| 研究課題/領域番号 |
17K07251
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| 研究機関 | 東京医科歯科大学 |
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研究代表者 |
江花 有亮 東京医科歯科大学, 統合研究機構, 講師 (60517043)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 心房細動 / NEURL / タンパク質品質管理 / ゲノムワイド関連研究 / 機能解析 |
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| 研究実績の概要 |
既報のＧＷＡＳで使用された全てのＳＮＶのＰ値、染色体上の位置情報、オッズ比のファイルを作成する。ＭＡＴＬＡＢ（Ｒ2018）をプラットフォームとするコンピューティング言語でプログラムされたＭＡＧＥＮＴＡにより解析したところ、ＣＴＣＦ経路とｍＴＯＲ経路が同定された。ＣＴＣＦ経路とｍＴＯＲ経路の関与を確認するために、本学心臓外科で採取した既存試料（僧帽弁膜症症例）11検体を用いて、マイクロアレイ解析を実施した。心房細動患者と非心房細動患者で2つの経路の関与を調べたところ、心房細動患者から採取された心房筋においてはｍＴＯＲ経路が抑制されていることが示された。現在、本データに基づいた論文をＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃａｒｄｉｏｌｏｇｙへ出版申請中である。
次に同定されたユビキチン・リガーゼＮＥＵＲＬのｍＴＯＲ経路への作用を調べるために、ｍＴＯＲＣ１複合体に含まれる分子およびｍＴＯＲＣ２に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。こちらは論文を作成中である。
臨床研究では既存試料を用いた研究を用いてベイジアン・ネットワーク解析を通して心房細動の一種である上大静脈由来の異所性興奮の原因の予測解析を行い、ＩＪＣ Ｈｅａｒｔ＆Ｖａｓｃｕｌａｔｕｒｅ誌に出版された。また大阪大学との共同研究において、徐脈性不整脈と心房細動の関連を示した論文がＣｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ誌から出版された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
既報のGWASで使用された全てのSNVのP値、染色体上の位置情報、オッズ比のファイルを作成する。MATLAB（R2018a）をプラットフォームとするコンピューティング言語でプログラムされたMAGENTAにより解析したところ、CTCF経路とmTOR経路が同定された。CTCF経路とmTOR経路の関与を確認するために、本学心臓外科で採取した既存試料（僧帽弁膜症症例）11検体を用いて、Microarray解析を実施した。心房細動患者と非心房細動患者で2つの経路の関与を調べたところ、心房細動患者から採取された心房筋においてはmTOR経路が抑制されていることが示された。現在、本データに基づいた論文をInternational Journal of Cardiologyへ出版申請中である。
次に同定されたユビキチン・リガーゼNEURLのmTOR経路への作用を調べるために、mTORC1複合体に含まれる分子およびmTORC2に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。こちらは論文を作成中である。
臨床研究では既存試料を用いた研究を用いてベイジアン・ネットワーク解析を通して心房細動の一種である上大静脈由来の異所性興奮の原因の予測解析を行い出版された。また大阪大学との共同研究が論文出版された。
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| 今後の研究の推進方策 |
既報のGWASで使用された全てのSNVのP値、染色体上の位置情報、オッズ比のファイルを作成する。MATLAB（R2018a）をプラットフォームとするコンピューティング言語でプログラムされたMAGENTAにより解析したところ、CTCF経路とmTOR経路が同定された。CTCF経路とmTOR経路の関与を確認するために、本学心臓外科で採取した既存試料（僧帽弁膜症症例）11検体を用いて、Microarray解析を実施した。心房細動患者と非心房細動患者で2つの経路の関与を調べたところ、心房細動患者から採取された心房筋においてはmTOR経路が抑制されていることが示された。現在、本データに基づいた論文をInternational Journal of Cardiologyへ出版申請中である。
次に同定されたユビキチン・リガーゼNEURLのmTOR経路への作用を調べるために、mTORC1複合体に含まれる分子およびmTORC2に含まれる分子のタンパク・リン酸化レベルの変化を調べた。HL-1細胞をsiNEURL, siCtrlでノックダウン処理をして、PRAS40を調べたところ、いずれも遺伝子発現抑制は認められなかった。こちらは論文を作成中である。
続いて、NEURLの機能解析を更に進め、Autophagyとのかかわりを調べることとする。
また、GWASの結果からPolygenic risk score解析などを行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
急遽、研究担当者が留学してしまったため、動物実験が困難になってしまい、研究内容の大幅な変更を余儀なくされてしまったため
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