| 研究課題/領域番号 |
17H05014
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| 研究機関 | 岡山大学 |
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研究代表者 |
高橋 一男 岡山大学, 環境生命科学研究科, 准教授 (10450199)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| キーワード | 隠蔽変異 / HSP90 / ゲノムワイド関連解析 |
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| 研究実績の概要 |
遺伝的ロバストネスは、遺伝的な攪乱に対する恒常性を意味し、遺伝的キャパシターによって維持されていると考えられている。現在、その有力な候補と考えられているのは、分子シャペロンの一つであるHSP90であるが、その恒常性維持機構は未解明である。キイロショウジョウバエには、DGRP（Drosophila Genetic Reference Panel）と呼ばれるゲノム解読済み系統が約200系統存在している。これらの系統は、SNP（一塩基多型）の分布が判明している事から、ゲノムワイド関連解析を行うのに適した研究材料である。本研究では、このDGRP系統にHSP90阻害剤であるゲルダナマイシンを投与する処理と対照処理を施す事で、HSP90の機能を阻害した状態と対照の状態で網羅的に表現型の評価を行った。平成29年度にハイパースペクトルカメラを用いた翅の構造色の定量化手法の検討も完了し、DGRP系統の翅干渉色測定の準備が整った。令和元年度には、DGRP系統の翅干渉色計測を開始し、約70系統分の翅干渉色測定が完了した。その結果、DGRP系統間には大きな遺伝分散が存在していることが分かった。最低150系統分のデータ取得を目指して、測定を継続している。また、平成29年度に測定系を実装した、ショウジョウバエ幼虫発育期間の自動計測システムに加えて、ショウジョウバエの飢餓耐性の自動測定システムの実装も完了した。これら2形質についても、DGRP系統の測定を開始したが、系統間の行動の変異が大きく、初期に設定した測定条件では自動計測が出来ない系統が見つかったため、再度測定条件の設定を行い、幅広い系統において自動計測できる測定系を確立した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
翅干渉色測定系を立ち上げ、実際に測定を開始してみたところ、最適化した測定系においても想定よりも時間が掛かることが判明し、進行に遅れが生じた。また、ショウジョウバエ幼虫発育期間の自動計測システムの実装が完了し、実際に大規模な形質測定を開始したところ、想定していたよりもDGRP系統間の形質の変異が大きく、初期の条件設定を見直す必要が生じた。再度測定条件の設定を行い、幅広い系統において自動計測できる測定系を確立するための時間が必要となったため、進行に遅れが生じた。
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| 今後の研究の推進方策 |
ショウジョウバエの翅干渉色については、想定よりも測定に時間が掛かることが判明したものの、現状で最適化した測定系が確立できたため、引き続きデータを取得していく。ショウジョウバエ幼虫発育期間の自動計測システムについては、条件設定の再検討が終わり、データの取得を開始しており、引き続き計測を続ける。今年度中に出来る限りの表現型データの取得を行い、データが完成次第ゲノムワイド関連解析を行うとともに、統計モデリングの更なる検討を行う予定である。
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