感染者隔離効果の推定手法開発と隔離の有効性メカニズムの解明

2020 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 17H04701
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 西浦 博 京都大学, 医学研究科, 教授 (70432987)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: 感染症情報 / 疫学 / 数理モデル / 危機管理 / 保健情報

研究実績の概要

隔離を含む非医学的（非薬物的）対策は病原体に非特異的なため、未だワクチンや治療法が開発されていない感染症など、幅広い対象に実施可能である。しかし、隔離による2次感染予防効果は具体的な数値として明らかにされておらず、例えば2014-16年に西アフリカで流行したエボラ出血熱に対して隔離が2次感染をどれだけ防ぎ得たかは未だ疫学的・統計学的に分析されてこなかった。本研究の目的は、感染者の感染後経過時刻の関数として隔離実施を加味した2次感染発生の数理モデルを構築し、疫学情報およびゲノム情報の両方を含む観察データを分析することにより、隔離の効果を明示的に推定することである。基礎的方法論の確立に引き続き、1回の接触毎の感染成立確率を推定可能にすることにより、隔離をその具体的内容に分解して評価可能にすべく研究に取り組んだ。

まず第1に、予定してきた通り、エボラ出血熱の隔離の効果について推定する研究を原著論文として報告した。発病後に隔離されることによって2次感染が減ることと、発症間隔が短縮されることの2点の情報を活用し、2014-16年のエボラ出血熱の隔離は措置後に2次感染を約60％程度低下させてきたことを示すことができた。第2に、折しも本研究課題は新型コロナウイルス感染症の流行初期と重複する時期に実施された。そこで、関連するモデルを発展させることにより、潜伏期間と発症間隔のそれぞれを検討する限りは、新型コロナウイルス感染症の2次感染が発病前に40％以上が起こることを世界に先駆けて報告した。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Transmission Network of Measles During the Yamagata Outbreak in Japan, 2017 (2022)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Tetsuro、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Epidemiology 巻: 32 ページ: 96～104
  • DOI: 10.2188/jea.JE20200455
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Estimation of R(t) based on illness onset data: An analysis of 1907?1908 smallpox epidemic in Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Nakajo Ko、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Epidemics 巻: 38 ページ: 100545～100545
  • DOI: 10.1016/j.epidem.2022.100545
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Reconstructing the transmission dynamics of varicella in Japan: an elevation of age at infection (2022)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Ayako、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 10 ページ: e12767～e12767
  • DOI: 10.7717/peerj.12767
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Phenomenological and mechanistic models for predicting early transmission data of COVID-19 (2021)
  • 著者名/発表者名: Miyama Takeshi、Hiroshi Nishiura
  • 雑誌名: Mathematical Biosciences and Engineering 巻: 19 ページ: 2043～2055
  • DOI: 10.3934/mbe.2022096
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Relative Reproduction Number of SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) Compared with Delta Variant in South Africa (2021)
  • 著者名/発表者名: Nishiura Hiroshi、Ito Kimihito、Anzai Asami、Kobayashi Tetsuro、Piantham Chayada、Rodr?guez-Morales Alfonso J.
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 11 ページ: 30～30
  • DOI: 10.3390/jcm11010030
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Not all fun and games: Potential incidence of SARS-CoV-2 infections during the Tokyo 2020 Olympic Games (2021)
  • 著者名/発表者名: Linton Natalie M.、School of Public Health, Kyoto University, Kyoto, Japan、Jung Sung-mok、Nishiura Hiroshi、Graduate School of Medicine, Hokkaido University, Sapporo, Japan
  • 雑誌名: Mathematical Biosciences and Engineering 巻: 18 ページ: 9685～9696
  • DOI: 10.3934/mbe.2021474
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Epidemic Risk of Dengue Fever in Japan: Climate Change and Seasonality (2021)
  • 著者名/発表者名: Wang Xia、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Canadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology 巻: 2021 ページ: 1～13
  • DOI: 10.1155/2021/6699788
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Increasing rates of laparoscopic gastrointestinal surgery and decreasing rates of surgical site infections: an observational study in Japan from 2012?2017 (2021)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Tomoko、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: BMC Surgery 巻: 21 ページ: -
  • DOI: 10.1186/s12893-021-01373-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Assessing countermeasures during a hepatitis A virus outbreak among men who have sex with men (2021)
  • 著者名/発表者名: Saito Ryohei、Imamura Akifumi、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Theoretical Biology and Medical Modelling 巻: 18 ページ: -
  • DOI: 10.1186/s12976-021-00150-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Predicting the effective reproduction number of COVID-19: inference using human mobility, temperature, and risk awareness (2021)
  • 著者名/発表者名: Jung Sung-mok、Endo Akira、Akhmetzhanov Andrei R.、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: International Journal of Infectious Diseases 巻: 113 ページ: 47～54
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2021.10.007
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Analysis of international traveler mobility patterns in Tokyo to identify geographic foci of dengue fever risk (2021)
  • 著者名/発表者名: Yuan Baoyin、Lee Hyojung、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Theoretical Biology and Medical Modelling 巻: 18 ページ: -
  • DOI: 10.1186/s12976-021-00149-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Long-term dynamics of <i>Norovirus</i> transmission in Japan, 2005?2019 (2021)
  • 著者名/発表者名: Misumi Megumi、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 9 ページ: e11769～e11769
  • DOI: 10.7717/peerj.11769
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Estimating COVID-19 cases infected with the variant alpha (VOC 202012/01): an analysis of screening data in Tokyo, January-March 2021 (2021)
  • 著者名/発表者名: Murayama Hiroaki、Kayano Taishi、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Theoretical Biology and Medical Modelling 巻: 18 ページ: -
