研究課題/領域番号 |
17H07123
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研究種目 |
研究活動スタート支援
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配分区分 | 補助金 |
研究分野 |
生命・健康・医療情報学
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研究機関 | 東海大学 |
研究代表者 |
クリュコフ キリル 東海大学, 医学部, 奨励研究員 (20806202)
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研究期間 (年度) |
2017-08-25 – 2019-03-31
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キーワード | Metagenome / NGS sequencing / classification / diagnostics / DNA / sequence |
研究成果の概要 |
感染症病原体の迅速かつ正確な診断は、治療結果を成功させるために重要です。 このプロジェクトで私は非常に効率的なシーケンス分類システムを開発しました。 このシステムは、それらのサンプルに含まれる病原体を検出するために医学的メタゲノムシーケンスサンプルに適用することができる。 また、分類子が参照として使用するGenomeSyncデータベースも開発しました。 私の医療メタゲノム研究システムは、研究、現地調査、医療サンプルの検査に有用性を示しています。 結果は査読付き文献に記載されている。 私の分類器システムは、次世代シーケンシングを用いた感染症の調査に広く採用されると期待しています。
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自由記述の分野 |
Bioinformatics
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
Our society is increasingly threatened by pandemics and spread of drug-resistant pathogens. My sequence classifier will help in achieving rapid response to these threats, by providing fast and accurate sequence based diagnostics.
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