| 研究課題/領域番号 |
17K09972
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
膠原病・アレルギー内科学
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
住友 秀次 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (20392996)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 関節リウマチ / トランスクリプトーム解析 / パスウェイ解析 / 発現変動遺伝子 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、関節リウマチ患者の末梢血CD4陽性T細胞亜分画のトランスクリプトーム解析を行い、疾患活動性と相関する遺伝子群でT細胞受容体・RICTOR・KDM5A関連シグナルが亢進し、アバタセプト投与で抑制されることを明らかにした。
また、健常人末梢血5分画のeQTL遺伝子カタログと関節リウマチのGWASデータを統合することで、関節リウマチの各細胞分画でのサイトカインパスウェイの推測を可能にした。また、関節リウマチのリスクSNPがB細胞上のCD83の発現に負のeQTL効果を持ち、CD27－IgD－ double negative B細胞を増加させ、B細胞分化に影響を与えている可能性が示唆された。
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| 自由記述の分野 |
免疫学
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究では、研究開始当初は報告数の少なかった、CD4陽性T 細胞亜分画を分取して遺伝子解析を行ったところに新規性がある。亜分画の解析を行うことで、細胞分画比率の変化に影響を受けずに、関節リウマチにおける各細胞分画の変動発現遺伝子、細胞内シグナル、薬剤投与の影響を明らかにすることができた。
また、本研究では、健常人末梢血細胞分画のeQTL遺伝子カタログを関節リウマチのGWASデータと統合することによって、疾患検体データが揃っていない状況であっても疾患における各細胞分画内のシグナル伝達や、細胞分画比率の相関解析を行うことが可能となり、解析の可能性が大きく広がったという意義がある。
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