| 研究課題/領域番号 |
17H03956
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| 研究機関 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
星野 辰彦 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 高知コア研究所, 主任研究員 (30386619)
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| 研究分担者 |
浦本 豪一郎 高知大学, 海洋コア総合研究センター, 特任助教 (70612901)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 微生物 / 海底下 / 次世代シーケンサー / 進化 / 堆積物 |
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| 研究実績の概要 |
国際深海科学掘削計画（IODP)による航海をはじめとした科学掘削航海により採取された海底下堆積物から抽出したDNAサンプルから、バクテリアおよびアーキアをターゲットとしたプライマーセットを用いて16S rRNA遺伝子を増幅し、次世代シーケンサーによりシーケンシングを行なった。得られたシーケンスライブラリを用いて、堆積物に生息する微生物群衆構造の比較解析を行うとともに堆積物深度や間隙水の化学組成などの物理・化学メタデータとの相関も合わせて解析し、海底下堆積物中の微生物群衆構造を規定する因子について考察した。海底下の微生物群衆構造は、沿岸部と外洋部において大きく異なることがわかった。この差異は、海洋表層の一時生産量や海底面への有機物供給フラックスあるいは堆積物中の酸化還元状態の違いにより生み出されていると思われるが、より詳細な解析が必要である。また、海底表層付近と海底下深部の堆積物の微生物群衆構造の比較解析により、海底表層の堆積物で優占化している微生物種のいくつかが深部に渡っても普遍的に存在していることがわかった。また、海底下堆積物から抽出されたDNAは微量であるため、それらの微量DNAからメタゲノム解析を行うためのプロトコルの解析に着手し、現在実験条件を詰める作業を行なっている。
平成３０年度以降のメタゲノム解析では、今年度に見出された深度に関わらず普遍的に存在する微生物種をターゲットに解析を行うことにより、海底下深部生命の進化・適応プロセスについて明らかにしていきたい。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初計画通り海底下堆積物中の微生物群衆構造を網羅的に解析し、平成30年度以降の研究に資するデータを得ることができている。
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は、まず堆積物から得られた微量DNAからのメタゲノム解析プロトコルを確立を行う。引き続いて、平成29年度に得られた微生物群衆構造データに基づき、研究対象とする堆積物を絞りメタゲノム解析を実施する。
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