| 研究課題/領域番号 |
17K00406
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
生命・健康・医療情報学
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| 研究機関 | 奈良先端科学技術大学院大学 |
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研究代表者 |
AMIN MD.ALTAFUL 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 准教授 (30379531)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | Metabolomics / Metabolic Network / Network Clustering / Metabolite Activity / Big Data Biology / Algorithm |
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| 研究成果の概要 |
私たちは代謝物の活性を予測する手法を開発し、この手法を用いて1340種類の未知の代謝物の機能を予測することができた。またプロジェクトの一環として、単純グラフと2部グラフのクラスタリングのためのDPClusSBOというツールを開発した。このプロジェクトを中心に論文を多数発表していて、マレーシア、ブラジル、インドネシアの共同研究者もこのツールを使用している。将来的にはさらに広くこのツールが使用されることを期待していて、またツール自体も伝統医学の抗生物質の探索など応用範囲を広げていきたいと考えている。
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| 自由記述の分野 |
Systems Biology
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
By utilizing our method we predicted the functions of 1340 unknown metabolites. As part of this project we developed a tool for clustering of simple and bipartite graphs which we have utilized in several other research works. This tool is a significant academic and social achievement.
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