腺管分離法を用いたSNP arrayによる胆道癌のゲノムコピー数解析

2019 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 17K08701
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 人体病理学
• 研究機関: 岩手医科大学
• 研究代表者: 塩井 義裕 岩手医科大学, 医学部, 研究員 (00714346)
• 研究分担者: 菅井 有 岩手医科大学, 医学部, 教授 (20187628) ; 石田 和之 岩手医科大学, 医学部, 准教授 (40444004)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2020-03-31
• キーワード: 胆道癌 / SNP / コピー数異常

研究成果の概要

胆道癌36例について，コピー数異常をSNPアレイを用いてGain, LOH, Copy-neutral LOHに分類し，臨床病理学的特徴との関連を検討した．胆嚢癌と胆管癌の比較においては, 胆管癌でLOHが有意に多く見られた．コピー数異常に基づき階層的クラスター解析を行ったところ，2群に分かれた．subgroup間で有意なCNA変化を示すlocusは，全体で233箇所に有意な差がみられ，Gainで195箇所，LOHで35箇所，CN-LOHで3箇所に有意なCNA変化がみられた．これらのゲノムワイドな遺伝子変化の検出は，胆道癌の発症や進行に関わる新規遺伝子の特定に寄与する可能性がある．

自由記述の分野

胆道癌

研究成果の学術的意義や社会的意義

胆道癌は我が国での罹患率は欧米より高く，癌による死因の第6位を占める予後不良な疾患である．しかし，胆道癌は比較的稀な疾患で，有効な治療法が限られている．今回，我々は胆道癌のコピー数異常に着目し，SNPアレイを用いてコピー数異常を検索し，臨床病理学的特徴との関連を検討した．胆道癌のコピー数異常に基づき階層的クラスター解析を行ったところ2グループに分かれ，有意な変化を示す遺伝子座を特定した．胆道癌における病態解明は、臨床病理学的因子に加えて分子病理学的因子も必要であり，ゲノムワイドな観点から癌の発生・進展の機序をさらに解明していくことが必要である．