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2018 年度 実績報告書

ホロゲノム解析から紐解く難治性複合感染症としての歯周炎とインプラント周囲炎

研究課題

研究課題/領域番号 17H06662
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

芝 多佳彦  東京医科歯科大学, 歯学部附属病院, 特任助教 (90802306)

研究期間 (年度) 2017-08-25 – 2019-03-31
キーワードインプラント周囲炎 / 歯周炎 / 次世代シーケンサー / メタゲノム解析 / メタ16S解析 / 細菌叢 / ネットワーク解析
研究実績の概要

東京医科歯科大学歯学部附属病院来院中の患者のうち同一口腔内に歯周炎部位、健常歯部位、インプラント周囲炎部位、健常インプラント部位を認める患者を対象に、臨床データ(投薬 履歴、性別、年齢、発症時期)と共にプラークの採取をおこなっている。得られたプラークから全ゲノム情報、RNAを抽出、精製し、次世代シーケンサー(MiSeq)を用いてその塩基配列の取得、ゲノム情報解析をおこなってきた。
本年度はインプラント周囲炎、歯周炎罹患部位それぞれから採取したサンプルからDNAを抽出、精製し、細菌種の特定を目的としたメタ16S rDNA解析、機能解析を目的にメタゲノム解析をおこなった。それらのデータから両疾患に特異的に存在する細菌種の特定、活動性の高い細菌種の特定をおこなった。また、細菌種間の共起的細菌種間関係を明らかにするためにネットワーク解析をおこなった。また解析と並行して被験者に対して治療介入をおこない、経時的なサンプル採取をしている。
DNAレベルにおけるインプラント周囲炎と歯周炎の細菌種組成に違いは認められなかったものの、ネットワーク解析において細菌叢の中心となる細菌種は異なることが明らかとなった。また、両疾患における細菌叢の保有する機能を比較すると、インプラント周囲炎は歯周炎より炭水化物代謝の活動性が高い。一方で、歯周炎はインプラント周囲炎よりもタンパク質代謝が統計学的に有意に発現している可能性が示唆された。しかしながら、両疾患の細菌叢が保有する病原因子組成に違いは認められず、類似した病原因子を保有することを解明された。
両疾患における細菌叢の中心を担う細菌種が違うこと、加えて、代謝経路が異なることが両疾患の治療反応予後や疾患の進行速度に影響を与えてる可能性が考えられた。
今後、治療介入後における細菌叢の変化を継時的に観察し、疾患の病態解明、新規診断、治療法の開発の足がかりとすることを目標としている。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Deep sequencing reveals specific bacterial signatures in the subgingival microbiota of healthy subjects2019

    • 著者名/発表者名
      Ikeda Eri、Shiba Takahiko、Ikeda Yuichi、Suda Wataru、Nakasato Akinori、Takeuchi Yasuo、Azuma Miyuki、Hattori Masahira、Izumi Yuichi
    • 雑誌名

      Clinical Oral Investigations

      巻: 23 ページ: 1489~1493

    • DOI

      10.1007/s00784-019-02805-3

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Functional dysbiosis within dental plaque microbiota in cleft lip and palate patients2019

    • 著者名/発表者名
      Funahashi Kenta、Shiba Takahiko、Watanabe Takayasu、Muramoto Keiko、Takeuchi Yasuo、Ogawa Takuya、Izumi Yuichi、Sekizaki Tsutomu、Nakagawa Ichiro、Moriyama Keiji
    • 雑誌名

      Progress in Orthodontics

      巻: 20 ページ: -

    • DOI

      10.1186/s40510-019-0265-1

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Influence of Porphyromonas gingivalis in gut microbiota of streptozotocin-induced diabetic mice2019

    • 著者名/発表者名
      Ohtsu Anri、Takeuchi Yasuo、Katagiri Sayaka、Suda Wataru、Maekawa Shogo、Shiba Takahiko、Komazaki Rina、Udagawa Sayuri、Sasaki Naoki、Hattori Masahira、Izumi Yuichi
    • 雑誌名

      Oral Diseases

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1111/odi.13044

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Endotoxemia by Porphyromonas gingivalis Injection Aggravates Non-alcoholic Fatty Liver Disease, Disrupts Glucose/Lipid Metabolism, and Alters Gut Microbiota in Mice2018

    • 著者名/発表者名
      Sasaki Naoki、Katagiri Sayaka、Komazaki Rina、Watanabe Kazuki、Maekawa Shogo、Shiba Takahiko、Udagawa Sayuri、Takeuchi Yasuo、Ohtsu Anri、Kohda Takashi、Tohara Haruka、Miyasaka Naoyuki、Hirota Tomomitsu、Tamari Mayumi、Izumi Yuichi
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 9 ページ: Article2470

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.02470

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 網羅的な細菌叢解析による歯周炎とインプラント周囲炎の菌叢構造比較2019

