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2019 年度 実績報告書

原発性胆汁性胆管炎の発症と重症化機構解明のためのGWASを基盤とした統合解析

研究課題

研究課題/領域番号 17H04169
研究機関独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター)

研究代表者

中村 稔  独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 客員研究員 (40217906)

研究分担者 川嶋 実苗  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員 (00396706)
人見 祐基  星薬科大学, 薬学部, 特任講師 (10525819)
下田 慎治  九州大学, 大学病院, 准教授 (30279319)
安波 道郎  地方独立行政法人佐賀県医療センター好生館(ライフサイエンス研究所), ライフサイエンス研究所, 部長 (80244127)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワード原発性胆汁性胆管炎 / ゲノムワイド関連解析 / トランスクリプトーム / 疾患感受性遺伝子 / 疾患発症経路 / 分子標的
研究実績の概要

本研究では、“原発性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangitis :PBC)の長期観察研究”を継続して①PBCの疾患活動性、長期予後、病型分類などに関する詳細な臨床情報と患者検体(血清、DNA, 肝生検組織など)の収集を継続するとともに、②ゲノムワイド関連解析(Genome-wide association study: GWAS)の解析症例数を増やして、PBC疾患関連遺伝子の同定、疾患発症経路の解析を行った。③イギリスケンブリッジ大学、イタリアミラノ大学などとの国際PBC-GWAS メタ解析を実施し、世界規模での疾患感受性遺伝子と疾患発症経路の解析を行った。④GWASと肝生検組織のトランスクリプトームの統合解析によるPBCの発症経路の同定、分子標的候補の同定を試みた。
日本人PBC 2049検体とコントロール1985例のGWASから、⑤Chr3q13.33領域に新たなPBC疾患感受性遺伝子POGLUT1が同定され、⑥GWASとトランスクリプトームとの統合解析からは、PBC疾患発症に最も重要な上流因子としてIFNGとCD40Lが同定された。現在、⑥ゲノム編集を用いた責任SNPの機能解析、PBCと他の疾患のトランスクリプトームの比較検討、ゲノム情報解析技術を駆使して国際メタ解析で得られた情報のpost-GWAS解析に取り組んでいる。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (18件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 7件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Integrated GWAS and mRNA microarray analysis identified IFNG and CD40L as the central upstream regulators in primary biliary cholangitis2020

    • 著者名/発表者名
      Kazuko Ueno, Yoshihiro Aiba, Yuki Hitomi, Shinji Shimoda, Hitomi Nakamura, Olivier Gervais,---- Minoru Nakamura and PBC-GWAS consortium in Japan
    • 雑誌名

      Hepatology Communications

      巻: 45(5) ページ: 724-738

    • DOI

      10.1002/hep4.1497. eCollection 2020 May

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] POGLUT1, the putative effector gene driven by rs2293370 in primary biliary cholangitis susceptibility locus chromosome 3q13.332019

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Y, Ueno K, Kawai Y, Nishida N, Kojima K, Kawashima M, ---- Nakamura M.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 9(1) ページ: 102

    • DOI

      10.1038/s41598-018-36490-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role of deleterious single nucleotide variants in the coding regions of TNFAIP3 for Japanese autoimmune hepatitis with cirrhosis2019

    • 著者名/発表者名
      Higuchi T, Oka S, Furukawa H, Nakamura M, Komori A, Abiru S, Hashimoto S, Shimada M, Yoshizawa K, Kouno H, Naganuma A, Ario K, Kaneyoshi T, Yamashita H, Takahashi H, Makita F, Yatsuhashi H, Ohira H, Migita K.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 9(1) ページ: 7925

    • DOI

      10.1038/s41598-019-44524-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Galectin-9 in autoimmune hepatitis: Correlation between serum levels of galectin-9 and M2BPGi in patients with autoimmune hepatitis2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka N, Kozuru H, Koga T, Abiru S, Yamasaki K, Komori A, Fujita Y, Tenmoku J, Asano T, Sato S, Suzuki E, Furuya M, Kobayashi H, Watanabe H, Naganuma A, Yoshizawa K, Shimada M, Ario K, Yamashita H, Kohno H, Kaneyoshi T, Nakamura M, Furukawa H, Takahashi A, Kawakami A, Ohira H, Yatsuhashi H, Migita K.
    • 雑誌名