  • DOI: 10.1186/s12976-021-00146-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Exploring secondary SARS-CoV-2 transmission from asymptomatic cases using contact tracing data (2021)
  • 著者名/発表者名: Nakajo Ko、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Theoretical Biology and Medical Modelling 巻: 18 ページ: -
  • DOI: 10.1186/s12976-021-00144-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Predicted dominance of variant Delta of SARS-CoV-2 before Tokyo Olympic Games, Japan, July 2021 (2021)
  • 著者名/発表者名: Ito Kimihito、Piantham Chayada、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Eurosurveillance 巻: 26 ページ: -
  • DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.27.2100570
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Recovery of antimicrobial susceptibility in methicillin-resistant <i>Staphylococcus aureus</i> (MRSA): a retrospective, epidemiological analysis in a secondary care hospital, Sapporo, Japan (2021)
  • 著者名/発表者名: Koike Yuji、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 9 ページ: e11644～e11644
  • DOI: 10.7717/peerj.11644
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Estimation of the Actual Incidence of Coronavirus Disease (COVID-19) in Emergent Hotspots: The Example of Hokkaido, Japan during February?March 2020 (2021)
  • 著者名/発表者名: Akhmetzhanov Andrei R.、Mizumoto Kenji、Jung Sung-Mok、Linton Natalie M.、Omori Ryosuke、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 10 ページ: 2392～2392
  • DOI: 10.3390/jcm10112392
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Assessing the geographic range of classical swine fever vaccinations by spatiotemporal modelling in Japan (2021)
  • 著者名/発表者名: Yang Yichi、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Transboundary and Emerging Diseases 巻: 2021 ページ: -
  • DOI: 10.1111/tbed.14171
  • 査読あり
• [雑誌論文] Projecting a second wave of COVID-19 in Japan with variable interventions in high-risk settings (2021)
  • 著者名/発表者名: Jung Sung-mok、Endo Akira、Kinoshita Ryo、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Royal Society Open Science 巻: 8 ページ: -
  • DOI: 10.1098/rsos.202169
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Assessing Interventions against Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in Osaka, Japan: A Modeling Study (2021)
  • 著者名/発表者名: Nakajo Ko、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 10 ページ: 1256～1256
  • DOI: 10.3390/jcm10061256
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Predicting the cumulative number of disaster deaths during the early stage of earthquakes (2021)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto Marie、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Annals of Translational Medicine 巻: 9 ページ: 241～241
  • DOI: 10.21037/atm-20-5784
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Localized end-of-outbreak determination for coronavirus disease 2019 (COVID-19): examples from clusters in Japan (2021)
  • 著者名/発表者名: Linton Natalie M.、Akhmetzhanov Andrei R.、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: International Journal of Infectious Diseases 巻: 105 ページ: 286～292
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2021.02.106
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Transmissibility of asymptomatic COVID-19: Data from Japanese clusters (2021)
  • 著者名/発表者名: Nakajo Ko、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: International Journal of Infectious Diseases 巻: 105 ページ: 236～238
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2021.02.065
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] “Go To Travel” Campaign and Travel-Associated Coronavirus Disease 2019 Cases: A Descriptive Analysis, July?August 2020 (2021)
  • 著者名/発表者名: Anzai Asami、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 10 ページ: 398～398
  • DOI: 10.3390/jcm10030398
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A method for estimating the transmissibility of influenza using serial cross-sectional seroepidemiological data (2021)
  • 著者名/発表者名: Yang Yichi、Asai Yusuke、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Theoretical Biology 巻: 511 ページ: 110566～110566
  • DOI: 10.1016/j.jtbi.2020.110566
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying geographic areas at risk of rubella epidemics in Japan using seroepidemiological data (2021)
  • 著者名/発表者名: Kayano Taishi、Lee Hyojung、Kinoshita Ryo、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: International Journal of Infectious Diseases 巻: 102 ページ: 203～211
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2020.09.1458
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Containment, Contact Tracing and Asymptomatic Transmission of Novel Coronavirus Disease (COVID-19): A Modelling Study (2020)
  • 著者名/発表者名: Kinoshita Ryo、Anzai Asami、Jung Sung-mok、Linton Natalie M.、Miyama Takeshi、Kobayashi Tetsuro、Hayashi Katsuma、Suzuki Ayako、Yang Yichi、Akhmetzhanov Andrei R.、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 9 ページ: 3125～3125
  • DOI: 10.3390/jcm9103125
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Estimating the protective effect of case isolation with transmission tree reconstruction during the Ebola outbreak in Nigeria, 2014 (2020)
  • 著者名/発表者名: Chan Yat Hin、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of The Royal Society Interface 巻: 17 ページ: 498～498
  • DOI: 10.1098/rsif.2020.0498
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Serial interval of novel coronavirus (COVID-19) infections (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishiura Hiroshi、Linton Natalie M.、Akhmetzhanov Andrei R.
