研究実績の概要 |
対照群または妊娠期に無機ヒ素を投与した母マウス(ヒ素群)から生まれた仔世代(F1)の精子small RNAの次世代シークエンスデータについて解析を行った。各群雄マウス7~9匹の精子を1サンプルとして、対照群およびヒ素群各3サンプルのsmall RNA-seqデータについて解析した。15塩基から45塩基長のRNAを読み取り、small RNAアノテーションパイプラインであるSPORTS1.0を用いてアノテーションを付した。環境因子曝露の影響の次世代への伝搬への関与が報告されている精子中のsmall RNAであるtRNAフラグメント(tRF)、piRNA およびmiRNA について、各サンプル中それぞれ約132万~251万、126万~250万、および32,000~69,000リードを取得した。十分なリード数が得られたtRFおよびpiRNAの解析の結果、一定数以上のリード数をもち各small RNA内で対照群とヒ素群で存在量が有意に異なる配列を明らかにした。それらの変化の生理的意義または役割に関して、これまでに筆者らが明らかにしたヒ素群F1精子におけるレトロトランスポゾンのDNAメチル化低下との関連や、他の研究ですでに明らかにされている機能との関連から考察した。
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