      Medicine (Baltimore)

      巻: 98(35) ページ: e16924

    • DOI

      10.1097/MD.0000000000016924

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Genome-wide Association Study Identifying RAP1A as a Novel Susceptibility Gene for Crohn's Disease in Japanese Individuals.2019

    • 著者名/発表者名
      Kakuta Y, Kawai Y, Naito T, Hirano A, Umeno J, Fuyuno Y, et al
    • 雑誌名

      J Crohns Colotis

      巻: 13 ページ: 648-658

    • DOI

      10.1093/ecco-jcc/jjy197

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Genetics of Autoimmune Liver Disease.2019

    • 著者名/発表者名
      Nakamura M.
    • 学会等名
      APASL STC Tokyo 2019.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Integrated analysis of GWAS and mRNA microarray identified IFNG and CD40L as the central upstream-regulators in primary biliary cholangitis.2019

    • 著者名/発表者名
      Ueno K, Aiba Y, Shimoda S, et al
    • 学会等名
      The International Liver Congress 2019 (ILC2019)
    • 国際学会
  • [学会発表] POGLUT1, The Effector Gene Driven by rs2293370 in Primary Biliary Cholangitis (PBC) Susceptibility Locus Chromosome 3q13.33 in The Japanese Population2019

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Y, Ueno K, Kayai Y, et al.
    • 学会等名
      APASL STC Tokyo 2019.
    • 国際学会
  • [学会発表] Pathway-Analysis Using Datasets of GWAS and mRNA Expression Array Identified IFNG as the Most Significant Upstream-Regulator in Primary Biliary Cholangitis.2019

    • 著者名/発表者名
      Ueno K, Aiba Y, Hitomi Y, et al
    • 学会等名
      APASL STC Tokyo 2019.
    • 国際学会
  • [学会発表] Integrated analysis of GWAS and mRNA expression array identified IFNG and CD40L as the most significant upstream-regulators in primary biliary cholangitis.2019

    • 著者名/発表者名
      Ueno K, Aiba Y, Hitomi Y, et al
    • 学会等名
      The 69th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (ASHG 2019).
    • 国際学会
  • [学会発表] The role of PRKCB in the development of primary biliary cholangitis2019

    • 著者名/発表者名
      Aiba Y, Ueno K, Hitomi Y, et al
    • 学会等名
      AASLD THE LIVER MEETING 2019.
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of novel biliary epithelial cell biomarkers in primary biliary cholangitis (PBC).2019

    • 著者名/発表者名
      Shimoda S, Harada K, Nakamura M , et al.
    • 学会等名
      AASLD THE LIVER MEETING 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Role of PRKCB in the development of primary biliary cholangitis.2019

    • 著者名/発表者名
      Aiba Y, Hitomi Y, Ueno K, et al.
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting of the Japanese Society of Immunology(第48回日本免疫学会学術集会 ).
  • [学会発表] PBC診断・治療バイオマーカーと新たな治療標的分子の確立.2019

    • 著者名/発表者名
      下田慎治, 原田憲一、中村 稔
    • 学会等名
      第105回日本消化器病学会総会.
  • [学会発表] 新たなPBC治療標的分子の同定と治療へのアプローチ.2019

    • 著者名/発表者名
      下田慎治, 原田憲一、中村 稔
    • 学会等名
      第55回日本肝臓学会総会.
  • [学会発表] 日本人原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子領域3番染色体長腕13.33に位置するcausal variantおよびエフェクター遺伝子POGLUT1の同定.2019

    • 著者名/発表者名
      人見祐基, 中村 稔
    • 学会等名
      第55回日本肝臓学会総会.
  • [学会発表] 原発性胆汁性胆管炎の肝組織網羅的遺伝子発現データを用いた疾患感受性遺伝子ならびに疾患関連pathwayの解析2019

    • 著者名/発表者名
      相葉佳洋、西田奈央, 人見祐基, 小森敦正, 八橋 弘, 中村 稔.
    • 学会等名
      第55回日本肝臓学会総会.
  • [図書] 日本臨床2020

    • 著者名/発表者名
      中村 稔
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      日本臨床社
    • ISBN
      0047-1852

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公開日: 2021-01-27  

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