| 研究課題/領域番号 |
17K10146
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
石井 加奈子 九州大学, 大学病院, 学術研究員 (90400332)
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| 研究分担者 |
酒井 康成 九州大学, 医学研究院, 准教授 (10380396)
内海 健 九州大学, 医学研究院, 准教授 (80253798)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 先天性門脈体循環シャント / 全エクソーム解析 / 次世代シーケンサー |
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| 研究実績の概要 |
先天性門脈体循環シャントは致死的な肺高血圧症や肝性脳症、肝臓腫瘍を引き起こす。進行性に重篤な合併症をきたすため、無症状時に早期にシャント血管閉鎖を行う必要がある。次世代シーケンサーを用いた全エクソーム解析を行い、その疾患責任遺伝子を同定することが本研究の目的である。
我々は全エクソーム解析に先立ち、その表現型を解析するため当院の先天性門脈体循環シャント患者24症例の臨床経過を詳細にまとめ、生命予後を左右する肺高血圧症を防ぐためには早期のシャント閉鎖が重要であることを報告した。また新生児スクリーニングを契機とした先天性門脈体循環シャントの診断は半数に留まり、早期診断に有用なマーカーが存在しないことが早期治療介入を遅延させる大きな課題であることを確認した。
本年度は本大学の医学倫理委員会の承認と患者の同意を得たうえで先天性門脈体循環シャントの患者とその健常な両親でIon Torrent Systemによるトリオ解析に基づく全エクソーム解析を行った。Golden Helix社の解析ソフトVarseqを用いて、主に日本人の健常者ゲノムデータ、Human genetic variation databaseとの比較を行い、候補遺伝子の絞り込みを行った。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
平成29年度の臨床像・表現型の報告を参考にすでに候補遺伝子の絞り込みを行っている段階である。
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| 今後の研究の推進方策 |
①引き続き全エクソーム解析の対象を選出し、順次DNA抽出を行う。トリオ解析に基づく全エクソーム解析を行い、デ・ノボおよび劣性遺伝モデルでの候補遺伝子を同定する。②並行して同患者のアレイCGHによる構造変異の解析も行う。③新規遺伝子の候補遺伝子を選定し機能解析を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
トリオ解析を行った家系数が十分でないため
トリオ解析家系数を増やし、併せてアレイCGHによる構造解析を進めていく。
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