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2018 年度 実施状況報告書

イネのシリカから発見したタンパク質はバイオミネラリゼーションに関与するか

研究課題

研究課題/領域番号 17K07775
研究機関秋田県立大学

研究代表者

尾崎 紀昭  秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (50468120)

研究分担者 常盤野 哲生  秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (50312343)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードイネ / シリカ / バイオミネラリゼーション / プロテオーム / ケイ酸
研究実績の概要

イネはバイオミネラリゼーションによって地上部(葉身、籾殻)重量の10%にも及ぶシリカを沈積する。本研究では、イネ葉身および籾殻に形成されるシリカ(ケイ酸体)にタンパク質が含まれることを世界に先駆けて発見した。今回発見したタンパク質が他のシリカ形成生物(珪藻、海綿、ある種の細菌)と同様にシリカ形成を制御しているのか検証することが最終目標である。
2017年度に引き続き、2018年度は以下に示す成果を得た。
1)あきたこまち、秋田酒こまちの各葉身由来シリカから得たフッ化水素溶液可溶性画分(以降HF可溶性区)中に存在する11 kDaタンパク質をLC-MS/MSにて再解析した結果、両タンパク質の配列はアミノ酸レベルで完全に一致するという結果が得られた。
2)籾殻のプロテーム解析を行った結果、前年度までに得られた籾殻クチクラタンパク質の他に、新たに籾殻シリカ由来HF可溶性区に単一の高分子タンパク質(120 kDa)が存在することが分かった。このタンパク質を効率よく可溶化する手法を確立し、120 kDaタンパク質の分子質量測定およびLC-MS/MS解析を行った。得られた配列情報を基にデータベースとの比較を行った結果、本タンパク質は既知の糖分解酵素様ドメインを有し、その分子質量から推察すると新奇のタンパク質である可能性が示された。
3)上記で得られたイネ葉身シリカタンパク質および籾殻シリカタンパク質のケイ酸重合活性試験を行った。既にケイ酸重合活性を示すことが報告されている海綿シリカ由来のタンパク質Glassinとの比較を行った結果、籾殻シリカタンパク質に一定の活性が検出された。
4)シリカ形成時期に高発現する遺伝子の特定を目的として、7月~9月にかけて経時的に各試料(葉身、籾)を採集・調製した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の予定よりもイネ葉身のシリカに含まれるタンパク質のキャラクタリゼーション(特に遺伝子の発現解析等)がやや遅れ気味であることは否めないが、籾殻および籾殻シリカに関するプロテオー解析が当初の計画よりも大幅に進展した。両者を総合した結果、おおむね順調と判断した。

今後の研究の推進方策

2019年度前半において、英国・エディンバラ大学化学部Fabio Nudelman博士のもとでサバティカル研修(留学)を行うため、現地で実施する研究内容としてクライオ電子顕微鏡を用いたイネ・シリカの微細構造解析へと一部、方向転換する。現地ではクライオ透過型電子顕微鏡およびクライオ走査型電子顕微鏡を利用可能であることから、これらの機器を使用して、シリカ内におけるタンパク質の局在解析および三次元画像の構築を試みる。帰国後の2019年度後半に関しては、前年度までに得られたタンパク質および遺伝子の情報を基に、イネのバイオミネラリゼーションにおいて、特定のタンパク質が関与するかどうかを総合的に検証する。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of Barnacle Shell Proteins by Transcriptome and Proteomic Approaches2018

    • 著者名/発表者名
      Wong YH, Ozaki N., Zhang WP. et al.,
    • 雑誌名

      Biomineralization, Endo K., Kogure T., Nagasawa H. (eds), Springer

      巻: - ページ: 105-112

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/978-981-13-1002-7_11

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Rice Plant Biomineralization: Electron Microscopic Study on Plant Opals and Exploration of Organic Matrices Involved in Biosilica Formation.2018

    • 著者名/発表者名
      Ozaki N., Ishida T., Osawa A. et al.,
    • 雑誌名

      Biomineralization, Endo K., Kogure T., Nagasawa H. (eds), Springer

      巻: - ページ: 129-135

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/978-981-13-1002-7_14

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ミネラルを利用した防御戦略 - 生物が鉱物をつくる分子メカニズム -2018

    • 著者名/発表者名
      尾崎紀昭
    • 雑誌名

      日本農薬学会誌

      巻: 43(2) ページ: 129-130

    • DOI

      https://doi.org/10.1584/jpestics.W18-39

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] イネのシリカとバイオミネラリゼーション2018

    • 著者名/発表者名
      尾崎紀昭
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 2(12) ページ: 61-65

  • [学会発表] Silica Biomineralization in rice plants2018

    • 著者名/発表者名
      Ozaki Noriaki
    • 学会等名
      International Symposium & School on Crystal Growth Fundamentals 2018
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] イネ葉身ファン型シリカ形成に関与するタンパク質の探索2018

    • 著者名/発表者名
      辻一希・石田拓也・野下浩二・尾崎紀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部第153回大会
  • [学会発表] 簡易ケイ酸定量法の確立とイネ葉身・籾殻におけるケイ酸含有量の測定2018

    • 著者名/発表者名
      後藤千佳・安孫子澪・大川莉奈・辻一希・尾崎紀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部第153回大会
  • [学会発表] イネ籾殻シリカ形成に関与するタンパク質の探索2018

    • 著者名/発表者名
      安孫子澪・矢部涼香・尾崎紀昭
    • 学会等名
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [学会発表] イネ葉身シリカ形成に関与するタンパク質の探索2018

    • 著者名/発表者名
      辻一希・石田拓也・鈴木道生・野下浩二・岡野桂樹・吉澤結子・尾崎紀昭
    • 学会等名
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [学会発表] イネ葉身・籾殻・穂軸のバイオシリカのナノ構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      中村江里・船生柊伍・緒明佑哉・尾崎紀昭・今井宏明
    • 学会等名
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [学会発表] アカフジツボの殻のミクロアーキテクチャー―簡易光学顕微鏡と低真空SEMによる観察―2018

    • 著者名/発表者名
      岡野桂樹・伴勇希・甲斐匠・尾崎紀昭・小黒-岡野美枝子・Wong Yue Him・吉村えり奈・野方靖行
    • 学会等名
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [学会発表] Variations and conservations in barnacle shell structures and shell proteins2018

    • 著者名/発表者名
      Yue Him Wong, Noriaki Ozaki, Chong Chen, Hiromi Watanabe, Erina Yoshimura, Yusayuki Nogata, Mieko Okano-Oguro, Benny KK Chan, Keiju Okano
    • 学会等名
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • 招待講演
  • [備考] 秋田県立大学・応用生物科学科 尾崎紀昭ホームページ

    • URL

      http://www.akita-pu.ac.jp/bioresource/DBT/Plantmetfunc/ozaki/index.html

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公開日: 2019-12-27  

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