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2019 年度 実績報告書

アジア・カリブ開発途上地域における新興薬剤耐性菌の蔓延実態解明と包括的分子疫学

研究課題

研究課題/領域番号 17H04664
研究機関札幌医科大学

研究代表者

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

研究分担者 鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
アウン メイジソウ  札幌医科大学, 医学部, 助教 (10749584)
川口谷 充代  札幌医科大学, 医学部, 助教 (70733062)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (80396308)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワード薬剤耐性菌 / 分子疫学 / 開発途上国 / メチシリン耐性黄色ブドウ球菌 / カルバペネム耐性腸内細菌
研究実績の概要

今年度はミャンマー、キューバに重点を置き、新興薬剤耐性菌の包括的な分子疫学的解析を行うことを目的とした。ミャンマーではヤンゴン市内の総合病院で分離された黄色ブドウ球菌、大腸菌、肺炎桿菌を対象に薬剤耐性とそれに関与する遺伝子、および分子疫学的特徴を解析した。黄色ブドウ球菌に占めるMRSA(メチシリン耐性菌)の割合は14%であり、PVL毒素遺伝子はMRSAにおいてMSSA(メチシリン感受性菌)よりも高い検出率(67%)を示した。PVL陽性株では、インドに多いST772(ベンガル湾クローン)が7割を占めていた。大腸菌については、以前に収集した426株中50株で検出されたCMY型βラクタマーゼの種類とその分布について解析した。CMY遺伝子は9種に分けられ、そのうちCMY-42が最も多く、また3種類は新規の型として今回初めて同定された。世界中で報告されたCMY遺伝子を含め系統解析を行ったところ、大きく4つの群に分けられ、そのうちCMY-42を含むCMY-2群が最も多くのCMY遺伝子を包含し、世界的に拡がっていることが示唆された。肺炎桿菌は、呼吸器感染由来の191株を解析し、ESBLが33%、カルバペネマーゼ遺伝子が7%に分布、さらに6割がキノロン耐性を示すことが明らかとなった。キノロン耐性菌はすべてDNAジャイレース遺伝子に変異を有し、プラスミド性キノロン耐性遺伝子も併せ持っていた。キューバでは全国から集められた306株の大腸菌を解析したところ、6割がCTX-M型ESBLを有しており、NDM型のカルバペネマーゼ遺伝子保有株を同国で初めて検出した。また過去5年間にわたり収集されたアシネトバクターを解析したところ、15%の株にカルバペネマーゼ遺伝子(NDM-1)が検出された。以上より、菌種による耐性遺伝子の種類および分布の特徴が明らかとなった。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] ヤンゴン第二医科大学(ミャンマー)

    • 国名
      ミャンマー
    • 外国機関名
      ヤンゴン第二医科大学
  • [国際共同研究] マイメンシン医科大学(バングラデシュ)

    • 国名
      バングラデシュ
    • 外国機関名
      マイメンシン医科大学
  • [国際共同研究] Pedro Kouri熱帯医学研究所(キューバ)

    • 国名
      キューバ
    • 外国機関名
      Pedro Kouri熱帯医学研究所
  • [雑誌論文] High Prevalence of CTX-M Type Extended-Spectrum Beta-Lactamase Genes and Detection of NDM-1 Carbapenemase Gene in Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli in Cuba2020

    • 著者名/発表者名
      Quinones D, Aung MS, Carmona Y, Gonzalez MK, Pereda N, Hidalgo M, Rivero M, Zayas A, Del Campo R, Urushibara N, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Pathogens

      巻: 9 ページ: E65

    • DOI

      10.3390/pathogens9010065

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] First detection of the mcr-1 colistin resistance gene in Escherichia coli from a patient with urinary tract infection in Myanmar2019

    • 著者名/発表者名
      San N, Aung MS, Thu PP, Myint YY, Aung MT, San T, Mar TT, Lwin MM, Maw WW, Hlaing MS, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      New Microbes New Infect

      巻: 30 ページ: 100550

    • DOI

      10.1016/j.nmni.2019.100550

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Characterization of Methicillin-Susceptible and -Resistant Staphylococcus aureus Harboring Panton-Valentine Leukocidin-Encoding Bacteriophages in a Tertiary Care Hospital in Myanmar2019

    • 著者名/発表者名
      Aung MS, San T, Urushibara N, San N, Oo WM, Soe PE, Kyaw Y, Ko PM, Thu PP, Hlaing MS, Kawaguchiya M, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Microb Drug Resist

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1089/mdr.2019.0208

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic Diversity of CMY Beta-Lactamase Genes in Clinical Isolates of Escherichia coli in Myanmar: Identification of Three Novel Types and Updated Phylogenetic Classification of bla(CMY)2019

    • 著者名/発表者名
      San N, Aung MS, Urushibara N, San T, Maw WW, Lwin MM, Mar TT, Myint YY, Thu PP, Hlaing MS, Ganesh B, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Microb Drug Resist

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1089/mdr.2019.0234

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] ミャンマーにおける黄色ブドウ球菌の分子疫学とPVL遺伝子の分布状況2020

    • 著者名/発表者名
      小林宣道、メイジソウアウン、漆原範子、川口谷充代、ニラサン、ヤミンチョウ、ピョマイコウ、ウィンマーウー、ティダサン
    • 学会等名
      第90回日本衛生学会総会(誌上開催)
  • [学会発表] Molecular epidemiology and prevalence of extended-spectrum beta-lactamase and carbapenem genes of extraintestinal pathogenic Escherichia coli in Cuba2019

    • 著者名/発表者名
      Quinones D, Aung MS, Cartaya YC, Novales NP, Kobayashi N
    • 学会等名
      29th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular epidemiological characterization of methicillin-susceptible and -resistant Staphylococcus aureus isolated from skin and soft tissue infections in Bangladesh2019

    • 著者名/発表者名
      Nazia Haque, Meiji Soe Aung, Noriko Urushibara, Mitsuyo Kawaguchiya, Shyamal Kumar Paul, Nobumichi Kobayashi.
    • 学会等名
      第64回日本ブドウ球菌研究会

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公開日: 2021-01-27  

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