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2018 年度 実績報告書

葉の形態の温度応答機構と多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17H06990
研究機関横浜市立大学

研究代表者

爲重 才覚  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 特任助教 (20725006)

研究期間 (年度) 2017-08-25 – 2019-03-31
キーワード植物発生学 / 葉形態 / 温度応答
研究実績の概要

Arabidopsis kamchatica およびその親種のArabidopsis halleri と Arabidopsis lyrataについて栽培試験を行い、低温と常温で葉の形態変化を観察した。Arabidopsis kamchaticaの発芽率が低いため、発芽条件の検討を行い、ホルモン処理で比較的良い発芽率を得ることができた。Arabidosis thaliana については低温環境化でCol系統の鋸歯発達が確認された。
鋸歯発達の程度を定量化してサンプル間で比較するための手法を検討した。葉の写真データから画像処理によって輪郭の二次元座標を取り込み、面積を一律に補正した後、二次曲線によって左右の歪みを補正し、鋸歯先端と鋸歯基部の座標を抽出して、それらの座標について二次回帰係数を形質値とする手法を確立した。これによりサンプル間、系統間での鋸歯および葉の形態の定量的比較、特に変化量の比較が統計的有意性の議論も含めて可能となった。植物学会ではこの画像解析の手法を含む発表を行った。
また、6倍体コムギのゲノムワイド関連解析に必要な配列解析手法として、共同研究で次世代シーケンサーのリード配列を精密にマッピングする技術を開発した。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] University of Zurich(スイス)

    • 国名
      スイス
    • 外国機関名
      University of Zurich
  • [雑誌論文] The functional balance between the <i>WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX1</i> gene and the phytohormone auxin is a key factor for cell proliferation in Arabidopsis seedlings2018

    • 著者名/発表者名
      Nakata Miyuki T.、Tameshige Toshiaki、Takahara Masahiro、Mitsuda Nobutaka、Okada Kiyotaka
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 35 ページ: 141~154

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.18.0427a

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Homeolog expression quantification methods for allopolyploids2018

    • 著者名/発表者名
      Kuo Tony C Y、Hatakeyama Masaomi、Tameshige Toshiaki、Shimizu Kentaro K、Sese Jun
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1093/bib/bby121

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 初歩的なモデリングでわかったこと,わからなかったこと~葉の発生研究を例に~2018

    • 著者名/発表者名
      爲重才覚
    • 学会等名
      日本植物学会第 82 回大会
  • [学会発表] Modeling Approach for Leaf Morphogenesis in Arabidopsis2018

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Tameshige
    • 学会等名
      SMBE Satellite Symposium @ KIBR, YCU "Genomics and Modeling"
    • 国際学会

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公開日: 2019-12-27  

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