研究課題
本研究は、HTLV-I (ヒトT細胞白血病ウイルス)が原因で発症する成人T細胞白血病/リンパ腫（ATL）やEpstein-Barr ウイルスが関与する悪性リンパ腫など潜伏感染ウイルスが関連するリンパ系腫瘍の発症や進展において、ヒト組織適合性抗原（HLA）の意義を解明することを目的としている。次世代シーケンサーを用いてHLA遺伝子解析を行い、非コード領域を含むHLA遺伝子解析を進め、腫瘍細胞におけるHLAの遺伝子異常や発現異常を検討する。ATLを含むリンパ系悪性腫瘍の患者とHTLV-Iキャリアを前向きに登録した。保存した検体より抽出したDNAを用いて、Luminex法によるHLAタイピングを行い、ATL患者とHTLV-IキャリアのHLAアリル頻度及びHLAハプロタイプ頻度を解析し、ATLの発症に関与するHLAの検索を行った。また、ATLの検体を用いて、腫瘍細胞に生じるHLA遺伝子の異常を解析した。ATLL急性型と慢性型の症例の末梢血よりATL細胞と正常細胞の各分画よりDNAを抽出し、long-range PCR法を用いた次世代シークエンシング（NGS）によるHLA遺伝子全領域の変異解析を行った。急性型ATLでは腫瘍細胞表面上で正常なHLAを発現できないと考えられる症例を高率に認め、病勢の進行により腫瘍細胞はHLAの遺伝子異常を生じやすくなり、免疫からの回避していることが示唆された。これまでの解析結果をまとめて、学会発表を行った。
3: やや遅れている
研究期間内に構築したシステムによって、円滑に患者検体を保存し、解析を進めることができている。Luminex法でHLTV-IキャリアとATL患者のHLA解析を行い、アリル頻度やハプロタイプ頻度を解析し、ATLの発症と関連する可能性のあるHLAを検索した。ATLの検体を用いて、腫瘍細胞に生じるHLA遺伝子の異常の解析を行い、病期の進行したアグレッシブATLでは腫瘍細胞表面上で正常なHLAを発現できない遺伝子異常が生じる可能性を示すことができた。学会発表を行ったが、追加解析をして論文を作成することに時間を要している。
ATL患者の腫瘍細胞及び正常細胞でのHLAのRNA発現解析を実施する。また、HLA class Iとclass IIの発現をフローサイトメトリーで解析し、これまで得られたゲノムレベルで生じるHLA遺伝子異常の結果、臨床データと統合する。ATLに生じるHLA遺伝子異常のバイオマーカーとしての意義を探る。本年度中に本研究結果について、英文論文としてまとめる。
これまで保存したATLの検体を用いて、解析結果をまとめている。学会発表を行ったが、論文としてまとめるためには、追加の解析が必要となった。次年度は、主ATL患者の腫瘍細胞及び正常細胞でのHLAのRNA発現解析、フローサイトメトリー解析を実施するための試薬購入のための費用が必要である。また、論文化を行うための費用が必要である。
すべて 2020 2019
すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)
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