  • 雑誌名: International Journal of Infectious Diseases 巻: 93 ページ: 284～286
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2020.02.060
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Incubation Period and Other Epidemiological Characteristics of 2019 Novel Coronavirus Infections with Right Truncation: A Statistical Analysis of Publicly Available Case Data (2020)
  • 著者名/発表者名: Linton Natalie、Kobayashi Tetsuro、Yang Yichi、Hayashi Katsuma、Akhmetzhanov Andrei、Jung Sung-mok、Yuan Baoyin、Kinoshita Ryo、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Medicine 巻: 9 ページ: 538～538
  • DOI: 10.3390/jcm9020538
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Quantifying the causal impact of funding bedside antigen testing on the incidence of respiratory syncytial virus infection in Japan: a difference-in-differences study (2020)
  • 著者名/発表者名: Jung Sung-mok、Lee Hyojung、Yang Yichi、Nishiura Hiroshi
  • 雑誌名: Annals of Translational Medicine 巻: 8 ページ: 1441～1441
  • DOI: 10.21037/atm-20-423
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Age and geographic dependence of Zika virus infection during the outbreak on Yap island, 2007 (2020)
  • 著者名/発表者名: Endo A.、Graduate School of Medicine, Hokkaido University, Kita 15 Jo Nishi 7 Chome, Kita-ku, Sapporo 060-8638, Japan、Nishiura H.、Department of Infectious Disease Epidemiology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, Keppel Street, Bloomsbury, London WC1E 7HT, United Kingdom
  • 雑誌名: Mathematical Biosciences and Engineering 巻: 17 ページ: 4115～4126
  • DOI: 10.3934/mbe.2020228
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 気候変動による健康影響予測と適応 －デング熱、熱中症、新型コロナウイルス感染症－ (2022)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 学会等名: 第92回日本衛生学会学術総会
• [学会発表] Using epidemiological models for policy making: Pros and cons of bringing mathematical models to decision making process, . (2022)
  • 著者名/発表者名: Nishiura H
  • 学会等名: 2022 AAAS Annual Meeting
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 新型コロナウイルス感染症のクラスター形成リスクの推定, . (2022)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 学会等名: 第32回日本疫学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] オミクロン株の伝播と重症化の数理モデル (2022)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 学会等名: MIMS共同研究集会「現象と数理モデル. 数理モデリング学の形成に向けて」
• [学会発表] COVID-19の実効再生産数に関する時系列データからの異常検出, (2021)
  • 著者名/発表者名: 西浦博.
  • 学会等名: 第80回日本公衆衛生学会学術総会
• [学会発表] 新型コロナウイルス感染症感染の実像と対策 (2021)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 学会等名: 第80回日本公衆衛生学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] Decomposing the mechanism of COVID-19 transmission (2021)
  • 著者名/発表者名: Nishiura H
  • 学会等名: Korean Society for Industrial and Applied Mathematics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 新型コロナウイルス感染症の疫学、数理モデルと今後 (2021)
  • 著者名/発表者名: 西浦博.
  • 学会等名: 第31回日本産業衛生学会全国協議会
  • 招待講演
• [学会発表] 感染症数理モデルを利用した新型コロナウイルス感染症の現状分析、評価と予測 (2021)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 学会等名: 第91回日本感染症学会西日本地方会学術集会
  • 招待講演
• [図書] 感染症疫学のためのデータ分析入門 (2021)
  • 著者名/発表者名: 西浦博
  • 総ページ数: 240
  • 出版者: 金芳堂