メタゲノム解析からみた長期プロトンポンプ阻害薬使用が消化管細菌叢に及ぼす影響

2020 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 17K09365
• 研究機関: 東京医科大学
• 研究代表者: 永田 尚義 東京医科大学, 医学部, 准教授 (10562788)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: 酸分泌抑制薬 / 薬剤 / 腸内細菌 / マイクロバイオータ / P-CAB

研究実績の概要

臨床情報やサンプル収集、唾液、糞便サンプル解析、bioinformatics、統計解析までの体制を整備し、多数例のメタデータとメタゲノムデータを統合し酸分泌抑制薬とmicrobiomeとの関連を多角的に検証している。酸分泌抑制薬の中でも、PPI、P-CAB、H2blockerによって、変動する菌種や菌の機能は異なった。また、酸分泌抑制薬の使用期間での検討では、投与後1週以内から菌種変動を認め、内服を継続している間ずっとその変動を認めた。
さらに、2pointのサンプル解析による経時変化を検証したところ（前向きコホート）、PPIやPCAB開始に伴い変動した菌種は、ケースコントロールで認めた変動菌種と一致していた。さらに、PPIを中断すると変動菌種は投与前の状況に近づくことが判明した。
大規模ケースコントロール研究と前向きコホート研究から、PPI使用に伴う腸内細菌へ影響を明らかにした。現在、酸分泌抑制薬に伴う菌の機能遺伝子やbacteriophageの変動を明らかにしている。また、PPI長期使用に伴う重篤な副作用が報告されており、それら副作用と今回認めた菌種変動との関連を見ていく。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

目標症例のサンプルのシークエンスが終了しており、薬剤との関連解析結果も見出すことができているため順調と判断した。

今後の研究の推進方策

現在、酸分泌抑制薬に伴う菌の機能遺伝子やbacteriophageの変動を明らかにしている。また、PPI長期使用に伴う重篤な副作用が報告されており、それら副作用と今回認めた菌種変動との関連を見ていく。

次年度使用額が生じた理由

研究開始とともに、コロナの影響のためヒトサンプルの収集を途中で中止となった期間が複数回あった。そのため、サンプル解析に伴う費用を使用しなかった

研究成果

• [雑誌論文] Clinical features and gut microbiome of asymptomatic Entamoeba histolytica infection (2020)
  • 著者名/発表者名: Yanagawa Y, Nagata N, Yagita K, Watanabe K, Okubo H, Kikuchi Y, Gatanaga H, Oka S, Watanabe K.
  • 雑誌名: Clin Infect Dis 巻: Epub ページ: Epub
  • DOI: 10.1093/cid/ciaa820
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cumulative evidence for reducing recurrence of colonic diverticular bleeding using endoscopic clipping versus band ligation: Systematic review and meta-analysis (2020)
  • 著者名/発表者名: Nagata N, Niikura R, Ishii N, Kaise M, Omata F, Tominaga N, Kitagawa T, Ikeya T, Kobayashi K, Furumoto Y, Narasaka T, Iwata E, Sugimoto M, Itoi T, Uemura N, Kawai T
  • 雑誌名: Journal of Gastroenterology and Hepatology 巻: Epub ページ: Epub
  • DOI: 10.1111/jgh.15370
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficacy and Safety of Early vs Elective Colonoscopy for Acute Lower Gastrointestinal Bleeding (2020)
  • 著者名/発表者名: Niikura R, Nagata N, Yamada A, Honda T, Hasatani K, Ishii N, Shiratori Y, Doyama H, Nishida T, Sumiyoshi T, Fujita T, Kiyotoki S, Yada T, Yamamoto K, Shinozaki T, Takata M, Mikami T, Mabe K, Hara K, Fujishiro M, Koike K
  • 雑誌名: Gastroenterology 巻: 158 ページ: 168
  • DOI: 10.1053/j.gastro.2019.09.010
  • 査読あり
• [学会発表] 日本人の大規模メタゲノム解析から明らかにする薬剤が及ぼす腸内細菌叢変化 (2021)
  • 著者名/発表者名: 永田尚義
  • 学会等名: 第94回 細菌学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] 腸内細菌と健康 (2021)
  • 著者名/発表者名: 永田尚義
  • 学会等名: 第100回日本消化器内視鏡学会総会市民公開講座
  • 招待講演