    • 著者名/発表者名
      駒津匡二,芝 多佳彦,渡辺孝康,小柳達郎,根本 昂,佐藤博紀.前川祥吾,片桐さやか,竹内康雄,岩田隆紀
    • 学会等名
      第150回日本歯科保存学会
  • [学会発表] インプラント周囲炎細菌叢データにおける歯周病原細菌 CRISPR の免疫対象検索2019

    • 著者名/発表者名
      渡辺孝康,芝 多佳彦,中野善夫
    • 学会等名
      第92回日本細菌学会総会
  • [学会発表] Evaluation of core microbiome and clinical approach in peri-implantitis2019

    • 著者名/発表者名
      芝 多佳彦
    • 学会等名
      Dentiste Expo 2019 Paris
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] オミックス解析による口腔内複合感染症の病因および病態機序の解明.2018

    • 著者名/発表者名
      芝 多佳彦, 竹内康雄, 片桐さやか, 駒津匡二, 小柳達郎, 根本 昂, 青木 章
    • 学会等名
      第83回 口腔病学会学術大会
    • 招待講演
  • [学会発表] The clinical application of the novel diagnosis and treatment flowchart for peri-implantitis: Part 1 clinical application to mild case.2018

    • 著者名/発表者名
      芝 多佳彦,髙木 徹,小柳達郎,谷口陽一,前川祥吾,澤田幸作,片桐さやか,竹内康雄,青木 章,和泉雄一
    • 学会等名
      EuroPerio9
    • 国際学会
  • [学会発表] The clinical application of a novel diagnosis and treatment flowchart for peri-implantitis: Part 2 - application to moderate cases.2018

    • 著者名/発表者名
      小柳達郎,谷口陽一,髙木 徹,芝多佳彦,,澤田幸作,竹内康雄,青木 章,和泉雄一
    • 学会等名
      EuroPerio9
    • 国際学会
  • [学会発表] The clinical application of the novel diagnosis and treatment flowchart for peri-implantitis: Part 3 clinical application on severe case.2018

    • 著者名/発表者名
      谷口陽一,小柳達郎,澤田幸作,芝 多佳彦,髙木 徹,青木 章,竹内康雄,山田 梓,和泉雄一
    • 学会等名
      EuroPerio9
    • 国際学会
  • [図書] 歯科衛生士の力でここまでできる 非外科的歯周治療2018

    • 著者名/発表者名
      Marisa Roncati (原著), 青木 章, 竹内康雄, 秋月達也, 水谷幸嗣, 片桐さやか, 池田裕一, 妻沼有香, 前 川祥吾, 芝 多佳彦, 永田瑞, 佐藤博紀, 大津杏里, 松浦孝典, 三上理沙子, 大川敏生, 小野晴彦, 金子潤平, 関根 聡, 土岡弘明, 平山富興
    • 総ページ数
      352
    • 出版者
      クインテッセンス出版
    • ISBN
      4781206093
  • [図書] 聞くに聞けない歯周病治療1002018

    • 著者名/発表者名
      小方頼昌, 若松尚吾, 江尻健一郎, 岡田祐輔, 高塩智子, 斎田寛之, 鎌田征之, 梅田 誠, 申 基喆, 酒井和人, 富田幸代, 齋藤 淳, 色川大輔, 鈴木瑛一, 石川 聡, 芝 多佳彦, 澤辺正規, 佐藤末奈子, 熱田 亙, 山脇史寛, 川名部大, 鈴木浩之, 林 直 也, 沼部幸博, 下條美穂子, 大八木孝昌, 土岡弘明, 村井治, 八重柏隆, 澁谷俊昭
    • 総ページ数
      174
    • 出版者
      デンタルダイヤモンド社
    • ISBN
      4885103983
  • [図書] 歯科医師・歯科衛生士のためのClinical Handbook2018

    • 著者名/発表者名
      Paul A. Levi, 木下淳博, 長澤敏行, 青木 章, 小林宏明, 竹内康雄, 秋月達也, 水谷幸嗣, 片桐さやか, 池田裕一, 妻沼有香, 前川祥吾, 芝 多 佳彦, 須藤 毅顕, 永田 瑞, 星 嵩, 城戸大輔, 佐藤博紀, 大津杏里, 柿崎 翔, 池田恵莉, 駒崎利奈, 須藤明日香, 丸山緑子, 野田昌宏, 松浦孝典, 三上理沙子, 矢野孝星, 宇田川小百合, 坪川正樹, 高木 徹
    • 総ページ数
      220
    • 出版者
      医歯薬出版
    • ISBN
      4263445287
  • [備考] 東京医科歯科大学研究情報データベース

    • URL

      http://reins.tmd.ac.jp/html/100011966_ja.html

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公開日: 2019-12-27  

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