| 研究課題/領域番号 |
17K07456
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| 研究機関 | 関西学院大学 |
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研究代表者 |
宗景 ゆり 関西学院大学, 理工学部, 准教授 (30423247)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | C4光合成 |
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| 研究実績の概要 |
C3-C4中間種Flaveria floridanaとC4様種Flaveria browniiのF2交雑集団を用いて、クランツ構造の発達と連鎖するゲノム変異の同定を行うためにRestriction Site Associated DNA Sequence （Rad seq）により多型情報を取得した。
まず、F2交雑集団139固体を用いてクランツ構造の表現型の出現頻度について、柵状組織二層目の細胞数/一層目の細胞数を指標にして定量的に再解析したところC4様種F. brownii 型を示す割合は19％であることが明らかになった。このことから、C4様F. brownii 型クランツ構造を決定する遺伝子座は1 locusである可能性が示唆された。
次にFlaveria floridanaおよびFlaveria browniiゲノムを制限酵素BglII、EcoRIで処理し、次世代シーケンサーにより切断部位からの配列を取得した。同様にしてF2交雑集団139固体についてRad seqを行った。それぞれのゲノム配列において共通に検出でき、かつSNPを含む1295 lociについて連鎖解析をしたところ、F. brownii型のクランツ構造を示す表現型と連鎖したのは、このうち69 lociであった。クランツ構造に関与するQTLは1 locusであることが、表現型の出現頻度から推定されていたため、この69 lociはお互いにゲノム上のポジションが近く、クランツ構造を決定するゲノム遺伝子座の近傍に位置する可能性が高い。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
Restriction Site Associated DNA Sequence （Rad seq）により多型情報し、連鎖解析を行うことができたため。
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| 今後の研究の推進方策 |
Restriction Site Associated DNA Sequence （Rad seq）および連鎖解析により同定した、69 lociはクランツ構造を決定するゲノム遺伝子座の近傍に位置する可能性が高いため、69 lociの近傍に位置する遺伝子を調べる。また、C4様種F. brownii 型クランツ構造を示したF2固体をF.floridanaと掛け合わせてバッククロスを行い、その次世代においてC4様F. brownii 型クランツ構造表現型を示す固体を選抜し、69 lociからさらに絞り込む。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
バッククロス後の固体についてゲノム解析を行う必要が生じたため
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