| 研究課題/領域番号 |
17K07441
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
杉浦 昌弘 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 名誉教授 (80027044)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | タバコ葉緑体 / イントロン / RNAスプライシング / ２次構造モデル / in vitro系 |
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| 研究実績の概要 |
タバコ植物の葉緑体ゲノムは、１１０余種の遺伝子を持つ。このうち、１２種のタンパク質をコードする遺伝子はイントロンを含む。菌類ミトコンドリアのイントロンを基にした分類によれば、これらのイントロンは、グループⅡ型とされている。菌類のグループIIイントロンの多くはセルフスプライシングする。しかし、顕花植物の葉緑体のグループII類イントロンはセルフスプライシングしないので、タンパク質因子の関与が考えられる。
タバコ葉緑体のH＋-ATPアーゼのサブユニットCF１アルファをコードするatpF遺伝子のイントロン２次構造モデルの作図を行いエキソン結合部位（EBS1とEBS2）を探索した。
タバコのイントロン構造を基に、ホウレンソウ、エンドウ、イネとシロイヌナズナのatpFイントロンの２次構造もあわせて作図した。イントロンの長さ（単子葉植物のイントロンは１００塩基程長い）と配列類似性は異なっていたが、２次構造はよく似ていた。それぞれのイントロンのエキソン結合部位（EBS1とEBS2）を推定した。
タバコ葉緑体のatpFイントロンの推定したEBS1とEBS2につき、変異を導入し、我々が開発したタバコin vitroスプライシング系で調べた。その結果、推定したEBS1が正しいことを示した。EBS2については明確な結果が得られていないので、現在解析中である。
in vitro系でスプライスされたmRNAを抽出して、それぞれの塩基配列を調べたところ、正しい位置でイントロンが除去され、両エキソンが結合されていることを明らかにした。従って、我々のin vitro系は葉緑体内の反応を正して反映していると考えられる。
グループIIAに属すので、EBS1の位置と働きが異なることが考えられる。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
タバコのatpFイントロンの２次構造モデルを完成させ、予想したエキソン結合部位EBS1が実験的に正しいことを証明した。現在、少しづつ論文の作製を進めている。
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| 今後の研究の推進方策 |
おおむね当初計画どおりに研究を進める。ついで、論文を発表する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
物品の購入を控えたため。
次年度、物品を購入する時に使用する予定。
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