化機構の解明を目指す。また、リーダーレスバクテリオシンと環状バクテリオシンの共通点には引き続き着目し、環状化機構、分泌機構、自己耐性機構、作用機構などの解明を図る。多くの新奇バクテリオシンとその生合成遺伝子群を利用でき、比較できる優位性を十分に活用しながら、乳酸菌バクテリオシンとその生合成機構を基盤とした、新奇抗菌ペプチドの設計と創出の分子基盤の確立を図る。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] Kasetsart University(タイ)

    • 国名
      タイ
    • 外国機関名
      Kasetsart University
  • [国際共同研究] National Research Center Of Egypt(エジプト)

    • 国名
      エジプト
    • 外国機関名
      National Research Center Of Egypt
  • [雑誌論文] バクテリオシン生合成遺伝子群の機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      善藤威史、岩谷駿、園元謙二
    • 雑誌名

      日本乳酸菌学会誌

      巻: 30 ページ: 18-26

  • [雑誌論文] Evaluation of leader peptides that affect the secretory ability of a multiple bacteriocin transporter, EnkT2018

    • 著者名/発表者名
      Sushida Hirotoshi、Ishibashi Naoki、Zendo Takeshi、Wilaipun Pongtep、Leelawatcharamas Vichien、Nakayama Jiro、Sonomoto Kenji
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 126 ページ: 23~29

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.01.015

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterisation of the action mechanism of a Lactococcus-specific bacteriocin, lactococcin Z2018

    • 著者名/発表者名
      Daba Ghoson Mosbah、Ishibashi Naoki、Gong Xiao、Taki Hiroya、Yamashiro Keisuke、Lim Yen Yi、Zendo Takeshi、Sonomoto Kenji
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 126 ページ: 603~610

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.05.018

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Circular and Leaderless Bacteriocins: Biosynthesis, Mode of Action, Applications, and Prospects2018

    • 著者名/発表者名
      Perez Rodney H.、Zendo Takeshi、Sonomoto Kenji
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 9 ページ: 2085

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.02085

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The lantibiotic nukacin ISK-1 exists in an equilibrium between active and inactive lipid-II binding states2018

    • 著者名/発表者名
      Fujinami Daisuke、-Mahin Abdullah-Al、Elsayed Khaled M.、Islam Mohammad R.、Nagao Jun-ichi、Roy Urmi、Momin Sabrina、Zendo Takeshi、Kohda Daisuke、Sonomoto Kenji
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 1 ページ: 150

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0150-3

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 多種の乳酸菌バクテリオシンを分泌する新奇ABCトランスポーターEnkTの分子機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      和田夏美、須志田浩稔、Perez R.H.、善藤威史、園元謙二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] 環状バクテリオシン、エンテロシンNKR-5-3Bの環状化を担うタンパク質の解析2019

    • 著者名/発表者名
      佐戸翔太、PEREZ R.H.、善藤威史、園元謙二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] Characterization of a Lactococcus-specific bacteriocin, lactococcin Z for its biosynthesis and mechanisms of action2018

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Zendo, Ghoson Mosbah Daba, Naoki Ishibashi, Kenji Sonomoto
    • 学会等名
      6th International Symposium on Antimicrobial Peptides
    • 国際学会
  • [学会発表] Insights into the molecular mechanism on the biosynthesis of the circular bacteriocin, enterocin NKR-5-3B2018

    • 著者名/発表者名
      Rodney H. Perez, Haruki Sugino, Takeshi Zendo, Kenji Sonomoto
    • 学会等名
      6th International Symposium on Antimicrobial Peptides
    • 国際学会
  • [学会発表] 部位特異的変異による乳酸菌バクテリオシンの強化2018

    • 著者名/発表者名
      竹内啓記、Perez R.H.、石橋直樹、善藤威史、園元謙二
    • 学会等名
      2018年度日本乳酸菌学会大会
  • [学会発表] バクテリオシン生合成遺伝子群の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      善藤威史
    • 学会等名
      2018年度日本乳酸菌学会秋期セミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] Characterization of biosynthesis of circular antimicrobial peptides by lactic acid bacteria2018

    • 著者名/発表者名
      Takeshi ZENDO
    • 学会等名
      4th International Conference on Circular Proteins and Peptides
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Understanding the biosynthetic mechanism of the circular antimicrobial peptide, enterocin NKR-5-3B, from Enterococcus faecium2018

    • 著者名/発表者名
      Rodney H. Perez, Haruki Sugino, Takeshi Zendo, Kenji Sonomoto
    • 学会等名
      4th International Conference on Circular Proteins and Peptides
    • 国際学会
  • [図書] 天然系抗菌・防カビ剤の開発と応用2019

    • 著者名/発表者名
      和田夏美、善藤威史、園元謙二(監修:坂上吉一)
    • 総ページ数
      233
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1260-6

URL: 

公開日: 2019-12-27  

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