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2020 年度 実績報告書

プロトン駆動力を用いたSecDFによるタンパク質膜透過促進機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K07334
研究機関京都大学

研究代表者

森 博幸  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 准教授 (10243271)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
キーワードSecDF / プロトン駆動力 / タンパク質膜透過
研究実績の概要

タンパク質が生体膜を横切る反応は全ての生物に必須の生命現象であり、その分子機構の理解は極めて重要である。細菌のタンパク質膜透過反応においては、基質タンパク質の通り道を形成するSecYEGチャネルと駆動因子SecA ATPaseが必須の役割を持つ。これらの因子に加えて、膜タンパク質複合体SecDFもプロトン駆動力のエネルギーを用いて膜透過を促進する。
我々は、SecDFの立体構造解析とそれに基づいた機能解析の結果から、「SecDFはプロトンチャネルとして働き、プロトンの細胞内への流入と共役した自身の非細胞質ドメインの構造変化を介して、SecYEGチャネルを通過するタンパク質を補足し、引っ張りだす運動を繰り返すことで膜透過を促進する。」とのモデルを提案しているが、詳細な分子機構は不明なままであった。この解明を目指して、本研究ではこれまでSecDFを対象としたin vivo光架橋解析を進め相互作用因子を同定してきた。
最終年度である2020年度は、基質タンパク質の1つであるVemPに着目し、このタンパク質が膜透過の途上で相互作用する因子を時間分解能を持つ部位特異的in vivo光架橋実験により網羅的に解析した。その結果、SecYEGチャネルなどの既存の因子に加え、新たな細胞因子としてペリプラズムシャペロンPpiDを同定した。また、ppiDの欠失株を用いた生化学的解析から、VemPの膜透過の速やかな完了には、SecDFとPpiDの両者が必要であることを明らかにした。さらに、SecDとPpiDの物理的近接も示した。これらの成果は、タンパク質膜透過の駆動時においてSecDFは単独で働いているわけではなく、他の分子と共同的に機能している可能性を示唆するものである。SecDFとPpiDの共同的な機能は、細菌のタンパク質膜透過の効果的な完了の為のキーイベントと考えられる。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2020

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Fine interaction profiling of VemP and mechanisms responsible for its translocation-coupled arrest-cancelation2020

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki Ryoji、Akiyama Yoshinori、Mori Hiroyuki
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9 ページ: e62623

    • DOI

      10.7554/eLife.62623

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reversible autoinhibitory regulation ofEscherichia colimetallopeptidase BepA for selective β-barrel protein degradation2020

    • 著者名/発表者名
      Daimon Yasushi、Narita Shin-ichiro、Miyazaki Ryoji、Hizukuri Yohei、Mori Hiroyuki、Tanaka Yoshiki、Tsukazaki Tomoya、Akiyama Yoshinori
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 117 ページ: 27989~27996

    • DOI

      10.1073/pnas.2010301117

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A photo-cross-linking approach to monitor protein dynamics in living cells2020

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki Ryoji、Akiyama Yoshinori、Mori Hiroyuki
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: 1864 ページ: 129317~129317

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.03.003

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tree of motility ? A proposed history of motility systems in the tree of life2020

    • 著者名/発表者名
      Miyata Makoto、Robinson Robert C.、Uyeda Taro Q. P.、Mori Hiroyuki et al. (計28人)
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 ページ: 6~21

    • DOI

      10.1111/gtc.12737

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 細菌の外膜生合成と品質管理に関わる2機能性プロテアーゼBepAの基質認識機構2020

    • 著者名/発表者名
      宮﨑亮次、吉谷亘平、森 博幸、秋山芳展
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会、web開催

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公開日: 2021-12-27  

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