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2020 年度 実績報告書

高分解能構造解析によるシトクロムb5還元酵素反応系における電子伝達分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K07325
研究機関国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構

研究代表者

平野 優  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学領域, 主幹研究員(定常) (80710772)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
キーワード中性子回折 / X線回折 / 高分解能 / 酸化還元
研究実績の概要

タンパク質の関与する酸化還元反応機構を理解するためには、タンパク質における酸化還元状態調節機構と電子伝達経路を明らかにすることが重要な課題となっている。酸化還元状態間の構造変化を追跡するためには、タンパク質表面の水分子の水素を含めた全原子構造情報の取得が必要であり、電子伝達経路の解明には反応の起こる状態の立体構造情報が重要となる。本研究では、哺乳類の肝臓代謝系において脂質合成などに関与するNADH-シトクロムb5還元酵素(b5R)とシトクロムb5(b5)の反応系全体について、X線と中性子それぞれの特長を生かした構造解析を行うことで、水素を含めた全原子構造とb5R-b5複合体構造を明らかにし、電子伝達反応において重要な酸化還元状態調節と電子伝達経路の構造基盤を解明することを目的とする。
2020年度は還元型b5Rの中性子構造解析および酸化型b5の中性子回折実験を実施した。還元型b5Rを安定化するT66V変異体について、中性子とX線回折データを相補的に利用した構造解析を実施し、2種類の補因子(FADとNAD)に結合する水素の結合状態を可視化することに成功した。酸化型b5について良質な大型結晶作製に成功し、大強度陽子加速器施設J-PARCの生体高分子用回折装置iBIXを利用した中性子回折実験により、1.5オングストローム分解能を超える回折点を観測することができた。
研究期間全体としては、酸化型および還元型b5Rの水素を含めた全原子構造情報取得を達成した。この結果、b5Rの水素移動反応に重要と考えられる補因子周辺の立体構造が明らかとなった。またb5において、これまでより高分解能の回折データを取得できたことで、全原子構造解析および電子状態を含めた立体構造解析が実現可能となる見通しが立った。以上の結果から、酸化還元反応の分子機構理解の全容解明に繋がる成果を創出することができた。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] 量子構造生物学の創成と挑戦2020

    • 著者名/発表者名
      玉田太郎、平野優
    • 雑誌名

      月刊オプトロニクス

      巻: 39 ページ: 92-97

  • [学会発表] 超高分解能X線構造解析、結合電子密度が見えた2021

    • 著者名/発表者名
      平野優
    • 学会等名
      第419回CBI学会研究講演会
    • 招待講演
  • [学会発表] NADH-シトクロムb5還元酵素反応系の高分解能立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      平野優
    • 学会等名
      2020年度第2回iBIX研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] High-resolution structure analysis of NADH-cytochrome b5 reductase2020

    • 著者名/発表者名
      Yu Hirano, Kazuo Kurihara, Katsuhiro Kusaka, Andreas Ostermann, Shigenobu Kimura, Kunio Miki, Taro Tamada
    • 学会等名
      The 20th annual meeting of the Protein Science Society of Japan
  • [学会発表] 高分解能立体構造解析で迫る酸化還元酵素の反応機構2020

    • 著者名/発表者名
      平野優、栗原和男、日下勝弘、Andreas Ostermann、木村成伸、三木邦夫、玉田太郎
    • 学会等名
      第93回日本生化学会
    • 招待講演
  • [学会発表] 高電位鉄硫黄タンパク質の高分解能X線構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      平野優
    • 学会等名
      iBIX-JAXA-KEK物構研-QST合同タンパク質研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] NADH-シトクロムb5還元酵素の結晶構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      平野優、栗原和男、日下勝弘、Andreas Ostermann、木村成伸、三木邦夫、玉田太郎
    • 学会等名
      日本結晶学会令和2年度年会
  • [学会発表] 量子構造生物学の創成を目指した酸化還元タンパク質の高精度立体構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      平野優、栗原和男、日下勝弘、Andreas Ostermann、木村成伸、三木邦夫、玉田太郎
    • 学会等名
      量子生命科学会第2回大会

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公開日: 2021-12-27  

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