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2019 年度 実績報告書

次世代型RNAバイオマーカーの基盤構築と臨床応用

研究課題

研究課題/領域番号 17H04282
研究機関大阪大学

研究代表者

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

研究分担者 小関 準  大阪大学, 医学系研究科, 特任助教(常勤) (20616669)
今野 雅允  大阪大学, 医学系研究科, 寄附講座講師 (80618207)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワード癌 / 臨床 / 外科 / 核酸 / トランスレーショナルリサーチ
研究実績の概要

平成29年度から令和元年度までの研究期間の内、令和元年度においては、体液中に分泌される小さな非コードRNAの疾患バイオマーカーとしての有用性を確認した。私達は、質量分析法により、マイクロRNA配列上の特定部位のメチル化修飾を計測する新技術を世界で初めて開発した。私達のパイロット研究で、膵癌を含む消化器癌の早期診断において、従来のバイオマーカーを凌駕する高い性能が得られている。マイクロRNAのメチル化は、細胞組織のエピゲノム病態を反映しているため、高精度に得られた計測結果は、早期診断やサブクラス分類にきわめて有用である。本計画ではこの『コア技術』を活用して、消化器癌や他の疾患を含めて幅広く検討し、『データ科学』に基づく次世代医療のバイオマーカーとして確立する研究を実施した。マイクロRNA配列上の特定部位のメチル化修飾を計測する技術とともに、この部位に関する生化学的な重要性を明らかにするために動物モデルを構築し、人における次世代型RNAバイオマーカーの基盤構築と臨床応用を目指して開発研究を行った。現在この研究で得られた知的財産の整備と産学連携導出に向けた活動を展開している。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (18件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 2件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] One-carbon metabolism for cancer diagnostic and therapeutic approaches2020

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Koseki Jun、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Letters

      巻: 470 ページ: 141~148

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.11.023

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Theoretical analyses and experimental validation of the effects caused by the fluorinated substituent modification of DNA2020

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Horie Naohiro、Tsunekuni Kenta、Kawamoto Koichi、Obika Satoshi、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 ページ: 1138

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57899-7

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Distinct methylation levels of mature microRNAs in gastrointestinal cancers2019

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Yamagata Akira、Shimamura Teppei、Motooka Daisuke、Okuzaki Daisuke、Kawamoto Koichi、Mizushima Tsunekazu、Eguchi Hidetoshi、Takiguchi Shuji、Satoh Taroh、Mimori Koshi、Ochiya Takahiro、Doki Yuichiro、Ofusa Ken、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 ページ: 3888

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11826-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reproducibility of CRISPR-Cas9 methods for generation of conditional mouse alleles: a multi-center evaluation2019

    • 著者名/発表者名
      Gurumurthy Channabasavaiah B.、Ishii Hideshi、Nakashima Kenichi、Obata Yuichi、Ogiwara Sanae、Ouellet Mariette、Oxburgh Leif、Piltz Sandra、Pinz Ilka、Ponnusamy Moorthy P、Burgio Gaetan
    • 雑誌名

      Genome Biology

      巻: 20 ページ: 171

    • DOI

      10.1186/s13059-019-1776-2

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CD44/CD133-Positive Colorectal Cancer Stem Cells are Sensitive to Trifluridine Exposure2019

    • 著者名/発表者名
      Tsunekuni Kenta、Konno Masamitsu、Haraguchi Naotsugu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Matsuoka Kazuaki、Kobunai Takashi、Takechi Teiji、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: 14861

    • DOI

      10.1038/s41598-019-50968-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Application of C. elegans cancer screening test for the detection of pancreatic tumor in genetically engineered mice2019

    • 著者名/発表者名
      Ueda Yuji、Kawamoto Koichi、Konno Masamitsu、Noguchi Kozo、Kaifuchi Satoru、Satoh Taroh、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Hirotsu Takaaki、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 10 ページ: 5412~5418

    • DOI

      10.18632/oncotarget.27124

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Hydrogen Peroxide Activatable Gemcitabine Prodrug for the Selective Treatment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma2019

    • 著者名/発表者名
      Matsushita Katsunori、Konno Masamitsu、Kasahara Yuuya、Morihiro Kunihiko、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi、Obika Satoshi
    • 雑誌名

      ChemMedChem

      巻: 14 ページ: 1384~1391

    • DOI

      10.1002/cmdc.201900324

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Significant Epitranscriptomes in Heterogeneous Cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Taniguchi Masateru、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 110 ページ: 2318~2327

    • DOI

      10.1111/cas.14095

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Computational analyses for cancer biology based on exhaustive experimental backgrounds2019

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Drug Resistance

      巻: 2 ページ: 419~427

    • DOI

      10.20517/cdr.2019.33

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] RNA metabolism can be a novel new bio marker for malignant gastrointestinal cancer2019

    • 著者名/発表者名
      M. Konno, H. Ishii,
    • 学会等名
      Cell Symposia: Regulatory RNAs
    • 国際学会
  • [学会発表] RNA 塩基修飾を指標とした早期膵がんの新規バイオマーカー2019

    • 著者名/発表者名
      今野 雅允、小関 準、島村 徹平、浅井 歩、石井 秀始
    • 学会等名
      第21回日本RNA学会年会
  • [学会発表] 転移とEMT・がん幹細胞2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始
    • 学会等名
      第28回 日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] 代謝を利用した診断2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、曽我 朋義
    • 学会等名
      第7回がんと代謝研究会in仙台
  • [学会発表] RNA 代謝ががんの悪性化を生み出す2019

    • 著者名/発表者名
      今野雅允、小関 準、島村 徹平、浅井 歩、石井 秀始
    • 学会等名
      第7回がんと代謝研究会in仙台
  • [学会発表] がんエピトランスクリプトームを活用した新しい診断と治療2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始
    • 学会等名
      第11回日本RNAi研究会(The 11th JARI Annual Meeting)
  • [学会発表] Innovative technology for next generation liquid biopsy 次世代リキッドバイオプシーのための新技術2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、Chwee Teck Lim
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 消化器がん治療のための理論科学手法と機械学習を駆使した創薬研究2019

    • 著者名/発表者名
      小関 準、今野 雅允、土岐 祐一郎、石井 秀始
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] エピトランスクリプトーム ー消化器がんの新規バイオマーカー2019

    • 著者名/発表者名
      今野 雅允、石井 秀始
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会

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公開日: 2021-01-27  

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